RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.28■■■■■ 5.48
RABGGTA-210ENST00000559586 ABCC9O60706 1549 aa44.3■■■■■ 4.68
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.27■■■■■ 4.68
RABGGTA-210ENST00000559586 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.22■■■■■ 4.35
RABGGTA-210ENST00000559586 NACADO15069 1562 aa41.93■■■■■ 4.3
RABGGTA-210ENST00000559586 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.66■■■■■ 4.26
RABGGTA-210ENST00000559586 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.6■■■■■ 4.25
RABGGTA-210ENST00000559586 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.36■■■■■ 4.21
RABGGTA-210ENST00000559586 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.24■■■■■ 4.19
RABGGTA-210ENST00000559586 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.09■■■■■ 4.17
RABGGTA-210ENST00000559586 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.87■■■■■ 4.13
RABGGTA-210ENST00000559586 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
RABGGTA-210ENST00000559586 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.77■■■■■ 4.12
RABGGTA-210ENST00000559586 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.51■■■■■ 4.08
RABGGTA-210ENST00000559586 SCRIBQ14160 1630 aa40.24■■■■■ 4.03
RABGGTA-210ENST00000559586 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.02■■■■■ 4
RABGGTA-210ENST00000559586 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.97■■■■□ 3.99
RABGGTA-210ENST00000559586 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
RABGGTA-210ENST00000559586 NCAPD3P42695 1498 aa38.7■■■■□ 3.79
RABGGTA-210ENST00000559586 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.53■■■■□ 3.76
RABGGTA-210ENST00000559586 SMARCA2P51531 1590 aa38.47■■■■□ 3.75
RABGGTA-210ENST00000559586 SMARCA4P51532 1647 aa38.42■■■■□ 3.74
RABGGTA-210ENST00000559586 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.41■■■■□ 3.74
RABGGTA-210ENST00000559586 HMGXB3Q12766 1538 aa38.38■■■■□ 3.74
RABGGTA-210ENST00000559586 ERCC6Q03468 1493 aa38.35■■■■□ 3.73
RABGGTA-210ENST00000559586 CUX2O14529 1486 aa38.33■■■■□ 3.73
RABGGTA-210ENST00000559586 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
RABGGTA-210ENST00000559586 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.16■■■■□ 3.7
RABGGTA-210ENST00000559586 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.1■■■■□ 3.69
RABGGTA-210ENST00000559586 NESP48681 1621 aa37.99■■■■□ 3.67
RABGGTA-210ENST00000559586 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.91■■■■□ 3.66
RABGGTA-210ENST00000559586 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.83■■■■□ 3.65
RABGGTA-210ENST00000559586 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.68■■■■□ 3.62
RABGGTA-210ENST00000559586 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
RABGGTA-210ENST00000559586 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.53■■■■□ 3.6
RABGGTA-210ENST00000559586 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.48■■■■□ 3.59
RABGGTA-210ENST00000559586 WIZO95785 1651 aa37.42■■■■□ 3.58
RABGGTA-210ENST00000559586 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.28■■■■□ 3.56
RABGGTA-210ENST00000559586 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
RABGGTA-210ENST00000559586 WDR62O43379 1518 aa37.16■■■■□ 3.54
RABGGTA-210ENST00000559586 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.13■■■■□ 3.53
RABGGTA-210ENST00000559586 CFTRP13569 1480 aa37.06■■■■□ 3.52
RABGGTA-210ENST00000559586 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.06■■■■□ 3.52
RABGGTA-210ENST00000559586 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
RABGGTA-210ENST00000559586 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM41Q8WV44 630 aa36.62■■■■□ 3.45
RABGGTA-210ENST00000559586 OSCARQ8IYS5 282 aa36.61■■■■□ 3.45
RABGGTA-210ENST00000559586 PRDM2Q13029 1718 aa36.6■■■■□ 3.45
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.6■■■■□ 3.45
RABGGTA-210ENST00000559586 IFT140Q96RY7 1462 aa36.42■■■■□ 3.42
RABGGTA-210ENST00000559586 ABCC8Q09428 1581 aa36.38■■■■□ 3.41
RABGGTA-210ENST00000559586 TOPBP1Q92547 1522 aa36.33■■■■□ 3.41
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
RABGGTA-210ENST00000559586 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.2■■■■□ 3.39
RABGGTA-210ENST00000559586 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
RABGGTA-210ENST00000559586 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
RABGGTA-210ENST00000559586 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.99■■■■□ 3.35
RABGGTA-210ENST00000559586 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.99■■■■□ 3.35
RABGGTA-210ENST00000559586 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.99■■■■□ 3.35
RABGGTA-210ENST00000559586 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
RABGGTA-210ENST00000559586 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.95■■■■□ 3.354e-11■■■■■ 43.5
RABGGTA-210ENST00000559586 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGEF11O15085 1522 aa35.9■■■■□ 3.34
RABGGTA-210ENST00000559586 SOGA1O94964 1423 aa35.84■■■■□ 3.33
RABGGTA-210ENST00000559586 FBLN2P98095 1184 aa35.8■■■■□ 3.32
RABGGTA-210ENST00000559586 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.78■■■■□ 3.32
RABGGTA-210ENST00000559586 CHD1O14646 1710 aa35.77■■■■□ 3.32
RABGGTA-210ENST00000559586 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
RABGGTA-210ENST00000559586 WDR97A6NE52 1622 aa35.73■■■■□ 3.31
RABGGTA-210ENST00000559586 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.7■■■■□ 3.31
RABGGTA-210ENST00000559586 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.69■■■■□ 3.3
RABGGTA-210ENST00000559586 CUX1P39880 1505 aa35.63■■■■□ 3.29
RABGGTA-210ENST00000559586 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.58■■■■□ 3.29
RABGGTA-210ENST00000559586 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
RABGGTA-210ENST00000559586 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
RABGGTA-210ENST00000559586 GRIN2BQ13224 1484 aa35.54■■■■□ 3.28
RABGGTA-210ENST00000559586 ARAP1Q96P48 1450 aa35.52■■■■□ 3.28
RABGGTA-210ENST00000559586 SYNJ1O43426 1573 aa35.46■■■■□ 3.27
RABGGTA-210ENST00000559586 SYNJ2O15056 1496 aa35.43■■■■□ 3.26
RABGGTA-210ENST00000559586 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.42■■■■□ 3.26
RABGGTA-210ENST00000559586 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.39■■■■□ 3.26
RABGGTA-210ENST00000559586 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
RABGGTA-210ENST00000559586 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.34■■■■□ 3.25
RABGGTA-210ENST00000559586 PBRM1Q86U86 1689 aa35.28■■■■□ 3.24
RABGGTA-210ENST00000559586 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.23■■■■□ 3.23
RABGGTA-210ENST00000559586 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.23
RABGGTA-210ENST00000559586 TOP2BQ02880 1626 aa35.08■■■■□ 3.21
RABGGTA-210ENST00000559586 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.05■■■■□ 3.2
RABGGTA-210ENST00000559586 GRIN2AQ12879 1464 aa35.04■■■■□ 3.2
RABGGTA-210ENST00000559586 ADAMTS12P58397 1594 aa34.97■■■■□ 3.19
RABGGTA-210ENST00000559586 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.97■■■■□ 3.19
RABGGTA-210ENST00000559586 NUP160Q12769 1436 aa34.94■■■■□ 3.18
RABGGTA-210ENST00000559586 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.91■■■■□ 3.18
RABGGTA-210ENST00000559586 CEP170Q5SW79 1584 aa34.86■■■■□ 3.17
RABGGTA-210ENST00000559586 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.77■■■■□ 3.16
RABGGTA-210ENST00000559586 SHROOM2Q13796 1616 aa34.76■■■■□ 3.15
RABGGTA-210ENST00000559586 JPH4Q96JJ6 628 aa34.64■■■■□ 3.14
RABGGTA-210ENST00000559586 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
RABGGTA-210ENST00000559586 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.47■■■■□ 3.11
RABGGTA-210ENST00000559586 KIF27Q86VH2 1401 aa34.47■■■■□ 3.11
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