RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529454.5

RPS6KA1-215, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1-215ENST00000529454 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.21■■■■□ 3.39
RPS6KA1-215ENST00000529454 ABCC9O60706 1549 aa32.58■■■□□ 2.81
RPS6KA1-215ENST00000529454 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.56■■■□□ 2.8
RPS6KA1-215ENST00000529454 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.04■■■□□ 2.56
RPS6KA1-215ENST00000529454 NACADO15069 1562 aa30.78■■■□□ 2.52
RPS6KA1-215ENST00000529454 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.74■■■□□ 2.51
RPS6KA1-215ENST00000529454 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.45■■■□□ 2.47
RPS6KA1-215ENST00000529454 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.32■■■□□ 2.44
RPS6KA1-215ENST00000529454 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.28■■■□□ 2.44
RPS6KA1-215ENST00000529454 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.27■■■□□ 2.44
RPS6KA1-215ENST00000529454 BICRAQ9NZM4 1560 aa30■■■□□ 2.39
RPS6KA1-215ENST00000529454 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
RPS6KA1-215ENST00000529454 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.89■■■□□ 2.38
RPS6KA1-215ENST00000529454 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.68■■■□□ 2.34
RPS6KA1-215ENST00000529454 SCRIBQ14160 1630 aa29.68■■■□□ 2.34
RPS6KA1-215ENST00000529454 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.42■■■□□ 2.3
RPS6KA1-215ENST00000529454 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.36■■■□□ 2.29
RPS6KA1-215ENST00000529454 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
RPS6KA1-215ENST00000529454 NCAPD3P42695 1498 aa28.36■■■□□ 2.13
RPS6KA1-215ENST00000529454 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.28■■■□□ 2.12
RPS6KA1-215ENST00000529454 SMARCA4P51532 1647 aa28.28■■■□□ 2.12
RPS6KA1-215ENST00000529454 SMARCA2P51531 1590 aa28.27■■■□□ 2.12
RPS6KA1-215ENST00000529454 ERCC6Q03468 1493 aa28.21■■■□□ 2.11
RPS6KA1-215ENST00000529454 HMGXB3Q12766 1538 aa28.18■■■□□ 2.1
RPS6KA1-215ENST00000529454 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
RPS6KA1-215ENST00000529454 CUX2O14529 1486 aa28.09■■■□□ 2.09
RPS6KA1-215ENST00000529454 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
RPS6KA1-215ENST00000529454 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA1-215ENST00000529454 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.95■■■□□ 2.07
RPS6KA1-215ENST00000529454 NESP48681 1621 aa27.93■■■□□ 2.06
RPS6KA1-215ENST00000529454 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.89■■■□□ 2.05
RPS6KA1-215ENST00000529454 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.79■■■□□ 2.04
RPS6KA1-215ENST00000529454 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
RPS6KA1-215ENST00000529454 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.66■■■□□ 2.02
RPS6KA1-215ENST00000529454 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.62■■■□□ 2.01
RPS6KA1-215ENST00000529454 WIZO95785 1651 aa27.59■■■□□ 2.01
RPS6KA1-215ENST00000529454 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.53■■■□□ 2
RPS6KA1-215ENST00000529454 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.39■■□□□ 1.98
RPS6KA1-215ENST00000529454 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.31■■□□□ 1.96
RPS6KA1-215ENST00000529454 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
RPS6KA1-215ENST00000529454 WDR62O43379 1518 aa27.29■■□□□ 1.96
RPS6KA1-215ENST00000529454 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
RPS6KA1-215ENST00000529454 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.25■■□□□ 1.95
RPS6KA1-215ENST00000529454 CFTRP13569 1480 aa27.19■■□□□ 1.94
RPS6KA1-215ENST00000529454 PRDM2Q13029 1718 aa27.01■■□□□ 1.91
RPS6KA1-215ENST00000529454 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
RPS6KA1-215ENST00000529454 TRIM41Q8WV44 630 aa26.94■■□□□ 1.9
RPS6KA1-215ENST00000529454 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.91■■□□□ 1.9
RPS6KA1-215ENST00000529454 OSCARQ8IYS5 282 aa26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA1-215ENST00000529454 IFT140Q96RY7 1462 aa26.74■■□□□ 1.87
RPS6KA1-215ENST00000529454 ABCC8Q09428 1581 aa26.71■■□□□ 1.87
RPS6KA1-215ENST00000529454 TOPBP1Q92547 1522 aa26.7■■□□□ 1.87
RPS6KA1-215ENST00000529454 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
RPS6KA1-215ENST00000529454 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.63■■□□□ 1.85
RPS6KA1-215ENST00000529454 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
RPS6KA1-215ENST00000529454 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.46■■□□□ 1.83
RPS6KA1-215ENST00000529454 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.46■■□□□ 1.83
RPS6KA1-215ENST00000529454 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.46■■□□□ 1.83
RPS6KA1-215ENST00000529454 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
RPS6KA1-215ENST00000529454 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.822e-7■■■■■ 43
RPS6KA1-215ENST00000529454 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
RPS6KA1-215ENST00000529454 FBLN2P98095 1184 aa26.38■■□□□ 1.81
RPS6KA1-215ENST00000529454 CHD1O14646 1710 aa26.38■■□□□ 1.81
RPS6KA1-215ENST00000529454 ARHGEF11O15085 1522 aa26.36■■□□□ 1.81
RPS6KA1-215ENST00000529454 SOGA1O94964 1423 aa26.34■■□□□ 1.81
RPS6KA1-215ENST00000529454 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.33■■□□□ 1.81
RPS6KA1-215ENST00000529454 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
RPS6KA1-215ENST00000529454 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.28■■□□□ 1.8
RPS6KA1-215ENST00000529454 WDR97A6NE52 1622 aa26.24■■□□□ 1.79
RPS6KA1-215ENST00000529454 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.22■■□□□ 1.79
RPS6KA1-215ENST00000529454 CUX1P39880 1505 aa26.21■■□□□ 1.79
RPS6KA1-215ENST00000529454 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
RPS6KA1-215ENST00000529454 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.18■■□□□ 1.78
RPS6KA1-215ENST00000529454 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
RPS6KA1-215ENST00000529454 GRIN2BQ13224 1484 aa26.12■■□□□ 1.77
RPS6KA1-215ENST00000529454 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
RPS6KA1-215ENST00000529454 SYNJ1O43426 1573 aa26.09■■□□□ 1.77
RPS6KA1-215ENST00000529454 ARAP1Q96P48 1450 aa26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA1-215ENST00000529454 PBRM1Q86U86 1689 aa26.04■■□□□ 1.76
RPS6KA1-215ENST00000529454 SYNJ2O15056 1496 aa26.03■■□□□ 1.76
RPS6KA1-215ENST00000529454 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
RPS6KA1-215ENST00000529454 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.02■■□□□ 1.76
RPS6KA1-215ENST00000529454 CLASP1Q7Z460 1538 aa26■■□□□ 1.75
RPS6KA1-215ENST00000529454 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.96■■□□□ 1.75
RPS6KA1-215ENST00000529454 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA1-215ENST00000529454 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
RPS6KA1-215ENST00000529454 TOP2BQ02880 1626 aa25.82■■□□□ 1.72
RPS6KA1-215ENST00000529454 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.82■■□□□ 1.72
RPS6KA1-215ENST00000529454 GRIN2AQ12879 1464 aa25.77■■□□□ 1.72
RPS6KA1-215ENST00000529454 ADAMTS12P58397 1594 aa25.75■■□□□ 1.71
RPS6KA1-215ENST00000529454 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.69■■□□□ 1.7
RPS6KA1-215ENST00000529454 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.66■■□□□ 1.7
RPS6KA1-215ENST00000529454 CEP170Q5SW79 1584 aa25.65■■□□□ 1.7
RPS6KA1-215ENST00000529454 NUP160Q12769 1436 aa25.63■■□□□ 1.69
RPS6KA1-215ENST00000529454 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.58■■□□□ 1.69
RPS6KA1-215ENST00000529454 SHROOM2Q13796 1616 aa25.54■■□□□ 1.68
RPS6KA1-215ENST00000529454 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
RPS6KA1-215ENST00000529454 JPH4Q96JJ6 628 aa25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA1-215ENST00000529454 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA1-215ENST00000529454 KIF27Q86VH2 1401 aa25.37■■□□□ 1.65
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