RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530628.2

CDKN2A-210, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDKN2A, Length 748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-210ENST00000530628 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.15■■■■□ 3.38
CDKN2A-210ENST00000530628 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.14■■■■□ 3.38
CDKN2A-210ENST00000530628 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.14■■■■□ 3.38
CDKN2A-210ENST00000530628 KIF14Q15058 1648 aa36.12■■■■□ 3.37
CDKN2A-210ENST00000530628 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.12■■■■□ 3.37
CDKN2A-210ENST00000530628 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
CDKN2A-210ENST00000530628 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.08■■■■□ 3.37
CDKN2A-210ENST00000530628 CLIP1P30622 1438 aa36.08■■■■□ 3.37
CDKN2A-210ENST00000530628 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
CDKN2A-210ENST00000530628 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.02■■■■□ 3.36
CDKN2A-210ENST00000530628 MLECQ14165 292 aa36■■■■□ 3.35
CDKN2A-210ENST00000530628 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.98■■■■□ 3.35
CDKN2A-210ENST00000530628 ATP10AO60312 1499 aa35.98■■■■□ 3.35
CDKN2A-210ENST00000530628 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.97■■■■□ 3.35
CDKN2A-210ENST00000530628 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.97■■■■□ 3.35
CDKN2A-210ENST00000530628 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.95■■■■□ 3.35
CDKN2A-210ENST00000530628 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.94■■■■□ 3.34
CDKN2A-210ENST00000530628 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.94■■■■□ 3.34
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.94■■■■□ 3.34
CDKN2A-210ENST00000530628 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.94■■■■□ 3.34
CDKN2A-210ENST00000530628 AFAP1Q8N556 730 aa35.89■■■■□ 3.34
CDKN2A-210ENST00000530628 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.88■■■■□ 3.33
CDKN2A-210ENST00000530628 KDM5CP41229 1560 aa35.87■■■■□ 3.33
CDKN2A-210ENST00000530628 PREX2Q70Z35 1606 aa35.86■■■■□ 3.33
CDKN2A-210ENST00000530628 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.83■■■■□ 3.33
CDKN2A-210ENST00000530628 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.8■■■■□ 3.32
CDKN2A-210ENST00000530628 HSPA2P54652 639 aa35.8■■■■□ 3.32
CDKN2A-210ENST00000530628 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.77■■■■□ 3.32
CDKN2A-210ENST00000530628 FBXO41Q8TF61 875 aa35.77■■■■□ 3.32
CDKN2A-210ENST00000530628 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.76■■■■□ 3.32
CDKN2A-210ENST00000530628 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.75■■■■□ 3.31
CDKN2A-210ENST00000530628 ABCC1P33527 1531 aa35.75■■■■□ 3.31
CDKN2A-210ENST00000530628 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.74■■■■□ 3.31
CDKN2A-210ENST00000530628 REREQ9P2R6 1566 aa35.72■■■■□ 3.31
CDKN2A-210ENST00000530628 ABCA6Q8N139 1617 aa35.72■■■■□ 3.31
CDKN2A-210ENST00000530628 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.71■■■■□ 3.31
CDKN2A-210ENST00000530628 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
CDKN2A-210ENST00000530628 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.68■■■■□ 3.3
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
CDKN2A-210ENST00000530628 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.62■■■■□ 3.29
CDKN2A-210ENST00000530628 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
CDKN2A-210ENST00000530628 AGLP35573 1532 aa35.6■■■■□ 3.29
CDKN2A-210ENST00000530628 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
CDKN2A-210ENST00000530628 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.58■■■■□ 3.29
CDKN2A-210ENST00000530628 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.29
CDKN2A-210ENST00000530628 C3P01024 1663 aa35.53■■■■□ 3.28
CDKN2A-210ENST00000530628 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.52■■■■□ 3.28
CDKN2A-210ENST00000530628 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.51■■■■□ 3.28
CDKN2A-210ENST00000530628 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.5■■■■□ 3.27
CDKN2A-210ENST00000530628 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
CDKN2A-210ENST00000530628 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.5■■■■□ 3.27
CDKN2A-210ENST00000530628 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.5■■■■□ 3.27
CDKN2A-210ENST00000530628 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
CDKN2A-210ENST00000530628 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.46■■■■□ 3.27
CDKN2A-210ENST00000530628 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.44■■■■□ 3.26
CDKN2A-210ENST00000530628 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.42■■■■□ 3.26
CDKN2A-210ENST00000530628 STRCQ7RTU9 1775 aa35.42■■■■□ 3.26
CDKN2A-210ENST00000530628 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
CDKN2A-210ENST00000530628 CERKQ8TCT0 537 aa35.41■■■■□ 3.26
CDKN2A-210ENST00000530628 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.41■■■■□ 3.26
CDKN2A-210ENST00000530628 ATP7AQ04656 1500 aa35.4■■■■□ 3.26
CDKN2A-210ENST00000530628 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
CDKN2A-210ENST00000530628 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.35■■■■□ 3.25
CDKN2A-210ENST00000530628 MROH2AA6NES4 1674 aa35.34■■■■□ 3.25
CDKN2A-210ENST00000530628 CEP162Q5TB80 1403 aa35.33■■■■□ 3.25
CDKN2A-210ENST00000530628 TIAM1Q13009 1591 aa35.33■■■■□ 3.25
CDKN2A-210ENST00000530628 A2MP01023 1474 aa35.3■■■■□ 3.24
CDKN2A-210ENST00000530628 PLXNC1O60486 1568 aa35.27■■■■□ 3.24
CDKN2A-210ENST00000530628 ZMYM3Q14202 1370 aa35.26■■■■□ 3.24
CDKN2A-210ENST00000530628 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.26■■■■□ 3.23
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.23
CDKN2A-210ENST00000530628 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
CDKN2A-210ENST00000530628 NPATQ14207 1427 aa35.23■■■■□ 3.23
CDKN2A-210ENST00000530628 GGT6Q6P531 493 aa35.21■■■■□ 3.23
CDKN2A-210ENST00000530628 PTPRTO14522 1441 aa35.21■■■■□ 3.23
CDKN2A-210ENST00000530628 MBD5Q9P267 1494 aa35.2■■■■□ 3.23
CDKN2A-210ENST00000530628 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.15■■■■□ 3.22
CDKN2A-210ENST00000530628 NCOA1Q15788 1441 aa35.14■■■■□ 3.22
CDKN2A-210ENST00000530628 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.13■■■■□ 3.21
CDKN2A-210ENST00000530628 NCOA2Q15596 1464 aa35.12■■■■□ 3.21
CDKN2A-210ENST00000530628 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.11■■■■□ 3.21
CDKN2A-210ENST00000530628 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
CDKN2A-210ENST00000530628 PTPRKQ15262 1439 aa35.06■■■■□ 3.2
CDKN2A-210ENST00000530628 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.06■■■■□ 3.2
CDKN2A-210ENST00000530628 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.06■■■■□ 3.2
CDKN2A-210ENST00000530628 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.06■■■■□ 3.2
CDKN2A-210ENST00000530628 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.06■■■■□ 3.2
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
CDKN2A-210ENST00000530628 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
CDKN2A-210ENST00000530628 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.99■■■■□ 3.19
CDKN2A-210ENST00000530628 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.98■■■■□ 3.19
CDKN2A-210ENST00000530628 KIF3BO15066 747 aa34.98■■■■□ 3.19
CDKN2A-210ENST00000530628 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa34.98■■■■□ 3.19
CDKN2A-210ENST00000530628 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.98■■■■□ 3.19
CDKN2A-210ENST00000530628 PLA2R1Q13018 1463 aa34.94■■■■□ 3.18
CDKN2A-210ENST00000530628 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.94■■■■□ 3.18
CDKN2A-210ENST00000530628 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.94■■■■□ 3.18
CDKN2A-210ENST00000530628 TSPY4P0CV99 314 aa34.93■■■■□ 3.18
CDKN2A-210ENST00000530628 TSPY10P0CW01 314 aa34.93■■■■□ 3.18
CDKN2A-210ENST00000530628 PKD2Q13563 968 aa34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms