RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527251.5

BBS1-212, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 3

Gene BBS1, Length 1,034 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1-212ENST00000527251 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.05■■■□□ 2.08
BBS1-212ENST00000527251 CLIP1P30622 1438 aa28.04■■■□□ 2.08
BBS1-212ENST00000527251 MADDQ8WXG6 1647 aa28.03■■■□□ 2.08
BBS1-212ENST00000527251 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.03■■■□□ 2.08
BBS1-212ENST00000527251 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.03■■■□□ 2.08
BBS1-212ENST00000527251 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
BBS1-212ENST00000527251 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.02■■■□□ 2.08
BBS1-212ENST00000527251 MAGI2Q86UL8 1455 aa28■■■□□ 2.07
BBS1-212ENST00000527251 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.98■■■□□ 2.07
BBS1-212ENST00000527251 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.96■■■□□ 2.07
BBS1-212ENST00000527251 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.96■■■□□ 2.07
BBS1-212ENST00000527251 MLECQ14165 292 aa27.94■■■□□ 2.06
BBS1-212ENST00000527251 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
BBS1-212ENST00000527251 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.91■■■□□ 2.06
BBS1-212ENST00000527251 AFAP1Q8N556 730 aa27.91■■■□□ 2.06
BBS1-212ENST00000527251 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.9■■■□□ 2.06
BBS1-212ENST00000527251 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.89■■■□□ 2.06
BBS1-212ENST00000527251 ATP10AO60312 1499 aa27.89■■■□□ 2.05
BBS1-212ENST00000527251 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.89■■■□□ 2.05
BBS1-212ENST00000527251 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.87■■■□□ 2.05
BBS1-212ENST00000527251 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.84■■■□□ 2.05
BBS1-212ENST00000527251 PREX2Q70Z35 1606 aa27.84■■■□□ 2.05
BBS1-212ENST00000527251 KDM5CP41229 1560 aa27.82■■■□□ 2.04
BBS1-212ENST00000527251 FBXO41Q8TF61 875 aa27.81■■■□□ 2.04
BBS1-212ENST00000527251 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.79■■■□□ 2.04
BBS1-212ENST00000527251 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.79■■■□□ 2.04
BBS1-212ENST00000527251 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.78■■■□□ 2.04
BBS1-212ENST00000527251 ABCC1P33527 1531 aa27.77■■■□□ 2.04
BBS1-212ENST00000527251 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.77■■■□□ 2.04
BBS1-212ENST00000527251 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.77■■■□□ 2.04
BBS1-212ENST00000527251 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
BBS1-212ENST00000527251 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.73■■■□□ 2.03
BBS1-212ENST00000527251 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.73■■■□□ 2.03
BBS1-212ENST00000527251 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.72■■■□□ 2.03
BBS1-212ENST00000527251 HSPA2P54652 639 aa27.71■■■□□ 2.03
BBS1-212ENST00000527251 ABCA6Q8N139 1617 aa27.7■■■□□ 2.03
BBS1-212ENST00000527251 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
BBS1-212ENST00000527251 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
BBS1-212ENST00000527251 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.67■■■□□ 2.02
BBS1-212ENST00000527251 CEP162Q5TB80 1403 aa27.67■■■□□ 2.02
BBS1-212ENST00000527251 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.66■■■□□ 2.02
BBS1-212ENST00000527251 REREQ9P2R6 1566 aa27.65■■■□□ 2.02
BBS1-212ENST00000527251 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.64■■■□□ 2.02
BBS1-212ENST00000527251 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.02
BBS1-212ENST00000527251 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
BBS1-212ENST00000527251 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.63■■■□□ 2.01
BBS1-212ENST00000527251 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.63■■■□□ 2.01
BBS1-212ENST00000527251 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
BBS1-212ENST00000527251 AGLP35573 1532 aa27.57■■■□□ 2
BBS1-212ENST00000527251 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
BBS1-212ENST00000527251 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.54■■■□□ 2
BBS1-212ENST00000527251 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.54■■■□□ 2
BBS1-212ENST00000527251 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.53■■■□□ 2
BBS1-212ENST00000527251 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.53■■■□□ 2
BBS1-212ENST00000527251 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.52■■■□□ 2
BBS1-212ENST00000527251 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
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BBS1-212ENST00000527251 C3P01024 1663 aa27.48■■□□□ 1.99
BBS1-212ENST00000527251 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.46■■□□□ 1.99
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BBS1-212ENST00000527251 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
BBS1-212ENST00000527251 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.42■■□□□ 1.98
BBS1-212ENST00000527251 A2MP01023 1474 aa27.41■■□□□ 1.98
BBS1-212ENST00000527251 NCOA2Q15596 1464 aa27.39■■□□□ 1.98
BBS1-212ENST00000527251 MBD5Q9P267 1494 aa27.39■■□□□ 1.98
BBS1-212ENST00000527251 PLXNC1O60486 1568 aa27.38■■□□□ 1.97
BBS1-212ENST00000527251 GGT6Q6P531 493 aa27.36■■□□□ 1.97
BBS1-212ENST00000527251 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.35■■□□□ 1.97
BBS1-212ENST00000527251 CERKQ8TCT0 537 aa27.35■■□□□ 1.97
BBS1-212ENST00000527251 STRCQ7RTU9 1775 aa27.35■■□□□ 1.97
BBS1-212ENST00000527251 ZMYM3Q14202 1370 aa27.35■■□□□ 1.97
BBS1-212ENST00000527251 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.33■■□□□ 1.97
BBS1-212ENST00000527251 MROH2AA6NES4 1674 aa27.32■■□□□ 1.96
BBS1-212ENST00000527251 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
BBS1-212ENST00000527251 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.31■■□□□ 1.96
BBS1-212ENST00000527251 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.31■■□□□ 1.96
BBS1-212ENST00000527251 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.3■■□□□ 1.96
BBS1-212ENST00000527251 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.28■■□□□ 1.96
BBS1-212ENST00000527251 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.27■■□□□ 1.96
BBS1-212ENST00000527251 NPATQ14207 1427 aa27.27■■□□□ 1.96
BBS1-212ENST00000527251 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
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BBS1-212ENST00000527251 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.24■■□□□ 1.95
BBS1-212ENST00000527251 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.22■■□□□ 1.95
BBS1-212ENST00000527251 KIF3BO15066 747 aa27.2■■□□□ 1.94
BBS1-212ENST00000527251 PTPRKQ15262 1439 aa27.19■■□□□ 1.94
BBS1-212ENST00000527251 NCOA1Q15788 1441 aa27.18■■□□□ 1.94
BBS1-212ENST00000527251 TSPY4P0CV99 314 aa27.18■■□□□ 1.94
BBS1-212ENST00000527251 TSPY10P0CW01 314 aa27.18■■□□□ 1.94
BBS1-212ENST00000527251 PTPRTO14522 1441 aa27.17■■□□□ 1.94
BBS1-212ENST00000527251 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.17■■□□□ 1.94
BBS1-212ENST00000527251 MAP3K1Q13233 1512 aa27.16■■□□□ 1.94
BBS1-212ENST00000527251 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.16■■□□□ 1.94
BBS1-212ENST00000527251 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.14■■□□□ 1.94
BBS1-212ENST00000527251 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.12■■□□□ 1.93
BBS1-212ENST00000527251 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.09■■□□□ 1.93
BBS1-212ENST00000527251 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.09■■□□□ 1.93
BBS1-212ENST00000527251 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
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