RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557636.5

TTLL5-221, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 5, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL5, Length 4,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL5-221	ENST00000557636	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL5-221	ENST00000557636	PBRM1	Q86U86	1689 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL5-221	ENST00000557636	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL5-221	ENST00000557636	UACA	Q9BZF9	1416 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL5-221	ENST00000557636	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL5-221	ENST00000557636	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL5-221	ENST00000557636	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
TTLL5-221	ENST00000557636	HFM1	A2PYH4	1435 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL5-221	ENST00000557636	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		13.83	□□□□□ -0.19
TTLL5-221	ENST00000557636	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	NAIP	Q13075	1403 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	NUP160	Q12769	1436 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	KIAA0556	O60303	1618 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	DISP1	Q96F81	1524 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	WDR97	A6NE52	1622 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	SAMD9	Q5K651	1589 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	KIF15	Q9NS87	1388 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	DAPK1	P53355	1430 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	KANK1	Q14678	1352 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	KIF3B	O15066	747 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		13.77	□□□□□ -0.2
TTLL5-221	ENST00000557636	GGT6	Q6P531	493 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	ARHGEF11	O15085	1522 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	ATP10B	O94823	1461 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	ABCC5	O15440	1437 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	BCAN	Q96GW7	911 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	CEP170	Q5SW79	1584 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	ROCK1	Q13464	1354 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TTLL5-221	ENST00000557636	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL5-221	ENST00000557636	KIF14	Q15058	1648 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL5-221	ENST00000557636	TMC1	Q8TDI8	760 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL5-221	ENST00000557636	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL5-221	ENST00000557636	AKNA	Q7Z591	1439 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL5-221	ENST00000557636	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TTLL5-221	ENST00000557636	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TTLL5-221	ENST00000557636	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL5-221	ENST00000557636	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL5-221	ENST00000557636	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL5-221	ENST00000557636	MLEC	Q14165	292 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL5-221	ENST00000557636	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TTLL5-221	ENST00000557636	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTLL5-221	ENST00000557636	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL5-221	ENST00000557636	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL5-221	ENST00000557636	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL5-221	ENST00000557636	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL5-221	ENST00000557636	CCER2	I3L3R5	266 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL5-221	ENST00000557636	MAPKBP1	O60336	1514 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL5-221	ENST00000557636	CDCA8	Q53HL2	280 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL5-221	ENST00000557636	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL5-221	ENST00000557636	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL5-221	ENST00000557636	TMF1	P82094	1093 aa		13.58	□□□□□ -0.23
TTLL5-221	ENST00000557636	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL5-221	ENST00000557636	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL5-221	ENST00000557636	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL5-221	ENST00000557636	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTLL5-221	ENST00000557636	FKBP8	Q14318	412 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL5-221	ENST00000557636	USP47	Q96K76	1375 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL5-221	ENST00000557636	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL5-221	ENST00000557636	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL5-221	ENST00000557636	ABCC2	Q92887	1545 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL5-221	ENST00000557636	RAPGEF3	O95398	923 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TTLL5-221	ENST00000557636	PLCH2	O75038	1416 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	CD109	Q6YHK3	1445 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	ABCA8	O94911	1581 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	CHD1	O14646	1710 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	ASXL2	Q76L83	1435 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	SLC24A1	O60721	1099 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	FANCA	O15360	1455 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	ADGRL1	O94910	1474 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	POGK	Q9P215	609 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL5-221	ENST00000557636	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	13.46	□□□□□ -0.25

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