RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529454.5

RPS6KA1-215, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1-215ENST00000529454 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.81■■□□□ 1.4
RPS6KA1-215ENST00000529454 KIF14Q15058 1648 aa23.81■■□□□ 1.4
RPS6KA1-215ENST00000529454 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.81■■□□□ 1.4
RPS6KA1-215ENST00000529454 CLIP1P30622 1438 aa23.81■■□□□ 1.4
RPS6KA1-215ENST00000529454 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.79■■□□□ 1.4
RPS6KA1-215ENST00000529454 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.77■■□□□ 1.4
RPS6KA1-215ENST00000529454 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
RPS6KA1-215ENST00000529454 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
RPS6KA1-215ENST00000529454 MLECQ14165 292 aa23.75■■□□□ 1.39
RPS6KA1-215ENST00000529454 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.75■■□□□ 1.39
RPS6KA1-215ENST00000529454 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.74■■□□□ 1.39
RPS6KA1-215ENST00000529454 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.7■■□□□ 1.38
RPS6KA1-215ENST00000529454 ATP10AO60312 1499 aa23.68■■□□□ 1.38
RPS6KA1-215ENST00000529454 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.68■■□□□ 1.38
RPS6KA1-215ENST00000529454 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.68■■□□□ 1.38
RPS6KA1-215ENST00000529454 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.68■■□□□ 1.38
RPS6KA1-215ENST00000529454 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.68■■□□□ 1.38
RPS6KA1-215ENST00000529454 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.67■■□□□ 1.38
RPS6KA1-215ENST00000529454 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.67■■□□□ 1.38
RPS6KA1-215ENST00000529454 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.64■■□□□ 1.37
RPS6KA1-215ENST00000529454 AFAP1Q8N556 730 aa23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA1-215ENST00000529454 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA1-215ENST00000529454 FBXO41Q8TF61 875 aa23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA1-215ENST00000529454 HSPA2P54652 639 aa23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA1-215ENST00000529454 PREX2Q70Z35 1606 aa23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA1-215ENST00000529454 KDM5CP41229 1560 aa23.58■■□□□ 1.37
RPS6KA1-215ENST00000529454 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.58■■□□□ 1.36
RPS6KA1-215ENST00000529454 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA1-215ENST00000529454 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA1-215ENST00000529454 ABCC1P33527 1531 aa23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA1-215ENST00000529454 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA1-215ENST00000529454 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA1-215ENST00000529454 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA1-215ENST00000529454 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA1-215ENST00000529454 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA1-215ENST00000529454 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA1-215ENST00000529454 ABCA6Q8N139 1617 aa23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA1-215ENST00000529454 REREQ9P2R6 1566 aa23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA1-215ENST00000529454 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA1-215ENST00000529454 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA1-215ENST00000529454 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.43■■□□□ 1.34
RPS6KA1-215ENST00000529454 AGLP35573 1532 aa23.41■■□□□ 1.34
RPS6KA1-215ENST00000529454 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.4■■□□□ 1.34
RPS6KA1-215ENST00000529454 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.4■■□□□ 1.34
RPS6KA1-215ENST00000529454 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RPS6KA1-215ENST00000529454 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.4■■□□□ 1.34
RPS6KA1-215ENST00000529454 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.39■■□□□ 1.34
RPS6KA1-215ENST00000529454 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
RPS6KA1-215ENST00000529454 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.39■■□□□ 1.33
RPS6KA1-215ENST00000529454 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RPS6KA1-215ENST00000529454 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.38■■□□□ 1.33
RPS6KA1-215ENST00000529454 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RPS6KA1-215ENST00000529454 C3P01024 1663 aa23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA1-215ENST00000529454 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA1-215ENST00000529454 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
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RPS6KA1-215ENST00000529454 CERKQ8TCT0 537 aa23.34■■□□□ 1.33
RPS6KA1-215ENST00000529454 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
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RPS6KA1-215ENST00000529454 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA1-215ENST00000529454 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA1-215ENST00000529454 STRCQ7RTU9 1775 aa23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA1-215ENST00000529454 MROH2AA6NES4 1674 aa23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA1-215ENST00000529454 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA1-215ENST00000529454 CEP162Q5TB80 1403 aa23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA1-215ENST00000529454 A2MP01023 1474 aa23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA1-215ENST00000529454 TIAM1Q13009 1591 aa23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA1-215ENST00000529454 GGT6Q6P531 493 aa23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA1-215ENST00000529454 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA1-215ENST00000529454 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA1-215ENST00000529454 NPATQ14207 1427 aa23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA1-215ENST00000529454 ZMYM3Q14202 1370 aa23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA1-215ENST00000529454 PLXNC1O60486 1568 aa23.18■■□□□ 1.3
RPS6KA1-215ENST00000529454 PTPRTO14522 1441 aa23.18■■□□□ 1.3
RPS6KA1-215ENST00000529454 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
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RPS6KA1-215ENST00000529454 NCOA1Q15788 1441 aa23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA1-215ENST00000529454 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA1-215ENST00000529454 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA1-215ENST00000529454 NCOA2Q15596 1464 aa23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA1-215ENST00000529454 MBD5Q9P267 1494 aa23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA1-215ENST00000529454 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA1-215ENST00000529454 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA1-215ENST00000529454 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA1-215ENST00000529454 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA1-215ENST00000529454 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA1-215ENST00000529454 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA1-215ENST00000529454 PTPRKQ15262 1439 aa23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA1-215ENST00000529454 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA1-215ENST00000529454 KIF3BO15066 747 aa23.05■■□□□ 1.28
RPS6KA1-215ENST00000529454 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.04■■□□□ 1.28
RPS6KA1-215ENST00000529454 TSPY4P0CV99 314 aa23.03■■□□□ 1.28
RPS6KA1-215ENST00000529454 TSPY10P0CW01 314 aa23.03■■□□□ 1.28
RPS6KA1-215ENST00000529454 PKD2Q13563 968 aa23.02■■□□□ 1.28
RPS6KA1-215ENST00000529454 VPS8Q8N3P4 1428 aa23■■□□□ 1.27
RPS6KA1-215ENST00000529454 PLA2R1Q13018 1463 aa23■■□□□ 1.27
RPS6KA1-215ENST00000529454 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23■■□□□ 1.27
RPS6KA1-215ENST00000529454 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.98■■□□□ 1.27
RPS6KA1-215ENST00000529454 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.98■■□□□ 1.27
RPS6KA1-215ENST00000529454 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.98■■□□□ 1.27
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