RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529893.5

GMDS-AS1-205, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 900 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-205ENST00000529893 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.48■■□□□ 1.99
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.47■■□□□ 1.99
GMDS-AS1-205ENST00000529893 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.47■■□□□ 1.99
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.46■■□□□ 1.99
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.42■■□□□ 1.98
GMDS-AS1-205ENST00000529893 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.42■■□□□ 1.98
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CLIP1P30622 1438 aa27.4■■□□□ 1.98
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.38■■□□□ 1.97
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.38■■□□□ 1.97
GMDS-AS1-205ENST00000529893 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.37■■□□□ 1.97
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PREX2Q70Z35 1606 aa27.36■■□□□ 1.97
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.35■■□□□ 1.97
GMDS-AS1-205ENST00000529893 KDM5CP41229 1560 aa27.35■■□□□ 1.97
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ATP10AO60312 1499 aa27.32■■□□□ 1.96
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.32■■□□□ 1.96
GMDS-AS1-205ENST00000529893 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.32■■□□□ 1.96
GMDS-AS1-205ENST00000529893 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.31■■□□□ 1.96
GMDS-AS1-205ENST00000529893 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.29■■□□□ 1.96
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.28■■□□□ 1.96
GMDS-AS1-205ENST00000529893 AFAP1Q8N556 730 aa27.27■■□□□ 1.96
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.26■■□□□ 1.96
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MLECQ14165 292 aa27.25■■□□□ 1.95
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ABCC1P33527 1531 aa27.25■■□□□ 1.95
GMDS-AS1-205ENST00000529893 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.24■■□□□ 1.95
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ABCA6Q8N139 1617 aa27.23■■□□□ 1.95
GMDS-AS1-205ENST00000529893 REREQ9P2R6 1566 aa27.2■■□□□ 1.94
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.19■■□□□ 1.94
GMDS-AS1-205ENST00000529893 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.19■■□□□ 1.94
GMDS-AS1-205ENST00000529893 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.18■■□□□ 1.94
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.17■■□□□ 1.94
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.14■■□□□ 1.94
GMDS-AS1-205ENST00000529893 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.12■■□□□ 1.93
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
GMDS-AS1-205ENST00000529893 HSPA2P54652 639 aa27.1■■□□□ 1.93
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.1■■□□□ 1.93
GMDS-AS1-205ENST00000529893 AGLP35573 1532 aa27.08■■□□□ 1.93
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.06■■□□□ 1.92
GMDS-AS1-205ENST00000529893 C3P01024 1663 aa27.06■■□□□ 1.92
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CEP162Q5TB80 1403 aa26.99■■□□□ 1.91
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.98■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-205ENST00000529893 TIAM1Q13009 1591 aa26.98■■□□□ 1.91
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.97■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-205ENST00000529893 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 STRCQ7RTU9 1775 aa26.97■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-205ENST00000529893 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.96■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.96■■□□□ 1.91
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 PLXNC1O60486 1568 aa26.91■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-205ENST00000529893 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.89■■□□□ 1.89
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.87■■□□□ 1.89
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 MBD5Q9P267 1494 aa26.85■■□□□ 1.89
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 A2MP01023 1474 aa26.84■■□□□ 1.89
GMDS-AS1-205ENST00000529893 NCOA2Q15596 1464 aa26.8■■□□□ 1.88
GMDS-AS1-205ENST00000529893 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.79■■□□□ 1.88
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ZMYM3Q14202 1370 aa26.76■■□□□ 1.87
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 NPATQ14207 1427 aa26.74■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CERKQ8TCT0 537 aa26.74■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.73■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-205ENST00000529893 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.72■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-205ENST00000529893 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.72■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.69■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.68■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PTPRTO14522 1441 aa26.68■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-205ENST00000529893 GGT6Q6P531 493 aa26.68■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-205ENST00000529893 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.68■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.67■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-205ENST00000529893 NCOA1Q15788 1441 aa26.66■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.66■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-205ENST00000529893 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PTPRKQ15262 1439 aa26.65■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.64■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MAP3K1Q13233 1512 aa26.62■■□□□ 1.85
GMDS-AS1-205ENST00000529893 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.62■■□□□ 1.85
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
GMDS-AS1-205ENST00000529893 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.58■■□□□ 1.85
GMDS-AS1-205ENST00000529893 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-205ENST00000529893 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.55■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.54■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-205ENST00000529893 KIF3BO15066 747 aa26.54■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-205ENST00000529893 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.53■■□□□ 1.84
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