RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534626.6

RECQL4-208, Transcript of RecQ like helicase 4, humanhuman

TSL 5

Gene RECQL4, Length 1,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4-208ENST00000534626 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
RECQL4-208ENST00000534626 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
RECQL4-208ENST00000534626 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.37■■□□□ 1.97
RECQL4-208ENST00000534626 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.36■■□□□ 1.97
RECQL4-208ENST00000534626 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.36■■□□□ 1.97
RECQL4-208ENST00000534626 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.32■■□□□ 1.96
RECQL4-208ENST00000534626 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.31■■□□□ 1.96
RECQL4-208ENST00000534626 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.31■■□□□ 1.96
RECQL4-208ENST00000534626 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
RECQL4-208ENST00000534626 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
RECQL4-208ENST00000534626 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.27■■□□□ 1.96
RECQL4-208ENST00000534626 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.27■■□□□ 1.96
RECQL4-208ENST00000534626 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.25■■□□□ 1.95
RECQL4-208ENST00000534626 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.24■■□□□ 1.95
RECQL4-208ENST00000534626 ATP10AO60312 1499 aa27.24■■□□□ 1.95
RECQL4-208ENST00000534626 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.23■■□□□ 1.95
RECQL4-208ENST00000534626 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.22■■□□□ 1.95
RECQL4-208ENST00000534626 PREX2Q70Z35 1606 aa27.22■■□□□ 1.95
RECQL4-208ENST00000534626 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.2■■□□□ 1.95
RECQL4-208ENST00000534626 KDM5CP41229 1560 aa27.19■■□□□ 1.94
RECQL4-208ENST00000534626 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.19■■□□□ 1.94
RECQL4-208ENST00000534626 MLECQ14165 292 aa27.18■■□□□ 1.94
RECQL4-208ENST00000534626 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.16■■□□□ 1.94
RECQL4-208ENST00000534626 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.14■■□□□ 1.94
RECQL4-208ENST00000534626 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.13■■□□□ 1.93
RECQL4-208ENST00000534626 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.13■■□□□ 1.93
RECQL4-208ENST00000534626 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.12■■□□□ 1.93
RECQL4-208ENST00000534626 ABCC1P33527 1531 aa27.11■■□□□ 1.93
RECQL4-208ENST00000534626 AFAP1Q8N556 730 aa27.1■■□□□ 1.93
RECQL4-208ENST00000534626 REREQ9P2R6 1566 aa27.09■■□□□ 1.93
RECQL4-208ENST00000534626 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.09■■□□□ 1.93
RECQL4-208ENST00000534626 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.07■■□□□ 1.92
RECQL4-208ENST00000534626 ABCA6Q8N139 1617 aa27.05■■□□□ 1.92
RECQL4-208ENST00000534626 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.04■■□□□ 1.92
RECQL4-208ENST00000534626 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27■■□□□ 1.91
RECQL4-208ENST00000534626 HSPA2P54652 639 aa26.99■■□□□ 1.91
RECQL4-208ENST00000534626 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.97■■□□□ 1.91
RECQL4-208ENST00000534626 AGLP35573 1532 aa26.97■■□□□ 1.91
RECQL4-208ENST00000534626 FBXO41Q8TF61 875 aa26.97■■□□□ 1.91
RECQL4-208ENST00000534626 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
RECQL4-208ENST00000534626 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.96■■□□□ 1.91
RECQL4-208ENST00000534626 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
RECQL4-208ENST00000534626 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
RECQL4-208ENST00000534626 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
RECQL4-208ENST00000534626 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.94■■□□□ 1.9
RECQL4-208ENST00000534626 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.93■■□□□ 1.9
RECQL4-208ENST00000534626 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.93■■□□□ 1.9
RECQL4-208ENST00000534626 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.92■■□□□ 1.9
RECQL4-208ENST00000534626 C3P01024 1663 aa26.89■■□□□ 1.9
RECQL4-208ENST00000534626 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
RECQL4-208ENST00000534626 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
RECQL4-208ENST00000534626 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.89■■□□□ 1.89
RECQL4-208ENST00000534626 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
RECQL4-208ENST00000534626 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.86■■□□□ 1.89
RECQL4-208ENST00000534626 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.86■■□□□ 1.89
RECQL4-208ENST00000534626 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.86■■□□□ 1.89
RECQL4-208ENST00000534626 ATP7AQ04656 1500 aa26.85■■□□□ 1.89
RECQL4-208ENST00000534626 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
RECQL4-208ENST00000534626 CEP162Q5TB80 1403 aa26.82■■□□□ 1.88
RECQL4-208ENST00000534626 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
RECQL4-208ENST00000534626 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
RECQL4-208ENST00000534626 MROH2AA6NES4 1674 aa26.81■■□□□ 1.88
RECQL4-208ENST00000534626 TIAM1Q13009 1591 aa26.8■■□□□ 1.88
RECQL4-208ENST00000534626 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.79■■□□□ 1.88
RECQL4-208ENST00000534626 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.76■■□□□ 1.87
RECQL4-208ENST00000534626 STRCQ7RTU9 1775 aa26.76■■□□□ 1.87
RECQL4-208ENST00000534626 A2MP01023 1474 aa26.74■■□□□ 1.87
RECQL4-208ENST00000534626 PLXNC1O60486 1568 aa26.74■■□□□ 1.87
RECQL4-208ENST00000534626 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
RECQL4-208ENST00000534626 CERKQ8TCT0 537 aa26.7■■□□□ 1.86
RECQL4-208ENST00000534626 NPATQ14207 1427 aa26.7■■□□□ 1.86
RECQL4-208ENST00000534626 ZMYM3Q14202 1370 aa26.65■■□□□ 1.86
RECQL4-208ENST00000534626 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.64■■□□□ 1.85
RECQL4-208ENST00000534626 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
RECQL4-208ENST00000534626 NCOA2Q15596 1464 aa26.63■■□□□ 1.85
RECQL4-208ENST00000534626 MBD5Q9P267 1494 aa26.63■■□□□ 1.85
RECQL4-208ENST00000534626 PTPRTO14522 1441 aa26.63■■□□□ 1.85
RECQL4-208ENST00000534626 GGT6Q6P531 493 aa26.61■■□□□ 1.85
RECQL4-208ENST00000534626 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.61■■□□□ 1.85
RECQL4-208ENST00000534626 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.6■■□□□ 1.85
RECQL4-208ENST00000534626 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.6■■□□□ 1.85
RECQL4-208ENST00000534626 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.58■■□□□ 1.85
RECQL4-208ENST00000534626 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.57■■□□□ 1.84
RECQL4-208ENST00000534626 NCOA1Q15788 1441 aa26.57■■□□□ 1.84
RECQL4-208ENST00000534626 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.57■■□□□ 1.84
RECQL4-208ENST00000534626 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
RECQL4-208ENST00000534626 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.56■■□□□ 1.84
RECQL4-208ENST00000534626 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
RECQL4-208ENST00000534626 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.53■■□□□ 1.84
RECQL4-208ENST00000534626 PTPRKQ15262 1439 aa26.52■■□□□ 1.84
RECQL4-208ENST00000534626 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
RECQL4-208ENST00000534626 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.51■■□□□ 1.83
RECQL4-208ENST00000534626 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.5■■□□□ 1.83
RECQL4-208ENST00000534626 MAP3K1Q13233 1512 aa26.47■■□□□ 1.83
RECQL4-208ENST00000534626 PLA2R1Q13018 1463 aa26.47■■□□□ 1.83
RECQL4-208ENST00000534626 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.46■■□□□ 1.83
RECQL4-208ENST00000534626 KIF3BO15066 747 aa26.46■■□□□ 1.83
RECQL4-208ENST00000534626 TSPY4P0CV99 314 aa26.46■■□□□ 1.83
RECQL4-208ENST00000534626 TSPY10P0CW01 314 aa26.46■■□□□ 1.83
RECQL4-208ENST00000534626 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms