RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 PREX2Q70Z35 1606 aa23.1■■□□□ 1.29
TSTA3-208ENST00000528920 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.08■■□□□ 1.29
TSTA3-208ENST00000528920 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.07■■□□□ 1.28
TSTA3-208ENST00000528920 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
TSTA3-208ENST00000528920 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.06■■□□□ 1.28
TSTA3-208ENST00000528920 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.05■■□□□ 1.28
TSTA3-208ENST00000528920 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TSTA3-208ENST00000528920 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TSTA3-208ENST00000528920 RICTORQ6R327 1708 aa23.02■■□□□ 1.28
TSTA3-208ENST00000528920 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.02■■□□□ 1.28
TSTA3-208ENST00000528920 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
TSTA3-208ENST00000528920 RAPGEF3O95398 923 aa23.01■■□□□ 1.27
TSTA3-208ENST00000528920 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.01■■□□□ 1.27
TSTA3-208ENST00000528920 APLP2Q06481 763 aa23■■□□□ 1.27
TSTA3-208ENST00000528920 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-208ENST00000528920 NCOA2Q15596 1464 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-208ENST00000528920 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-208ENST00000528920 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-208ENST00000528920 ABCC1P33527 1531 aa22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-208ENST00000528920 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-208ENST00000528920 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-208ENST00000528920 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-208ENST00000528920 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-208ENST00000528920 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.89■■□□□ 1.25
TSTA3-208ENST00000528920 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.87■■□□□ 1.25
TSTA3-208ENST00000528920 KDM5CP41229 1560 aa22.87■■□□□ 1.25
TSTA3-208ENST00000528920 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.86■■□□□ 1.25
TSTA3-208ENST00000528920 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.86■■□□□ 1.25
TSTA3-208ENST00000528920 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.85■■□□□ 1.25
TSTA3-208ENST00000528920 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.85■■□□□ 1.25
TSTA3-208ENST00000528920 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.85■■□□□ 1.25
TSTA3-208ENST00000528920 AFAP1Q8N556 730 aa22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-208ENST00000528920 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.83■■□□□ 1.25
TSTA3-208ENST00000528920 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-208ENST00000528920 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-208ENST00000528920 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
TSTA3-208ENST00000528920 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.81■■□□□ 1.24
TSTA3-208ENST00000528920 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.81■■□□□ 1.24
TSTA3-208ENST00000528920 PTPRMP28827 1452 aa22.8■■□□□ 1.24
TSTA3-208ENST00000528920 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.79■■□□□ 1.24
TSTA3-208ENST00000528920 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.79■■□□□ 1.24
TSTA3-208ENST00000528920 MIA2Q96PC5 1412 aa22.78■■□□□ 1.24
TSTA3-208ENST00000528920 MBD5Q9P267 1494 aa22.77■■□□□ 1.24
TSTA3-208ENST00000528920 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.75■■□□□ 1.23
TSTA3-208ENST00000528920 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.74■■□□□ 1.23
TSTA3-208ENST00000528920 ATP10AO60312 1499 aa22.73■■□□□ 1.23
TSTA3-208ENST00000528920 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.72■■□□□ 1.23
TSTA3-208ENST00000528920 ABCA6Q8N139 1617 aa22.72■■□□□ 1.23
TSTA3-208ENST00000528920 MADDQ8WXG6 1647 aa22.72■■□□□ 1.23
TSTA3-208ENST00000528920 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.72■■□□□ 1.23
TSTA3-208ENST00000528920 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TSTA3-208ENST00000528920 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.71■■□□□ 1.23
TSTA3-208ENST00000528920 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.7■■□□□ 1.22
TSTA3-208ENST00000528920 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.7■■□□□ 1.22
TSTA3-208ENST00000528920 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.69■■□□□ 1.22
TSTA3-208ENST00000528920 ATP7AQ04656 1500 aa22.69■■□□□ 1.22
TSTA3-208ENST00000528920 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.69■■□□□ 1.22
TSTA3-208ENST00000528920 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.69■■□□□ 1.22
TSTA3-208ENST00000528920 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.69■■□□□ 1.22
TSTA3-208ENST00000528920 REREQ9P2R6 1566 aa22.67■■□□□ 1.22
TSTA3-208ENST00000528920 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-208ENST00000528920 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TSTA3-208ENST00000528920 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.64■■□□□ 1.21
TSTA3-208ENST00000528920 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.63■■□□□ 1.21
TSTA3-208ENST00000528920 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TSTA3-208ENST00000528920 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.6■■□□□ 1.21
TSTA3-208ENST00000528920 FBXO41Q8TF61 875 aa22.6■■□□□ 1.21
TSTA3-208ENST00000528920 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.6■■□□□ 1.21
TSTA3-208ENST00000528920 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.59■■□□□ 1.21
TSTA3-208ENST00000528920 AGLP35573 1532 aa22.59■■□□□ 1.21
TSTA3-208ENST00000528920 TSPY4P0CV99 314 aa22.59■■□□□ 1.21
TSTA3-208ENST00000528920 TSPY10P0CW01 314 aa22.59■■□□□ 1.21
TSTA3-208ENST00000528920 MLECQ14165 292 aa22.58■■□□□ 1.21
TSTA3-208ENST00000528920 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TSTA3-208ENST00000528920 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.57■■□□□ 1.2
TSTA3-208ENST00000528920 A2MP01023 1474 aa22.56■■□□□ 1.2
TSTA3-208ENST00000528920 PLXNC1O60486 1568 aa22.55■■□□□ 1.2
TSTA3-208ENST00000528920 ABCC5O15440 1437 aa22.55■■□□□ 1.2
TSTA3-208ENST00000528920 HSPA2P54652 639 aa22.54■■□□□ 1.2
TSTA3-208ENST00000528920 DAPK1P53355 1430 aa22.53■■□□□ 1.2
TSTA3-208ENST00000528920 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.53■■□□□ 1.2
TSTA3-208ENST00000528920 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TSTA3-208ENST00000528920 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.5■■□□□ 1.19
TSTA3-208ENST00000528920 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TSTA3-208ENST00000528920 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-208ENST00000528920 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-208ENST00000528920 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-208ENST00000528920 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-208ENST00000528920 ADGRL2O95490 1459 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-208ENST00000528920 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.39■■□□□ 1.18
TSTA3-208ENST00000528920 KIF15Q9NS87 1388 aa22.39■■□□□ 1.18
TSTA3-208ENST00000528920 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-208ENST00000528920 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-208ENST00000528920 NCOA1Q15788 1441 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-208ENST00000528920 KIF3BO15066 747 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-208ENST00000528920 GGT6Q6P531 493 aa22.37■■□□□ 1.17
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