RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530939.5

CHID1-217, Transcript of chitinase domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene CHID1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1-217ENST00000530939 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.56■■■■■ 4.4
CHID1-217ENST00000530939 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
CHID1-217ENST00000530939 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.54■■■■■ 4.4
CHID1-217ENST00000530939 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.54■■■■■ 4.4
CHID1-217ENST00000530939 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.51■■■■■ 4.39
CHID1-217ENST00000530939 PREX2Q70Z35 1606 aa42.49■■■■■ 4.39
CHID1-217ENST00000530939 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.46■■■■■ 4.39
CHID1-217ENST00000530939 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.45■■■■■ 4.39
CHID1-217ENST00000530939 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.45■■■■■ 4.39
CHID1-217ENST00000530939 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.45■■■■■ 4.39
CHID1-217ENST00000530939 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.43■■■■■ 4.38
CHID1-217ENST00000530939 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.43■■■■■ 4.38
CHID1-217ENST00000530939 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.36■■■■■ 4.37
CHID1-217ENST00000530939 MADDQ8WXG6 1647 aa42.33■■■■■ 4.37
CHID1-217ENST00000530939 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.32■■■■■ 4.37
CHID1-217ENST00000530939 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.32■■■■■ 4.37
CHID1-217ENST00000530939 AFAP1Q8N556 730 aa42.31■■■■■ 4.36
CHID1-217ENST00000530939 ABCC1P33527 1531 aa42.3■■■■■ 4.36
CHID1-217ENST00000530939 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.28■■■■■ 4.36
CHID1-217ENST00000530939 KDM5CP41229 1560 aa42.28■■■■■ 4.36
CHID1-217ENST00000530939 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.28■■■■■ 4.36
CHID1-217ENST00000530939 PTPRMP28827 1452 aa42.28■■■■■ 4.36
CHID1-217ENST00000530939 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.25■■■■■ 4.35
CHID1-217ENST00000530939 ATP10AO60312 1499 aa42.24■■■■■ 4.35
CHID1-217ENST00000530939 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
CHID1-217ENST00000530939 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
CHID1-217ENST00000530939 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
CHID1-217ENST00000530939 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.23■■■■■ 4.35
CHID1-217ENST00000530939 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.21■■■■■ 4.35
CHID1-217ENST00000530939 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.2■■■■■ 4.35
CHID1-217ENST00000530939 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.2■■■■■ 4.35
CHID1-217ENST00000530939 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.19■■■■■ 4.34
CHID1-217ENST00000530939 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.18■■■■■ 4.34
CHID1-217ENST00000530939 MLECQ14165 292 aa42.18■■■■■ 4.34
CHID1-217ENST00000530939 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.13■■■■■ 4.33
CHID1-217ENST00000530939 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.12■■■■■ 4.33
CHID1-217ENST00000530939 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.11■■■■■ 4.33
CHID1-217ENST00000530939 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.1■■■■■ 4.33
CHID1-217ENST00000530939 ABCA6Q8N139 1617 aa42.1■■■■■ 4.33
CHID1-217ENST00000530939 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.1■■■■■ 4.33
CHID1-217ENST00000530939 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.09■■■■■ 4.33
CHID1-217ENST00000530939 TIAM1Q13009 1591 aa42.07■■■■■ 4.33
CHID1-217ENST00000530939 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.05■■■■■ 4.32
CHID1-217ENST00000530939 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.04■■■■■ 4.32
CHID1-217ENST00000530939 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.03■■■■■ 4.32
CHID1-217ENST00000530939 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.01■■■■■ 4.32
CHID1-217ENST00000530939 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
CHID1-217ENST00000530939 REREQ9P2R6 1566 aa41.99■■■■■ 4.31
CHID1-217ENST00000530939 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.97■■■■■ 4.31
CHID1-217ENST00000530939 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
CHID1-217ENST00000530939 NCOA2Q15596 1464 aa41.93■■■■■ 4.3
CHID1-217ENST00000530939 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
CHID1-217ENST00000530939 AGLP35573 1532 aa41.85■■■■■ 4.29
CHID1-217ENST00000530939 ATP7AQ04656 1500 aa41.85■■■■■ 4.29
CHID1-217ENST00000530939 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.85■■■■■ 4.29
CHID1-217ENST00000530939 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
CHID1-217ENST00000530939 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.79■■■■■ 4.28
CHID1-217ENST00000530939 MAP3K1Q13233 1512 aa41.77■■■■■ 4.28
CHID1-217ENST00000530939 MBD5Q9P267 1494 aa41.76■■■■■ 4.28
CHID1-217ENST00000530939 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.73■■■■■ 4.27
CHID1-217ENST00000530939 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
CHID1-217ENST00000530939 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
CHID1-217ENST00000530939 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
CHID1-217ENST00000530939 A2MP01023 1474 aa41.68■■■■■ 4.26
CHID1-217ENST00000530939 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.67■■■■■ 4.26
CHID1-217ENST00000530939 PLXNC1O60486 1568 aa41.64■■■■■ 4.26
CHID1-217ENST00000530939 APLP2Q06481 763 aa41.64■■■■■ 4.26
CHID1-217ENST00000530939 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.64■■■■■ 4.26
CHID1-217ENST00000530939 C3P01024 1663 aa41.64■■■■■ 4.26
CHID1-217ENST00000530939 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.62■■■■■ 4.25
CHID1-217ENST00000530939 HSPA2P54652 639 aa41.62■■■■■ 4.25
CHID1-217ENST00000530939 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.6■■■■■ 4.25
CHID1-217ENST00000530939 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.56■■■■■ 4.24
CHID1-217ENST00000530939 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.56■■■■■ 4.24
CHID1-217ENST00000530939 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.54■■■■■ 4.24
CHID1-217ENST00000530939 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
CHID1-217ENST00000530939 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.52■■■■■ 4.24
CHID1-217ENST00000530939 MROH2AA6NES4 1674 aa41.5■■■■■ 4.23
CHID1-217ENST00000530939 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
CHID1-217ENST00000530939 GGT6Q6P531 493 aa41.49■■■■■ 4.23
CHID1-217ENST00000530939 TSPY4P0CV99 314 aa41.46■■■■■ 4.23
CHID1-217ENST00000530939 TSPY10P0CW01 314 aa41.46■■■■■ 4.23
CHID1-217ENST00000530939 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.45■■■■■ 4.23
CHID1-217ENST00000530939 MIA2Q96PC5 1412 aa41.45■■■■■ 4.23
CHID1-217ENST00000530939 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
CHID1-217ENST00000530939 ZMYM3Q14202 1370 aa41.39■■■■■ 4.22
CHID1-217ENST00000530939 KIF3BO15066 747 aa41.33■■■■■ 4.21
CHID1-217ENST00000530939 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.33■■■■■ 4.21
CHID1-217ENST00000530939 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.31■■■■■ 4.2
CHID1-217ENST00000530939 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.3■■■■■ 4.2
CHID1-217ENST00000530939 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
CHID1-217ENST00000530939 NPATQ14207 1427 aa41.28■■■■■ 4.2
CHID1-217ENST00000530939 STRCQ7RTU9 1775 aa41.22■■■■■ 4.19
CHID1-217ENST00000530939 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.2■■■■■ 4.19
CHID1-217ENST00000530939 PTPRKQ15262 1439 aa41.19■■■■■ 4.18
CHID1-217ENST00000530939 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.19■■■■■ 4.18
CHID1-217ENST00000530939 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.17■■■■■ 4.18
CHID1-217ENST00000530939 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.15■■■■■ 4.18
CHID1-217ENST00000530939 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.14■■■■■ 4.18
CHID1-217ENST00000530939 ABCC5O15440 1437 aa41.13■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.7 ms