RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527303.1

PLEC-211, Transcript of plectin, humanhuman

TSL 3

Gene PLEC, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEC-211ENST00000527303 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.7■■■■□ 3.31
PLEC-211ENST00000527303 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.7■■■■□ 3.31
PLEC-211ENST00000527303 CLIP1P30622 1438 aa35.69■■■■□ 3.3
PLEC-211ENST00000527303 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.69■■■■□ 3.3
PLEC-211ENST00000527303 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.62■■■■□ 3.29
PLEC-211ENST00000527303 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
PLEC-211ENST00000527303 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.61■■■■□ 3.29
PLEC-211ENST00000527303 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.6■■■■□ 3.29
PLEC-211ENST00000527303 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
PLEC-211ENST00000527303 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.56■■■■□ 3.28
PLEC-211ENST00000527303 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.55■■■■□ 3.28
PLEC-211ENST00000527303 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.55■■■■□ 3.28
PLEC-211ENST00000527303 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
PLEC-211ENST00000527303 ATP10AO60312 1499 aa35.53■■■■□ 3.28
PLEC-211ENST00000527303 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.52■■■■□ 3.28
PLEC-211ENST00000527303 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.49■■■■□ 3.27
PLEC-211ENST00000527303 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.48■■■■□ 3.27
PLEC-211ENST00000527303 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.48■■■■□ 3.27
PLEC-211ENST00000527303 KDM5CP41229 1560 aa35.48■■■■□ 3.27
PLEC-211ENST00000527303 PREX2Q70Z35 1606 aa35.46■■■■□ 3.27
PLEC-211ENST00000527303 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.46■■■■□ 3.27
PLEC-211ENST00000527303 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.4■■■■□ 3.26
PLEC-211ENST00000527303 AFAP1Q8N556 730 aa35.38■■■■□ 3.25
PLEC-211ENST00000527303 MLECQ14165 292 aa35.37■■■■□ 3.25
PLEC-211ENST00000527303 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.37■■■■□ 3.25
PLEC-211ENST00000527303 REREQ9P2R6 1566 aa35.36■■■■□ 3.25
PLEC-211ENST00000527303 ABCC1P33527 1531 aa35.36■■■■□ 3.25
PLEC-211ENST00000527303 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.35■■■■□ 3.25
PLEC-211ENST00000527303 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.33■■■■□ 3.25
PLEC-211ENST00000527303 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.32■■■■□ 3.24
PLEC-211ENST00000527303 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.3■■■■□ 3.24
PLEC-211ENST00000527303 ABCA6Q8N139 1617 aa35.26■■■■□ 3.24
PLEC-211ENST00000527303 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.24■■■■□ 3.23
PLEC-211ENST00000527303 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.24■■■■□ 3.23
PLEC-211ENST00000527303 AGLP35573 1532 aa35.22■■■■□ 3.23
PLEC-211ENST00000527303 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.21■■■■□ 3.23
PLEC-211ENST00000527303 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.19■■■■□ 3.22
PLEC-211ENST00000527303 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
PLEC-211ENST00000527303 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
PLEC-211ENST00000527303 FBXO41Q8TF61 875 aa35.17■■■■□ 3.22
PLEC-211ENST00000527303 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.16■■■■□ 3.22
PLEC-211ENST00000527303 HSPA2P54652 639 aa35.15■■■■□ 3.22
PLEC-211ENST00000527303 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.12■■■■□ 3.21
PLEC-211ENST00000527303 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.1■■■■□ 3.21
PLEC-211ENST00000527303 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.1■■■■□ 3.21
PLEC-211ENST00000527303 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
PLEC-211ENST00000527303 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.09■■■■□ 3.21
PLEC-211ENST00000527303 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.08■■■■□ 3.21
PLEC-211ENST00000527303 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
PLEC-211ENST00000527303 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
PLEC-211ENST00000527303 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
PLEC-211ENST00000527303 C3P01024 1663 aa35.05■■■■□ 3.2
PLEC-211ENST00000527303 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
PLEC-211ENST00000527303 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.03■■■■□ 3.2
PLEC-211ENST00000527303 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.02■■■■□ 3.2
PLEC-211ENST00000527303 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.01■■■■□ 3.2
PLEC-211ENST00000527303 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35■■■■□ 3.193e-9■■■■■ 30.9
PLEC-211ENST00000527303 CEP162Q5TB80 1403 aa34.99■■■■□ 3.19
PLEC-211ENST00000527303 ATP7AQ04656 1500 aa34.98■■■■□ 3.19
PLEC-211ENST00000527303 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
PLEC-211ENST00000527303 MROH2AA6NES4 1674 aa34.95■■■■□ 3.19
PLEC-211ENST00000527303 TIAM1Q13009 1591 aa34.95■■■■□ 3.18
PLEC-211ENST00000527303 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.93■■■■□ 3.18
PLEC-211ENST00000527303 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
PLEC-211ENST00000527303 STRCQ7RTU9 1775 aa34.91■■■■□ 3.18
PLEC-211ENST00000527303 PLXNC1O60486 1568 aa34.9■■■■□ 3.18
PLEC-211ENST00000527303 A2MP01023 1474 aa34.88■■■■□ 3.17
PLEC-211ENST00000527303 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.88■■■■□ 3.17
PLEC-211ENST00000527303 NPATQ14207 1427 aa34.84■■■■□ 3.17
PLEC-211ENST00000527303 CERKQ8TCT0 537 aa34.82■■■■□ 3.16
PLEC-211ENST00000527303 MBD5Q9P267 1494 aa34.82■■■■□ 3.16
PLEC-211ENST00000527303 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.81■■■■□ 3.16
PLEC-211ENST00000527303 ZMYM3Q14202 1370 aa34.79■■■■□ 3.16
PLEC-211ENST00000527303 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.79■■■■□ 3.16
PLEC-211ENST00000527303 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
PLEC-211ENST00000527303 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
PLEC-211ENST00000527303 PTPRTO14522 1441 aa34.75■■■■□ 3.15
PLEC-211ENST00000527303 NCOA2Q15596 1464 aa34.74■■■■□ 3.15
PLEC-211ENST00000527303 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.74■■■■□ 3.15
PLEC-211ENST00000527303 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.69■■■■□ 3.14
PLEC-211ENST00000527303 GGT6Q6P531 493 aa34.68■■■■□ 3.14
PLEC-211ENST00000527303 NCOA1Q15788 1441 aa34.67■■■■□ 3.14
PLEC-211ENST00000527303 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.67■■■■□ 3.14
PLEC-211ENST00000527303 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
PLEC-211ENST00000527303 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.66■■■■□ 3.14
PLEC-211ENST00000527303 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
PLEC-211ENST00000527303 PTPRKQ15262 1439 aa34.62■■■■□ 3.13
PLEC-211ENST00000527303 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.62■■■■□ 3.13
PLEC-211ENST00000527303 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.61■■■■□ 3.13
PLEC-211ENST00000527303 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.61■■■■□ 3.13
PLEC-211ENST00000527303 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.6■■■■□ 3.13
PLEC-211ENST00000527303 MAP3K1Q13233 1512 aa34.6■■■■□ 3.13
PLEC-211ENST00000527303 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.6■■■■□ 3.13
PLEC-211ENST00000527303 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.55■■■■□ 3.12
PLEC-211ENST00000527303 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
PLEC-211ENST00000527303 PLA2R1Q13018 1463 aa34.53■■■■□ 3.12
PLEC-211ENST00000527303 TSPY4P0CV99 314 aa34.53■■■■□ 3.12
PLEC-211ENST00000527303 TSPY10P0CW01 314 aa34.53■■■■□ 3.12
PLEC-211ENST00000527303 KIF3BO15066 747 aa34.5■■■■□ 3.11
PLEC-211ENST00000527303 PKD2Q13563 968 aa34.49■■■■□ 3.11
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