RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548046.5

SLC25A3-209, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SLC25A3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-209ENST00000548046 KIF14Q15058 1648 aa22.99■■□□□ 1.27
SLC25A3-209ENST00000548046 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.98■■□□□ 1.27
SLC25A3-209ENST00000548046 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.98■■□□□ 1.27
SLC25A3-209ENST00000548046 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SLC25A3-209ENST00000548046 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.95■■□□□ 1.26
SLC25A3-209ENST00000548046 ATP10AO60312 1499 aa22.93■■□□□ 1.26
SLC25A3-209ENST00000548046 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.93■■□□□ 1.26
SLC25A3-209ENST00000548046 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.93■■□□□ 1.26
SLC25A3-209ENST00000548046 MADDQ8WXG6 1647 aa22.93■■□□□ 1.26
SLC25A3-209ENST00000548046 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.92■■□□□ 1.26
SLC25A3-209ENST00000548046 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.9■■□□□ 1.26
SLC25A3-209ENST00000548046 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.9■■□□□ 1.26
SLC25A3-209ENST00000548046 AFAP1Q8N556 730 aa22.88■■□□□ 1.25
SLC25A3-209ENST00000548046 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.87■■□□□ 1.25
SLC25A3-209ENST00000548046 MLECQ14165 292 aa22.87■■□□□ 1.25
SLC25A3-209ENST00000548046 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SLC25A3-209ENST00000548046 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
SLC25A3-209ENST00000548046 KDM5CP41229 1560 aa22.8■■□□□ 1.24
SLC25A3-209ENST00000548046 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.8■■□□□ 1.24
SLC25A3-209ENST00000548046 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.8■■□□□ 1.24
SLC25A3-209ENST00000548046 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.79■■□□□ 1.24
SLC25A3-209ENST00000548046 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.78■■□□□ 1.24
SLC25A3-209ENST00000548046 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.77■■□□□ 1.24
SLC25A3-209ENST00000548046 PREX2Q70Z35 1606 aa22.76■■□□□ 1.23
SLC25A3-209ENST00000548046 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SLC25A3-209ENST00000548046 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.76■■□□□ 1.23
SLC25A3-209ENST00000548046 REREQ9P2R6 1566 aa22.75■■□□□ 1.23
SLC25A3-209ENST00000548046 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.73■■□□□ 1.23
SLC25A3-209ENST00000548046 FBXO41Q8TF61 875 aa22.73■■□□□ 1.23
SLC25A3-209ENST00000548046 ABCC1P33527 1531 aa22.72■■□□□ 1.23
SLC25A3-209ENST00000548046 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.72■■□□□ 1.23
SLC25A3-209ENST00000548046 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SLC25A3-209ENST00000548046 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.72■■□□□ 1.23
SLC25A3-209ENST00000548046 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SLC25A3-209ENST00000548046 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.7■■□□□ 1.22
SLC25A3-209ENST00000548046 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.7■■□□□ 1.22
SLC25A3-209ENST00000548046 AGLP35573 1532 aa22.69■■□□□ 1.22
SLC25A3-209ENST00000548046 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SLC25A3-209ENST00000548046 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.69■■□□□ 1.22
SLC25A3-209ENST00000548046 HSPA2P54652 639 aa22.69■■□□□ 1.22
SLC25A3-209ENST00000548046 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC25A3-209ENST00000548046 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC25A3-209ENST00000548046 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SLC25A3-209ENST00000548046 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC25A3-209ENST00000548046 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC25A3-209ENST00000548046 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC25A3-209ENST00000548046 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SLC25A3-209ENST00000548046 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC25A3-209ENST00000548046 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
SLC25A3-209ENST00000548046 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SLC25A3-209ENST00000548046 ABCA6Q8N139 1617 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC25A3-209ENST00000548046 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC25A3-209ENST00000548046 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC25A3-209ENST00000548046 CEP162Q5TB80 1403 aa22.58■■□□□ 1.21
SLC25A3-209ENST00000548046 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.58■■□□□ 1.2
SLC25A3-209ENST00000548046 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.58■■□□□ 1.2
SLC25A3-209ENST00000548046 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.57■■□□□ 1.2
SLC25A3-209ENST00000548046 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.57■■□□□ 1.2
SLC25A3-209ENST00000548046 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.56■■□□□ 1.2
SLC25A3-209ENST00000548046 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC25A3-209ENST00000548046 CERKQ8TCT0 537 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A3-209ENST00000548046 ATP7AQ04656 1500 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A3-209ENST00000548046 A2MP01023 1474 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC25A3-209ENST00000548046 NPATQ14207 1427 aa22.49■■□□□ 1.19
SLC25A3-209ENST00000548046 ZMYM3Q14202 1370 aa22.49■■□□□ 1.19
SLC25A3-209ENST00000548046 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC25A3-209ENST00000548046 C3P01024 1663 aa22.47■■□□□ 1.19
SLC25A3-209ENST00000548046 GGT6Q6P531 493 aa22.45■■□□□ 1.18
SLC25A3-209ENST00000548046 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SLC25A3-209ENST00000548046 TIAM1Q13009 1591 aa22.45■■□□□ 1.18
SLC25A3-209ENST00000548046 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SLC25A3-209ENST00000548046 MBD5Q9P267 1494 aa22.44■■□□□ 1.18
SLC25A3-209ENST00000548046 PTPRTO14522 1441 aa22.43■■□□□ 1.18
SLC25A3-209ENST00000548046 MROH2AA6NES4 1674 aa22.42■■□□□ 1.18
SLC25A3-209ENST00000548046 PLXNC1O60486 1568 aa22.42■■□□□ 1.18
SLC25A3-209ENST00000548046 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SLC25A3-209ENST00000548046 TSPY4P0CV99 314 aa22.41■■□□□ 1.18
SLC25A3-209ENST00000548046 TSPY10P0CW01 314 aa22.41■■□□□ 1.18
SLC25A3-209ENST00000548046 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SLC25A3-209ENST00000548046 NCOA2Q15596 1464 aa22.4■■□□□ 1.18
SLC25A3-209ENST00000548046 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.39■■□□□ 1.17
SLC25A3-209ENST00000548046 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.39■■□□□ 1.17
SLC25A3-209ENST00000548046 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.37■■□□□ 1.17
SLC25A3-209ENST00000548046 STRCQ7RTU9 1775 aa22.36■■□□□ 1.17
SLC25A3-209ENST00000548046 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.35■■□□□ 1.17
SLC25A3-209ENST00000548046 NCOA1Q15788 1441 aa22.34■■□□□ 1.17
SLC25A3-209ENST00000548046 KIF3BO15066 747 aa22.33■■□□□ 1.17
SLC25A3-209ENST00000548046 PKD2Q13563 968 aa22.33■■□□□ 1.17
SLC25A3-209ENST00000548046 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.33■■□□□ 1.16
SLC25A3-209ENST00000548046 MAP3K1Q13233 1512 aa22.32■■□□□ 1.16
SLC25A3-209ENST00000548046 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.32■■□□□ 1.16
SLC25A3-209ENST00000548046 PTPRKQ15262 1439 aa22.31■■□□□ 1.16
SLC25A3-209ENST00000548046 APLP2Q06481 763 aa22.3■■□□□ 1.16
SLC25A3-209ENST00000548046 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.3■■□□□ 1.16
SLC25A3-209ENST00000548046 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SLC25A3-209ENST00000548046 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.29■■□□□ 1.16
SLC25A3-209ENST00000548046 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.27■■□□□ 1.16
SLC25A3-209ENST00000548046 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.27■■□□□ 1.16
SLC25A3-209ENST00000548046 PLA2R1Q13018 1463 aa22.27■■□□□ 1.16
SLC25A3-209ENST00000548046 MIA2Q96PC5 1412 aa22.26■■□□□ 1.15
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