RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.04■■■□□ 2.24
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COPS7A-216ENST00000543170 MBD5Q9P267 1494 aa28.68■■■□□ 2.18
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COPS7A-216ENST00000543170 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
COPS7A-216ENST00000543170 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.64■■■□□ 2.18
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COPS7A-216ENST00000543170 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.61■■■□□ 2.17
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COPS7A-216ENST00000543170 DAPK1P53355 1430 aa28.39■■■□□ 2.14
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COPS7A-216ENST00000543170 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.35■■■□□ 2.13
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COPS7A-216ENST00000543170 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.32■■■□□ 2.12
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COPS7A-216ENST00000543170 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
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COPS7A-216ENST00000543170 KIF15Q9NS87 1388 aa28.21■■■□□ 2.11
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COPS7A-216ENST00000543170 ERBINQ96RT1 1412 aa28.18■■■□□ 2.1
COPS7A-216ENST00000543170 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
COPS7A-216ENST00000543170 MROH2AA6NES4 1674 aa28.18■■■□□ 2.1
COPS7A-216ENST00000543170 NCOA1Q15788 1441 aa28.18■■■□□ 2.1
COPS7A-216ENST00000543170 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.15■■■□□ 2.1
COPS7A-216ENST00000543170 PTPRKQ15262 1439 aa28.14■■■□□ 2.1
COPS7A-216ENST00000543170 ROCK1Q13464 1354 aa28.12■■■□□ 2.09
COPS7A-216ENST00000543170 KIF3BO15066 747 aa28.11■■■□□ 2.09
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