RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536244.5

KCTD20-210, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 20, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene KCTD20, Length 5,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD20-210ENST00000536244 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.01■■□□□ 1.27
KCTD20-210ENST00000536244 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
KCTD20-210ENST00000536244 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
KCTD20-210ENST00000536244 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.99■■□□□ 1.27
KCTD20-210ENST00000536244 RALBP1Q15311 655 aa22.99■■□□□ 1.27
KCTD20-210ENST00000536244 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
KCTD20-210ENST00000536244 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.97■■□□□ 1.27
KCTD20-210ENST00000536244 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.96■■□□□ 1.27
KCTD20-210ENST00000536244 NPHP1O15259 732 aa22.95■■□□□ 1.27
KCTD20-210ENST00000536244 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.95■■□□□ 1.26
KCTD20-210ENST00000536244 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
KCTD20-210ENST00000536244 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
KCTD20-210ENST00000536244 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
KCTD20-210ENST00000536244 TPM4P67936 248 aa22.93■■□□□ 1.26
KCTD20-210ENST00000536244 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.92■■□□□ 1.26
KCTD20-210ENST00000536244 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.92■■□□□ 1.26
KCTD20-210ENST00000536244 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.92■■□□□ 1.26
KCTD20-210ENST00000536244 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.91■■□□□ 1.26
KCTD20-210ENST00000536244 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.9■■□□□ 1.26
KCTD20-210ENST00000536244 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.9■■□□□ 1.26
KCTD20-210ENST00000536244 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.89■■□□□ 1.26
KCTD20-210ENST00000536244 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
KCTD20-210ENST00000536244 USP35Q9P2H5 1018 aa22.89■■□□□ 1.25
KCTD20-210ENST00000536244 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
KCTD20-210ENST00000536244 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
KCTD20-210ENST00000536244 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.88■■□□□ 1.25
KCTD20-210ENST00000536244 PDE3BQ13370 1112 aa22.86■■□□□ 1.25
KCTD20-210ENST00000536244 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
KCTD20-210ENST00000536244 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
KCTD20-210ENST00000536244 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
KCTD20-210ENST00000536244 HMMRO75330 724 aa22.81■■□□□ 1.24
KCTD20-210ENST00000536244 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.81■■□□□ 1.24
KCTD20-210ENST00000536244 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.8■■□□□ 1.24
KCTD20-210ENST00000536244 PHF14O94880 888 aa22.8■■□□□ 1.24
KCTD20-210ENST00000536244 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.8■■□□□ 1.24
KCTD20-210ENST00000536244 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
KCTD20-210ENST00000536244 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.78■■□□□ 1.24
KCTD20-210ENST00000536244 GPATCH3Q96I76 525 aa22.78■■□□□ 1.24
KCTD20-210ENST00000536244 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.77■■□□□ 1.24
KCTD20-210ENST00000536244 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
KCTD20-210ENST00000536244 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
KCTD20-210ENST00000536244 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
KCTD20-210ENST00000536244 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.75■■□□□ 1.23
KCTD20-210ENST00000536244 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
KCTD20-210ENST00000536244 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
KCTD20-210ENST00000536244 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.74■■□□□ 1.23
KCTD20-210ENST00000536244 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.74■■□□□ 1.23
KCTD20-210ENST00000536244 PKD2Q13563 968 aa22.73■■□□□ 1.23
KCTD20-210ENST00000536244 CLSTN1O94985 981 aa22.73■■□□□ 1.23
KCTD20-210ENST00000536244 STK31Q9BXU1 1019 aa22.73■■□□□ 1.23
KCTD20-210ENST00000536244 KIF3AQ9Y496 699 aa22.73■■□□□ 1.23
KCTD20-210ENST00000536244 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
KCTD20-210ENST00000536244 APBB1O00213 710 aa22.71■■□□□ 1.23
KCTD20-210ENST00000536244 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
KCTD20-210ENST00000536244 ST18O60284 1047 aa22.7■■□□□ 1.22
KCTD20-210ENST00000536244 NLRP13Q86W25 1043 aa22.7■■□□□ 1.22
KCTD20-210ENST00000536244 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.7■■□□□ 1.22
KCTD20-210ENST00000536244 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.69■■□□□ 1.22
KCTD20-210ENST00000536244 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.67■■□□□ 1.22
KCTD20-210ENST00000536244 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.67■■□□□ 1.22
KCTD20-210ENST00000536244 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
KCTD20-210ENST00000536244 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
KCTD20-210ENST00000536244 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
KCTD20-210ENST00000536244 NACADO15069 1562 aa22.64■■□□□ 1.22
KCTD20-210ENST00000536244 TPM3P06753 285 aa22.64■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.63■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.62■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 FMN1Q68DA7 1419 aa22.61■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.61■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.61■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.61■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.6■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 SOX12O15370 315 aa22.6■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 GORABQ5T7V8 394 aa22.6■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 KIF16BQ96L93 1317 aa22.6■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 CUX2O14529 1486 aa22.59■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
KCTD20-210ENST00000536244 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
KCTD20-210ENST00000536244 NUP155O75694 1391 aa22.56■■□□□ 1.2
KCTD20-210ENST00000536244 FAM161AQ3B820 660 aa22.55■■□□□ 1.2
KCTD20-210ENST00000536244 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
KCTD20-210ENST00000536244 ARID3AQ99856 593 aa22.53■■□□□ 1.2
KCTD20-210ENST00000536244 KIF15Q9NS87 1388 aa22.53■■□□□ 1.2
KCTD20-210ENST00000536244 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.53■■□□□ 1.2
KCTD20-210ENST00000536244 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
KCTD20-210ENST00000536244 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
KCTD20-210ENST00000536244 STK26Q9P289 416 aa22.52■■□□□ 1.2
KCTD20-210ENST00000536244 GSE1Q14687 1217 aa22.52■■□□□ 1.2
KCTD20-210ENST00000536244 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.52■■□□□ 1.2
KCTD20-210ENST00000536244 GPS2Q13227 327 aa22.51■■□□□ 1.19
KCTD20-210ENST00000536244 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
KCTD20-210ENST00000536244 CEP89Q96ST8 783 aa22.51■■□□□ 1.19
KCTD20-210ENST00000536244 SOGA1O94964 1423 aa22.5■■□□□ 1.19
KCTD20-210ENST00000536244 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.5■■□□□ 1.19
KCTD20-210ENST00000536244 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms