RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527225.1

SPCS2-204, Transcript of signal peptidase complex subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPCS2, Length 321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2-204ENST00000527225 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.48■■□□□ 1.99
SPCS2-204ENST00000527225 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.48■■□□□ 1.99
SPCS2-204ENST00000527225 PREX2Q70Z35 1606 aa27.46■■□□□ 1.99
SPCS2-204ENST00000527225 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.45■■□□□ 1.98
SPCS2-204ENST00000527225 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.44■■□□□ 1.98
SPCS2-204ENST00000527225 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.43■■□□□ 1.98
SPCS2-204ENST00000527225 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.42■■□□□ 1.98
SPCS2-204ENST00000527225 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.41■■□□□ 1.98
SPCS2-204ENST00000527225 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.38■■□□□ 1.97
SPCS2-204ENST00000527225 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.38■■□□□ 1.97
SPCS2-204ENST00000527225 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.35■■□□□ 1.97
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.35■■□□□ 1.97
SPCS2-204ENST00000527225 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SPCS2-204ENST00000527225 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.34■■□□□ 1.97
SPCS2-204ENST00000527225 ABCC1P33527 1531 aa27.32■■□□□ 1.96
SPCS2-204ENST00000527225 KDM5CP41229 1560 aa27.32■■□□□ 1.96
SPCS2-204ENST00000527225 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.31■■□□□ 1.96
SPCS2-204ENST00000527225 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.3■■□□□ 1.96
SPCS2-204ENST00000527225 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SPCS2-204ENST00000527225 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.29■■□□□ 1.96
SPCS2-204ENST00000527225 AFAP1Q8N556 730 aa27.28■■□□□ 1.96
SPCS2-204ENST00000527225 MADDQ8WXG6 1647 aa27.27■■□□□ 1.96
SPCS2-204ENST00000527225 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.26■■□□□ 1.96
SPCS2-204ENST00000527225 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.26■■□□□ 1.96
SPCS2-204ENST00000527225 ATP10AO60312 1499 aa27.26■■□□□ 1.95
SPCS2-204ENST00000527225 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.24■■□□□ 1.95
SPCS2-204ENST00000527225 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.24■■□□□ 1.95
SPCS2-204ENST00000527225 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.24■■□□□ 1.95
SPCS2-204ENST00000527225 PTPRMP28827 1452 aa27.23■■□□□ 1.95
SPCS2-204ENST00000527225 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.23■■□□□ 1.95
SPCS2-204ENST00000527225 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.23■■□□□ 1.95
SPCS2-204ENST00000527225 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.21■■□□□ 1.95
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
SPCS2-204ENST00000527225 TIAM1Q13009 1591 aa27.2■■□□□ 1.94
SPCS2-204ENST00000527225 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
SPCS2-204ENST00000527225 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
SPCS2-204ENST00000527225 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.19■■□□□ 1.94
SPCS2-204ENST00000527225 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.18■■□□□ 1.94
SPCS2-204ENST00000527225 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
SPCS2-204ENST00000527225 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.17■■□□□ 1.94
SPCS2-204ENST00000527225 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.17■■□□□ 1.94
SPCS2-204ENST00000527225 ABCA6Q8N139 1617 aa27.16■■□□□ 1.94
SPCS2-204ENST00000527225 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.16■■□□□ 1.94
SPCS2-204ENST00000527225 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.15■■□□□ 1.94
SPCS2-204ENST00000527225 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.15■■□□□ 1.94
SPCS2-204ENST00000527225 REREQ9P2R6 1566 aa27.14■■□□□ 1.94
SPCS2-204ENST00000527225 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
SPCS2-204ENST00000527225 MLECQ14165 292 aa27.11■■□□□ 1.93
SPCS2-204ENST00000527225 NCOA2Q15596 1464 aa27.1■■□□□ 1.93
SPCS2-204ENST00000527225 MAP3K1Q13233 1512 aa27.09■■□□□ 1.93
SPCS2-204ENST00000527225 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.07■■□□□ 1.92
SPCS2-204ENST00000527225 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SPCS2-204ENST00000527225 AGLP35573 1532 aa27.05■■□□□ 1.92
SPCS2-204ENST00000527225 ATP7AQ04656 1500 aa27.03■■□□□ 1.92
SPCS2-204ENST00000527225 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SPCS2-204ENST00000527225 MBD5Q9P267 1494 aa27■■□□□ 1.91
SPCS2-204ENST00000527225 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.96■■□□□ 1.91
SPCS2-204ENST00000527225 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SPCS2-204ENST00000527225 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.95■■□□□ 1.9
SPCS2-204ENST00000527225 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.94■■□□□ 1.9
SPCS2-204ENST00000527225 APLP2Q06481 763 aa26.92■■□□□ 1.9
SPCS2-204ENST00000527225 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.92■■□□□ 1.9
SPCS2-204ENST00000527225 A2MP01023 1474 aa26.91■■□□□ 1.9
SPCS2-204ENST00000527225 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.91■■□□□ 1.9
SPCS2-204ENST00000527225 PLXNC1O60486 1568 aa26.91■■□□□ 1.9
SPCS2-204ENST00000527225 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.9■■□□□ 1.9
SPCS2-204ENST00000527225 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.89■■□□□ 1.9
SPCS2-204ENST00000527225 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SPCS2-204ENST00000527225 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.88■■□□□ 1.89
SPCS2-204ENST00000527225 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SPCS2-204ENST00000527225 C3P01024 1663 aa26.86■■□□□ 1.89
SPCS2-204ENST00000527225 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.85■■□□□ 1.89
SPCS2-204ENST00000527225 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SPCS2-204ENST00000527225 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.84■■□□□ 1.89
SPCS2-204ENST00000527225 MIA2Q96PC5 1412 aa26.83■■□□□ 1.89
SPCS2-204ENST00000527225 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.83■■□□□ 1.89
SPCS2-204ENST00000527225 MROH2AA6NES4 1674 aa26.81■■□□□ 1.88
SPCS2-204ENST00000527225 TSPY4P0CV99 314 aa26.78■■□□□ 1.88
SPCS2-204ENST00000527225 TSPY10P0CW01 314 aa26.78■■□□□ 1.88
SPCS2-204ENST00000527225 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SPCS2-204ENST00000527225 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SPCS2-204ENST00000527225 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.75■■□□□ 1.87
SPCS2-204ENST00000527225 HSPA2P54652 639 aa26.74■■□□□ 1.87
SPCS2-204ENST00000527225 GGT6Q6P531 493 aa26.73■■□□□ 1.87
SPCS2-204ENST00000527225 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.71■■□□□ 1.87
SPCS2-204ENST00000527225 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.71■■□□□ 1.87
SPCS2-204ENST00000527225 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.71■■□□□ 1.87
SPCS2-204ENST00000527225 ZMYM3Q14202 1370 aa26.7■■□□□ 1.86
SPCS2-204ENST00000527225 NPATQ14207 1427 aa26.66■■□□□ 1.86
SPCS2-204ENST00000527225 KIF3BO15066 747 aa26.66■■□□□ 1.86
SPCS2-204ENST00000527225 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.65■■□□□ 1.86
SPCS2-204ENST00000527225 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.65■■□□□ 1.86
SPCS2-204ENST00000527225 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SPCS2-204ENST00000527225 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.62■■□□□ 1.85
SPCS2-204ENST00000527225 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SPCS2-204ENST00000527225 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.6■■□□□ 1.85
SPCS2-204ENST00000527225 ABCC5O15440 1437 aa26.59■■□□□ 1.85
SPCS2-204ENST00000527225 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SPCS2-204ENST00000527225 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms