RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
RBM23-233	ENST00000557667	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		12.16	□□□□□ -0.46
RBM23-233	ENST00000557667	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		12.16	□□□□□ -0.46
RBM23-233	ENST00000557667	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
RBM23-233	ENST00000557667	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		12.15	□□□□□ -0.46
RBM23-233	ENST00000557667	NAIP	Q13075	1403 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	TONSL	Q96HA7	1378 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	FBLN2	P98095	1184 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	KCNA4	P22459	653 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	PREX2	Q70Z35	1606 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	TSPY4	P0CV99	314 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	TSPY10	P0CW01	314 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	ATP10B	O94823	1461 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	STAC3	Q96MF2	364 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-233	ENST00000557667	MAPKBP1	O60336	1514 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-233	ENST00000557667	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-233	ENST00000557667	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-233	ENST00000557667	ABCC5	O15440	1437 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-233	ENST00000557667	PLXNC1	O60486	1568 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-233	ENST00000557667	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-233	ENST00000557667	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-233	ENST00000557667	ITGAE	P38570	1179 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-233	ENST00000557667	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-233	ENST00000557667	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-233	ENST00000557667	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.48
RBM23-233	ENST00000557667	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	NCOA1	Q15788	1441 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	12	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	PLCH2	O75038	1416 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	TRIM52	Q96A61	297 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	UNC13B	O14795	1591 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-233	ENST00000557667	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	KANK1	Q14678	1352 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	PTPRK	Q15262	1439 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	CCER2	I3L3R5	266 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	ABCC1	P33527	1531 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	KIF15	Q9NS87	1388 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	MBD5	Q9P267	1494 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	ATP10A	O60312	1499 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RBM23-233	ENST00000557667	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	11.89	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	NEO1	Q92859	1461 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	LAMC1	P11047	1609 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	ANP32C	O43423	234 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	PZP	P20742	1482 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	NEUROD1	Q13562	356 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	NUP155	O75694	1391 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	GLI2	P10070	1586 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM23-233	ENST00000557667	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		11.8	□□□□□ -0.52

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