RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529170.5

MKNK1-222, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1, human

TSL 4

Gene MKNK1, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKNK1-222	ENST00000529170	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
MKNK1-222	ENST00000529170	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
MKNK1-222	ENST00000529170	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MKNK1-222	ENST00000529170	EEA1	Q15075	1411 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MKNK1-222	ENST00000529170	ATP10A	O60312	1499 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MKNK1-222	ENST00000529170	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MKNK1-222	ENST00000529170	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MKNK1-222	ENST00000529170	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MKNK1-222	ENST00000529170	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MKNK1-222	ENST00000529170	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MKNK1-222	ENST00000529170	ILDR2	Q71H61	639 aa		13.93	□□□□□ -0.18
MKNK1-222	ENST00000529170	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
MKNK1-222	ENST00000529170	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MKNK1-222	ENST00000529170	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	STRC	Q7RTU9	1775 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	KIF14	Q15058	1648 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	KDM5C	P41229	1560 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		13.83	□□□□□ -0.19
MKNK1-222	ENST00000529170	PTPRT	O14522	1441 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MKNK1-222	ENST00000529170	SOCS7	O14512	581 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MKNK1-222	ENST00000529170	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		13.82	□□□□□ -0.2
MKNK1-222	ENST00000529170	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		13.82	□□□□□ -0.2
MKNK1-222	ENST00000529170	RERE	Q9P2R6	1566 aa		13.8	□□□□□ -0.2
MKNK1-222	ENST00000529170	ABCA6	Q8N139	1617 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MKNK1-222	ENST00000529170	CLIP1	P30622	1438 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MKNK1-222	ENST00000529170	AGL	P35573	1532 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MKNK1-222	ENST00000529170	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MKNK1-222	ENST00000529170	C3	P01024	1663 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MKNK1-222	ENST00000529170	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MKNK1-222	ENST00000529170	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MKNK1-222	ENST00000529170	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MKNK1-222	ENST00000529170	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MKNK1-222	ENST00000529170	ABCC1	P33527	1531 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MKNK1-222	ENST00000529170	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MKNK1-222	ENST00000529170	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MKNK1-222	ENST00000529170	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MKNK1-222	ENST00000529170	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MKNK1-222	ENST00000529170	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MKNK1-222	ENST00000529170	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MKNK1-222	ENST00000529170	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MKNK1-222	ENST00000529170	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MKNK1-222	ENST00000529170	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MKNK1-222	ENST00000529170	NPAT	Q14207	1427 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MKNK1-222	ENST00000529170	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
MKNK1-222	ENST00000529170	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MKNK1-222	ENST00000529170	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MKNK1-222	ENST00000529170	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
MKNK1-222	ENST00000529170	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MKNK1-222	ENST00000529170	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
MKNK1-222	ENST00000529170	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MKNK1-222	ENST00000529170	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MKNK1-222	ENST00000529170	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MKNK1-222	ENST00000529170	PKD2	Q13563	968 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MKNK1-222	ENST00000529170	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MKNK1-222	ENST00000529170	GGT6	Q6P531	493 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MKNK1-222	ENST00000529170	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MKNK1-222	ENST00000529170	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MKNK1-222	ENST00000529170	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MKNK1-222	ENST00000529170	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MKNK1-222	ENST00000529170	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MKNK1-222	ENST00000529170	A2M	P01023	1474 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MKNK1-222	ENST00000529170	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MKNK1-222	ENST00000529170	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MKNK1-222	ENST00000529170	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-222	ENST00000529170	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-222	ENST00000529170	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-222	ENST00000529170	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-222	ENST00000529170	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-222	ENST00000529170	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-222	ENST00000529170	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-222	ENST00000529170	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MKNK1-222	ENST00000529170	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MKNK1-222	ENST00000529170	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MKNK1-222	ENST00000529170	HSPA1L	P34931	641 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MKNK1-222	ENST00000529170	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MKNK1-222	ENST00000529170	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MKNK1-222	ENST00000529170	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MKNK1-222	ENST00000529170	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MKNK1-222	ENST00000529170	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MKNK1-222	ENST00000529170	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MKNK1-222	ENST00000529170	KIF3B	O15066	747 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MKNK1-222	ENST00000529170	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MKNK1-222	ENST00000529170	TNR	Q92752	1358 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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