RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542667.5

TM7SF3-211, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-211ENST00000542667 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.9■■□□□ 1.26
TM7SF3-211ENST00000542667 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.86■■□□□ 1.25
TM7SF3-211ENST00000542667 PREX2Q70Z35 1606 aa22.86■■□□□ 1.25
TM7SF3-211ENST00000542667 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.85■■□□□ 1.25
TM7SF3-211ENST00000542667 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.82■■□□□ 1.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TM7SF3-211ENST00000542667 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.82■■□□□ 1.24
TM7SF3-211ENST00000542667 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.82■■□□□ 1.24
TM7SF3-211ENST00000542667 AFAP1Q8N556 730 aa22.81■■□□□ 1.24
TM7SF3-211ENST00000542667 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.78■■□□□ 1.24
TM7SF3-211ENST00000542667 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3-211ENST00000542667 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.77■■□□□ 1.23
TM7SF3-211ENST00000542667 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3-211ENST00000542667 TIAM1Q13009 1591 aa22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3-211ENST00000542667 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3-211ENST00000542667 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3-211ENST00000542667 ABCC1P33527 1531 aa22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3-211ENST00000542667 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3-211ENST00000542667 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3-211ENST00000542667 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-211ENST00000542667 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3-211ENST00000542667 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.231e-6■■□□□ 13.1
TM7SF3-211ENST00000542667 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3-211ENST00000542667 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3-211ENST00000542667 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3-211ENST00000542667 KDM5CP41229 1560 aa22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3-211ENST00000542667 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3-211ENST00000542667 MLECQ14165 292 aa22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3-211ENST00000542667 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3-211ENST00000542667 NCOA2Q15596 1464 aa22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-211ENST00000542667 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-211ENST00000542667 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-211ENST00000542667 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3-211ENST00000542667 MADDQ8WXG6 1647 aa22.64■■□□□ 1.22
TM7SF3-211ENST00000542667 ATP10AO60312 1499 aa22.64■■□□□ 1.21
TM7SF3-211ENST00000542667 ABCA6Q8N139 1617 aa22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3-211ENST00000542667 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3-211ENST00000542667 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.61■■□□□ 1.21
TM7SF3-211ENST00000542667 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.61■■□□□ 1.21
TM7SF3-211ENST00000542667 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3-211ENST00000542667 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3-211ENST00000542667 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TM7SF3-211ENST00000542667 PTPRMP28827 1452 aa22.58■■□□□ 1.2
TM7SF3-211ENST00000542667 MAP3K1Q13233 1512 aa22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3-211ENST00000542667 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3-211ENST00000542667 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.56■■□□□ 1.2
TM7SF3-211ENST00000542667 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.54■■□□□ 1.2
TM7SF3-211ENST00000542667 APLP2Q06481 763 aa22.54■■□□□ 1.2
TM7SF3-211ENST00000542667 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.53■■□□□ 1.2
TM7SF3-211ENST00000542667 MBD5Q9P267 1494 aa22.53■■□□□ 1.2
TM7SF3-211ENST00000542667 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.51■■□□□ 1.19
TM7SF3-211ENST00000542667 ATP7AQ04656 1500 aa22.5■■□□□ 1.19
TM7SF3-211ENST00000542667 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TM7SF3-211ENST00000542667 REREQ9P2R6 1566 aa22.46■■□□□ 1.19
TM7SF3-211ENST00000542667 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TM7SF3-211ENST00000542667 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.44■■□□□ 1.18
TM7SF3-211ENST00000542667 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.41■■□□□ 1.18
TM7SF3-211ENST00000542667 AGLP35573 1532 aa22.41■■□□□ 1.18
TM7SF3-211ENST00000542667 A2MP01023 1474 aa22.4■■□□□ 1.18
TM7SF3-211ENST00000542667 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TM7SF3-211ENST00000542667 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3-211ENST00000542667 PLXNC1O60486 1568 aa22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3-211ENST00000542667 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3-211ENST00000542667 MIA2Q96PC5 1412 aa22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3-211ENST00000542667 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3-211ENST00000542667 GGT6Q6P531 493 aa22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3-211ENST00000542667 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3-211ENST00000542667 TSPY4P0CV99 314 aa22.33■■□□□ 1.17
TM7SF3-211ENST00000542667 TSPY10P0CW01 314 aa22.33■■□□□ 1.17
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TM7SF3-211ENST00000542667 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.32■■□□□ 1.16
TM7SF3-211ENST00000542667 C3P01024 1663 aa22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3-211ENST00000542667 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3-211ENST00000542667 HSPA2P54652 639 aa22.3■■□□□ 1.16
TM7SF3-211ENST00000542667 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.3■■□□□ 1.16
TM7SF3-211ENST00000542667 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TM7SF3-211ENST00000542667 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TM7SF3-211ENST00000542667 KIF3BO15066 747 aa22.27■■□□□ 1.16
TM7SF3-211ENST00000542667 ABCC5O15440 1437 aa22.25■■□□□ 1.15
TM7SF3-211ENST00000542667 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.25■■□□□ 1.15
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TM7SF3-211ENST00000542667 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TM7SF3-211ENST00000542667 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.23■■□□□ 1.15
TM7SF3-211ENST00000542667 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.23■■□□□ 1.15
TM7SF3-211ENST00000542667 ZMYM3Q14202 1370 aa22.22■■□□□ 1.15
TM7SF3-211ENST00000542667 DAPK1P53355 1430 aa22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3-211ENST00000542667 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3-211ENST00000542667 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.2■■□□□ 1.15
TM7SF3-211ENST00000542667 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3-211ENST00000542667 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3-211ENST00000542667 MROH2AA6NES4 1674 aa22.19■■□□□ 1.14
TM7SF3-211ENST00000542667 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3-211ENST00000542667 KIF15Q9NS87 1388 aa22.14■■□□□ 1.14
TM7SF3-211ENST00000542667 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.14■■□□□ 1.13
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