RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.89■■□□□ 1.58
RABGGTA-205ENST00000558534 APLP2Q06481 763 aa24.89■■□□□ 1.58
RABGGTA-205ENST00000558534 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.89■■□□□ 1.57
RABGGTA-205ENST00000558534 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
RABGGTA-205ENST00000558534 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.88■■□□□ 1.57
RABGGTA-205ENST00000558534 RICTORQ6R327 1708 aa24.86■■□□□ 1.57
RABGGTA-205ENST00000558534 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.84■■□□□ 1.57
RABGGTA-205ENST00000558534 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.81■■□□□ 1.56
RABGGTA-205ENST00000558534 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.81■■□□□ 1.56
RABGGTA-205ENST00000558534 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.8■■□□□ 1.56
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.8■■□□□ 1.56
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.79■■□□□ 1.56
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.79■■□□□ 1.56
RABGGTA-205ENST00000558534 RAPGEF3O95398 923 aa24.79■■□□□ 1.56
RABGGTA-205ENST00000558534 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
RABGGTA-205ENST00000558534 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.78■■□□□ 1.56
RABGGTA-205ENST00000558534 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.78■■□□□ 1.56
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCC1P33527 1531 aa24.76■■□□□ 1.55
RABGGTA-205ENST00000558534 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
RABGGTA-205ENST00000558534 NCOA2Q15596 1464 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-205ENST00000558534 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-205ENST00000558534 KDM5CP41229 1560 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-205ENST00000558534 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.69■■□□□ 1.54
RABGGTA-205ENST00000558534 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.69■■□□□ 1.54
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
RABGGTA-205ENST00000558534 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.67■■□□□ 1.54
RABGGTA-205ENST00000558534 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
RABGGTA-205ENST00000558534 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.64■■□□□ 1.53
RABGGTA-205ENST00000558534 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-205ENST00000558534 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-205ENST00000558534 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-205ENST00000558534 MIA2Q96PC5 1412 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP10AO60312 1499 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-205ENST00000558534 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-205ENST00000558534 AFAP1Q8N556 730 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-205ENST00000558534 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-205ENST00000558534 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-205ENST00000558534 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-205ENST00000558534 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
RABGGTA-205ENST00000558534 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.56■■□□□ 1.52
RABGGTA-205ENST00000558534 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.55■■□□□ 1.52
RABGGTA-205ENST00000558534 REREQ9P2R6 1566 aa24.54■■□□□ 1.52
RABGGTA-205ENST00000558534 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.53■■□□□ 1.52
RABGGTA-205ENST00000558534 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
RABGGTA-205ENST00000558534 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
RABGGTA-205ENST00000558534 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.52■■□□□ 1.52
RABGGTA-205ENST00000558534 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.52■■□□□ 1.52
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.51■■□□□ 1.51
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.51■■□□□ 1.51
RABGGTA-205ENST00000558534 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.51■■□□□ 1.51
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP7AQ04656 1500 aa24.51■■□□□ 1.51
RABGGTA-205ENST00000558534 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCA6Q8N139 1617 aa24.5■■□□□ 1.51
RABGGTA-205ENST00000558534 MBD5Q9P267 1494 aa24.48■■□□□ 1.51
RABGGTA-205ENST00000558534 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.47■■□□□ 1.51
RABGGTA-205ENST00000558534 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.47■■□□□ 1.51
RABGGTA-205ENST00000558534 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.46■■□□□ 1.51
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
RABGGTA-205ENST00000558534 TSPY4P0CV99 314 aa24.44■■□□□ 1.5
RABGGTA-205ENST00000558534 TSPY10P0CW01 314 aa24.44■■□□□ 1.5
RABGGTA-205ENST00000558534 AGLP35573 1532 aa24.44■■□□□ 1.5
RABGGTA-205ENST00000558534 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.43■■□□□ 1.5
RABGGTA-205ENST00000558534 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.41■■□□□ 1.5
RABGGTA-205ENST00000558534 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.39■■□□□ 1.5
RABGGTA-205ENST00000558534 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.38■■□□□ 1.49
RABGGTA-205ENST00000558534 MADDQ8WXG6 1647 aa24.38■■□□□ 1.49
RABGGTA-205ENST00000558534 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.37■■□□□ 1.49
RABGGTA-205ENST00000558534 A2MP01023 1474 aa24.37■■□□□ 1.49
RABGGTA-205ENST00000558534 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RABGGTA-205ENST00000558534 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RABGGTA-205ENST00000558534 PLXNC1O60486 1568 aa24.34■■□□□ 1.49
RABGGTA-205ENST00000558534 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.34■■□□□ 1.49
RABGGTA-205ENST00000558534 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.33■■□□□ 1.49
RABGGTA-205ENST00000558534 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
RABGGTA-205ENST00000558534 PTPRMP28827 1452 aa24.32■■□□□ 1.48
RABGGTA-205ENST00000558534 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
RABGGTA-205ENST00000558534 MLECQ14165 292 aa24.31■■□□□ 1.48
RABGGTA-205ENST00000558534 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
RABGGTA-205ENST00000558534 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.27■■□□□ 1.48
RABGGTA-205ENST00000558534 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.26■■□□□ 1.47
RABGGTA-205ENST00000558534 DAPK1P53355 1430 aa24.25■■□□□ 1.47
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.24■■□□□ 1.47
RABGGTA-205ENST00000558534 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCC5O15440 1437 aa24.22■■□□□ 1.47
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
RABGGTA-205ENST00000558534 MROH2AA6NES4 1674 aa24.21■■□□□ 1.47
RABGGTA-205ENST00000558534 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.21■■□□□ 1.47
RABGGTA-205ENST00000558534 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.18■■□□□ 1.46
RABGGTA-205ENST00000558534 ERBINQ96RT1 1412 aa24.15■■□□□ 1.46
RABGGTA-205ENST00000558534 GGT6Q6P531 493 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-205ENST00000558534 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-205ENST00000558534 KIF15Q9NS87 1388 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-205ENST00000558534 KIF3BO15066 747 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-205ENST00000558534 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-205ENST00000558534 ADGRL2O95490 1459 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-205ENST00000558534 C3P01024 1663 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-205ENST00000558534 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms