RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532389.5

SERGEF-220, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 5

Gene SERGEF, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-220ENST00000532389 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.92■■■■□ 3.02
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SERGEF-220ENST00000532389 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.89■■■■□ 3.02
SERGEF-220ENST00000532389 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.89■■■■□ 3.02
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SERGEF-220ENST00000532389 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.84■■■■□ 3.01
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SERGEF-220ENST00000532389 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.8■■■■□ 3
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SERGEF-220ENST00000532389 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.75■■■□□ 2.99
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SERGEF-220ENST00000532389 PREX2Q70Z35 1606 aa33.72■■■□□ 2.99
SERGEF-220ENST00000532389 ATP10AO60312 1499 aa33.72■■■□□ 2.99
SERGEF-220ENST00000532389 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.71■■■□□ 2.99
SERGEF-220ENST00000532389 AFAP1Q8N556 730 aa33.7■■■□□ 2.99
SERGEF-220ENST00000532389 CEP162Q5TB80 1403 aa33.68■■■□□ 2.98
SERGEF-220ENST00000532389 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.68■■■□□ 2.98
SERGEF-220ENST00000532389 MLECQ14165 292 aa33.66■■■□□ 2.98
SERGEF-220ENST00000532389 KDM5CP41229 1560 aa33.64■■■□□ 2.98
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SERGEF-220ENST00000532389 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.62■■■□□ 2.97
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SERGEF-220ENST00000532389 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa33.57■■■□□ 2.96
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SERGEF-220ENST00000532389 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
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SERGEF-220ENST00000532389 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
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SERGEF-220ENST00000532389 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa33.5■■■□□ 2.95
SERGEF-220ENST00000532389 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.49■■■□□ 2.95
SERGEF-220ENST00000532389 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.48■■■□□ 2.95
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SERGEF-220ENST00000532389 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.46■■■□□ 2.95
SERGEF-220ENST00000532389 ABCA6Q8N139 1617 aa33.44■■■□□ 2.94
SERGEF-220ENST00000532389 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.44■■■□□ 2.94
SERGEF-220ENST00000532389 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.43■■■□□ 2.94
SERGEF-220ENST00000532389 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.43■■■□□ 2.947e-7■■■□□ 17
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SERGEF-220ENST00000532389 TIAM1Q13009 1591 aa33.34■■■□□ 2.93
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SERGEF-220ENST00000532389 MBD5Q9P267 1494 aa33.18■■■□□ 2.9
SERGEF-220ENST00000532389 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.17■■■□□ 2.9
SERGEF-220ENST00000532389 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.16■■■□□ 2.9
SERGEF-220ENST00000532389 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.16■■■□□ 2.9
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SERGEF-220ENST00000532389 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.13■■■□□ 2.89
SERGEF-220ENST00000532389 C3P01024 1663 aa33.13■■■□□ 2.89
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SERGEF-220ENST00000532389 TSPY10P0CW01 314 aa33.05■■■□□ 2.88
SERGEF-220ENST00000532389 MROH2AA6NES4 1674 aa33.04■■■□□ 2.88
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SERGEF-220ENST00000532389 NPATQ14207 1427 aa33.01■■■□□ 2.87
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SERGEF-220ENST00000532389 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.94■■■□□ 2.86
SERGEF-220ENST00000532389 KIF3BO15066 747 aa32.93■■■□□ 2.86
SERGEF-220ENST00000532389 STRCQ7RTU9 1775 aa32.84■■■□□ 2.85
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SERGEF-220ENST00000532389 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.82■■■□□ 2.84
SERGEF-220ENST00000532389 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.81■■■□□ 2.84
SERGEF-220ENST00000532389 CERKQ8TCT0 537 aa32.81■■■□□ 2.84
SERGEF-220ENST00000532389 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.81■■■□□ 2.84
SERGEF-220ENST00000532389 PTPRTO14522 1441 aa32.79■■■□□ 2.84
SERGEF-220ENST00000532389 NCOA1Q15788 1441 aa32.77■■■□□ 2.84
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