RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.77■■■□□ 2.84
MFGE8-208ENST00000558773 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.76■■■□□ 2.83
MFGE8-208ENST00000558773 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.75■■■□□ 2.83
MFGE8-208ENST00000558773 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.74■■■□□ 2.83
MFGE8-208ENST00000558773 CLIP1P30622 1438 aa32.74■■■□□ 2.83
MFGE8-208ENST00000558773 MADDQ8WXG6 1647 aa32.73■■■□□ 2.83
MFGE8-208ENST00000558773 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
MFGE8-208ENST00000558773 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.7■■■□□ 2.83
MFGE8-208ENST00000558773 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.67■■■□□ 2.82
MFGE8-208ENST00000558773 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.64■■■□□ 2.82
MFGE8-208ENST00000558773 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.62■■■□□ 2.81
MFGE8-208ENST00000558773 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.6■■■□□ 2.81
MFGE8-208ENST00000558773 ATP10AO60312 1499 aa32.6■■■□□ 2.81
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.59■■■□□ 2.81
MFGE8-208ENST00000558773 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
MFGE8-208ENST00000558773 AFAP1Q8N556 730 aa32.57■■■□□ 2.8
MFGE8-208ENST00000558773 KDM5CP41229 1560 aa32.55■■■□□ 2.8
MFGE8-208ENST00000558773 PREX2Q70Z35 1606 aa32.54■■■□□ 2.8
MFGE8-208ENST00000558773 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.53■■■□□ 2.8
MFGE8-208ENST00000558773 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
MFGE8-208ENST00000558773 MLECQ14165 292 aa32.49■■■□□ 2.79
MFGE8-208ENST00000558773 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.48■■■□□ 2.79
MFGE8-208ENST00000558773 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.48■■■□□ 2.79
MFGE8-208ENST00000558773 ABCC1P33527 1531 aa32.46■■■□□ 2.79
MFGE8-208ENST00000558773 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.46■■■□□ 2.79
MFGE8-208ENST00000558773 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.46■■■□□ 2.79
MFGE8-208ENST00000558773 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.44■■■□□ 2.78
MFGE8-208ENST00000558773 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.43■■■□□ 2.78
MFGE8-208ENST00000558773 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.41■■■□□ 2.78
MFGE8-208ENST00000558773 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.4■■■□□ 2.78
MFGE8-208ENST00000558773 REREQ9P2R6 1566 aa32.4■■■□□ 2.78
MFGE8-208ENST00000558773 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
MFGE8-208ENST00000558773 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.38■■■□□ 2.77
MFGE8-208ENST00000558773 ABCA6Q8N139 1617 aa32.37■■■□□ 2.77
MFGE8-208ENST00000558773 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.36■■■□□ 2.77
MFGE8-208ENST00000558773 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.32■■■□□ 2.77
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
MFGE8-208ENST00000558773 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.31■■■□□ 2.76
MFGE8-208ENST00000558773 AGLP35573 1532 aa32.3■■■□□ 2.76
MFGE8-208ENST00000558773 CEP162Q5TB80 1403 aa32.29■■■□□ 2.76
MFGE8-208ENST00000558773 HSPA2P54652 639 aa32.28■■■□□ 2.76
MFGE8-208ENST00000558773 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.28■■■□□ 2.76
MFGE8-208ENST00000558773 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.26■■■□□ 2.75
MFGE8-208ENST00000558773 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.25■■■□□ 2.75
MFGE8-208ENST00000558773 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
MFGE8-208ENST00000558773 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
MFGE8-208ENST00000558773 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.25■■■□□ 2.75
MFGE8-208ENST00000558773 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.24■■■□□ 2.75
MFGE8-208ENST00000558773 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.21■■■□□ 2.75
MFGE8-208ENST00000558773 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
MFGE8-208ENST00000558773 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.18■■■□□ 2.74
MFGE8-208ENST00000558773 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.16■■■□□ 2.74
MFGE8-208ENST00000558773 TIAM1Q13009 1591 aa32.15■■■□□ 2.74
MFGE8-208ENST00000558773 ATP7AQ04656 1500 aa32.11■■■□□ 2.73
MFGE8-208ENST00000558773 C3P01024 1663 aa32.11■■■□□ 2.73
MFGE8-208ENST00000558773 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
MFGE8-208ENST00000558773 FBXO41Q8TF61 875 aa32.1■■■□□ 2.73
MFGE8-208ENST00000558773 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
MFGE8-208ENST00000558773 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
MFGE8-208ENST00000558773 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.08■■■□□ 2.73
MFGE8-208ENST00000558773 MBD5Q9P267 1494 aa32.07■■■□□ 2.72
MFGE8-208ENST00000558773 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.07■■■□□ 2.72
MFGE8-208ENST00000558773 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.05■■■□□ 2.72
MFGE8-208ENST00000558773 PLXNC1O60486 1568 aa32.03■■■□□ 2.72
MFGE8-208ENST00000558773 A2MP01023 1474 aa32.03■■■□□ 2.72
MFGE8-208ENST00000558773 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
MFGE8-208ENST00000558773 NCOA2Q15596 1464 aa32.01■■■□□ 2.71
MFGE8-208ENST00000558773 MROH2AA6NES4 1674 aa31.97■■■□□ 2.71
MFGE8-208ENST00000558773 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.97■■■□□ 2.71
MFGE8-208ENST00000558773 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.96■■■□□ 2.71
MFGE8-208ENST00000558773 STRCQ7RTU9 1775 aa31.96■■■□□ 2.71
MFGE8-208ENST00000558773 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.95■■■□□ 2.7
MFGE8-208ENST00000558773 ZMYM3Q14202 1370 aa31.94■■■□□ 2.7
MFGE8-208ENST00000558773 NPATQ14207 1427 aa31.92■■■□□ 2.7
MFGE8-208ENST00000558773 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.91■■■□□ 2.7
MFGE8-208ENST00000558773 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.89■■■□□ 2.7
MFGE8-208ENST00000558773 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.89■■■□□ 2.7
MFGE8-208ENST00000558773 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.89■■■□□ 2.7
MFGE8-208ENST00000558773 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.89■■■□□ 2.7
MFGE8-208ENST00000558773 GGT6Q6P531 493 aa31.88■■■□□ 2.69
MFGE8-208ENST00000558773 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.87■■■□□ 2.69
MFGE8-208ENST00000558773 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
MFGE8-208ENST00000558773 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
MFGE8-208ENST00000558773 CERKQ8TCT0 537 aa31.86■■■□□ 2.69
MFGE8-208ENST00000558773 MAP3K1Q13233 1512 aa31.85■■■□□ 2.69
MFGE8-208ENST00000558773 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
MFGE8-208ENST00000558773 PTPRTO14522 1441 aa31.8■■■□□ 2.68
MFGE8-208ENST00000558773 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.8■■■□□ 2.68
MFGE8-208ENST00000558773 PTPRKQ15262 1439 aa31.79■■■□□ 2.68
MFGE8-208ENST00000558773 NCOA1Q15788 1441 aa31.76■■■□□ 2.68
MFGE8-208ENST00000558773 KIF3BO15066 747 aa31.73■■■□□ 2.67
MFGE8-208ENST00000558773 TSPY4P0CV99 314 aa31.73■■■□□ 2.67
MFGE8-208ENST00000558773 TSPY10P0CW01 314 aa31.73■■■□□ 2.67
MFGE8-208ENST00000558773 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.71■■■□□ 2.67
MFGE8-208ENST00000558773 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.69■■■□□ 2.66
MFGE8-208ENST00000558773 MIA2Q96PC5 1412 aa31.68■■■□□ 2.66
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
MFGE8-208ENST00000558773 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.66■■■□□ 2.66
MFGE8-208ENST00000558773 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms