RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557821.5

PLCB2-204, Transcript of phospholipase C beta 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLCB2, Length 4,517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2-204ENST00000557821 POGKQ9P215 609 aa25.58■■□□□ 1.68
PLCB2-204ENST00000557821 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.57■■□□□ 1.68
PLCB2-204ENST00000557821 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
PLCB2-204ENST00000557821 NESP48681 1621 aa25.56■■□□□ 1.68
PLCB2-204ENST00000557821 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PLCB2-204ENST00000557821 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PLCB2-204ENST00000557821 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.52■■□□□ 1.68
PLCB2-204ENST00000557821 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.52■■□□□ 1.68
PLCB2-204ENST00000557821 PTPRGP23470 1445 aa25.52■■□□□ 1.68
PLCB2-204ENST00000557821 KIF3BO15066 747 aa25.5■■□□□ 1.67
PLCB2-204ENST00000557821 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PLCB2-204ENST00000557821 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PLCB2-204ENST00000557821 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PLCB2-204ENST00000557821 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PLCB2-204ENST00000557821 NUDCQ9Y266 331 aa25.46■■□□□ 1.67
PLCB2-204ENST00000557821 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PLCB2-204ENST00000557821 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.44■■□□□ 1.66
PLCB2-204ENST00000557821 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.43■■□□□ 1.66
PLCB2-204ENST00000557821 RALBP1Q15311 655 aa25.43■■□□□ 1.66
PLCB2-204ENST00000557821 TOPBP1Q92547 1522 aa25.43■■□□□ 1.66
PLCB2-204ENST00000557821 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
PLCB2-204ENST00000557821 C14orf37Q86TY3 774 aa25.42■■□□□ 1.66
PLCB2-204ENST00000557821 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PLCB2-204ENST00000557821 MLECQ14165 292 aa25.42■■□□□ 1.66
PLCB2-204ENST00000557821 NCOA2Q15596 1464 aa25.41■■□□□ 1.66
PLCB2-204ENST00000557821 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.4■■□□□ 1.66
PLCB2-204ENST00000557821 UACAQ9BZF9 1416 aa25.39■■□□□ 1.66
PLCB2-204ENST00000557821 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
PLCB2-204ENST00000557821 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.39■■□□□ 1.65
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PLCB2-204ENST00000557821 MORC1Q86VD1 984 aa25.38■■□□□ 1.65
PLCB2-204ENST00000557821 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PLCB2-204ENST00000557821 GRIN2BQ13224 1484 aa25.37■■□□□ 1.65
PLCB2-204ENST00000557821 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
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PLCB2-204ENST00000557821 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.34■■□□□ 1.65
PLCB2-204ENST00000557821 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.34■■□□□ 1.65
PLCB2-204ENST00000557821 STK26Q9P289 416 aa25.34■■□□□ 1.65
PLCB2-204ENST00000557821 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.33■■□□□ 1.64
PLCB2-204ENST00000557821 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PLCB2-204ENST00000557821 RGS3P49796 1198 aa25.32■■□□□ 1.64
PLCB2-204ENST00000557821 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PLCB2-204ENST00000557821 NLRP13Q86W25 1043 aa25.3■■□□□ 1.64
PLCB2-204ENST00000557821 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.3■■□□□ 1.64
PLCB2-204ENST00000557821 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.29■■□□□ 1.64
PLCB2-204ENST00000557821 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.28■■□□□ 1.64
PLCB2-204ENST00000557821 USP47Q96K76 1375 aa25.27■■□□□ 1.64
PLCB2-204ENST00000557821 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.26■■□□□ 1.63
PLCB2-204ENST00000557821 ARXQ96QS3 562 aa25.25■■□□□ 1.63
PLCB2-204ENST00000557821 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.24■■□□□ 1.63
PLCB2-204ENST00000557821 TIAM1Q13009 1591 aa25.23■■□□□ 1.63
PLCB2-204ENST00000557821 PRDM2Q13029 1718 aa25.23■■□□□ 1.63
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PLCB2-204ENST00000557821 KIF15Q9NS87 1388 aa25.21■■□□□ 1.63
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PLCB2-204ENST00000557821 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.18■■□□□ 1.62
PLCB2-204ENST00000557821 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.16■■□□□ 1.62
PLCB2-204ENST00000557821 PANK3Q9H999 370 aa25.16■■□□□ 1.62
PLCB2-204ENST00000557821 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PLCB2-204ENST00000557821 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa25.15■■□□□ 1.62
PLCB2-204ENST00000557821 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.15■■□□□ 1.62
PLCB2-204ENST00000557821 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PLCB2-204ENST00000557821 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PLCB2-204ENST00000557821 MS4A1P11836 297 aa25.15■■□□□ 1.62
PLCB2-204ENST00000557821 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
PLCB2-204ENST00000557821 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.61
PLCB2-204ENST00000557821 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
PLCB2-204ENST00000557821 IFT140Q96RY7 1462 aa25.13■■□□□ 1.61
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PLCB2-204ENST00000557821 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.12■■□□□ 1.61
PLCB2-204ENST00000557821 CCDC7Q96M83 1385 aa25.11■■□□□ 1.61
PLCB2-204ENST00000557821 SOX12O15370 315 aa25.1■■□□□ 1.61
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PLCB2-204ENST00000557821 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.09■■□□□ 1.61
PLCB2-204ENST00000557821 HFM1A2PYH4 1435 aa25.09■■□□□ 1.61
PLCB2-204ENST00000557821 PDE3BQ13370 1112 aa25.09■■□□□ 1.61
PLCB2-204ENST00000557821 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.08■■□□□ 1.61
PLCB2-204ENST00000557821 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.06■■□□□ 1.6
PLCB2-204ENST00000557821 GOLGA2Q08379 1002 aa25.06■■□□□ 1.6
PLCB2-204ENST00000557821 MIA2Q96PC5 1412 aa25.06■■□□□ 1.6
PLCB2-204ENST00000557821 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.05■■□□□ 1.6
PLCB2-204ENST00000557821 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.05■■□□□ 1.6
PLCB2-204ENST00000557821 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PLCB2-204ENST00000557821 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PLCB2-204ENST00000557821 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PLCB2-204ENST00000557821 OSCARQ8IYS5 282 aa25.02■■□□□ 1.6
PLCB2-204ENST00000557821 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.02■■□□□ 1.6
PLCB2-204ENST00000557821 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
PLCB2-204ENST00000557821 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PLCB2-204ENST00000557821 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25■■□□□ 1.59
PLCB2-204ENST00000557821 SYNJ2O15056 1496 aa25■■□□□ 1.59
PLCB2-204ENST00000557821 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.98■■□□□ 1.59
PLCB2-204ENST00000557821 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.97■■□□□ 1.59
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