RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526330.5

APLP2-208, Transcript of amyloid beta precursor like protein 2, human

TSL 3

Gene APLP2, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APLP2-208	ENST00000526330	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		34.44	■■■■□ 3.1
APLP2-208	ENST00000526330	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		34.43	■■■■□ 3.1
APLP2-208	ENST00000526330	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		34.41	■■■■□ 3.1
APLP2-208	ENST00000526330	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	34.39	■■■■□ 3.1
APLP2-208	ENST00000526330	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		34.39	■■■■□ 3.1
APLP2-208	ENST00000526330	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	34.33	■■■■□ 3.09
APLP2-208	ENST00000526330	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		34.33	■■■■□ 3.09
APLP2-208	ENST00000526330	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		34.32	■■■■□ 3.08
APLP2-208	ENST00000526330	CLIP1	P30622	1438 aa		34.31	■■■■□ 3.08
APLP2-208	ENST00000526330	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		34.31	■■■■□ 3.08
APLP2-208	ENST00000526330	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		34.29	■■■■□ 3.08
APLP2-208	ENST00000526330	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		34.29	■■■■□ 3.08
APLP2-208	ENST00000526330	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	34.28	■■■■□ 3.08
APLP2-208	ENST00000526330	KDM5C	P41229	1560 aa		34.27	■■■■□ 3.08
APLP2-208	ENST00000526330	PREX2	Q70Z35	1606 aa		34.25	■■■■□ 3.07
APLP2-208	ENST00000526330	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		34.21	■■■■□ 3.07
APLP2-208	ENST00000526330	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		34.21	■■■■□ 3.07
APLP2-208	ENST00000526330	ATP10A	O60312	1499 aa		34.2	■■■■□ 3.07
APLP2-208	ENST00000526330	AFAP1	Q8N556	730 aa		34.18	■■■■□ 3.06
APLP2-208	ENST00000526330	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		34.18	■■■■□ 3.06
APLP2-208	ENST00000526330	ABCC1	P33527	1531 aa		34.17	■■■■□ 3.06
APLP2-208	ENST00000526330	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		34.17	■■■■□ 3.06
APLP2-208	ENST00000526330	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		34.17	■■■■□ 3.06
APLP2-208	ENST00000526330	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		34.13	■■■■□ 3.05
APLP2-208	ENST00000526330	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		34.13	■■■■□ 3.05
APLP2-208	ENST00000526330	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	34.12	■■■■□ 3.05
APLP2-208	ENST00000526330	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		34.11	■■■■□ 3.05
APLP2-208	ENST00000526330	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		34.11	■■■■□ 3.05
APLP2-208	ENST00000526330	ABCA6	Q8N139	1617 aa		34.09	■■■■□ 3.05
APLP2-208	ENST00000526330	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		34.08	■■■■□ 3.05
APLP2-208	ENST00000526330	MLEC	Q14165	292 aa		34.08	■■■■□ 3.05
APLP2-208	ENST00000526330	RERE	Q9P2R6	1566 aa		34.06	■■■■□ 3.04
APLP2-208	ENST00000526330	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	34.05	■■■■□ 3.04
APLP2-208	ENST00000526330	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		34.03	■■■■□ 3.04
APLP2-208	ENST00000526330	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		34	■■■■□ 3.03
APLP2-208	ENST00000526330	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.96	■■■■□ 3.03
APLP2-208	ENST00000526330	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.94	■■■■□ 3.02
APLP2-208	ENST00000526330	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.94	■■■■□ 3.02
APLP2-208	ENST00000526330	AGL	P35573	1532 aa		33.94	■■■■□ 3.02
APLP2-208	ENST00000526330	HSPA2	P54652	639 aa		33.91	■■■■□ 3.02
APLP2-208	ENST00000526330	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.87	■■■■□ 3.01
APLP2-208	ENST00000526330	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.85	■■■■□ 3.01
APLP2-208	ENST00000526330	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.85	■■■■□ 3.01
APLP2-208	ENST00000526330	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.85	■■■■□ 3.01
APLP2-208	ENST00000526330	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.85	■■■■□ 3.01
APLP2-208	ENST00000526330	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.84	■■■■□ 3.01
APLP2-208	ENST00000526330	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.84	■■■■□ 3.01
APLP2-208	ENST00000526330	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.83	■■■■□ 3.01	1e-8	■■■■■ 28.9
APLP2-208	ENST00000526330	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.83	■■■■□ 3.01
APLP2-208	ENST00000526330	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
APLP2-208	ENST00000526330	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.8	■■■■□ 3
APLP2-208	ENST00000526330	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
APLP2-208	ENST00000526330	C3	P01024	1663 aa		33.77	■■■■□ 3
APLP2-208	ENST00000526330	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.77	■■■■□ 3
APLP2-208	ENST00000526330	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.77	■■■■□ 3
APLP2-208	ENST00000526330	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
APLP2-208	ENST00000526330	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.74	■■■□□ 2.99
APLP2-208	ENST00000526330	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.74	■■■□□ 2.99
APLP2-208	ENST00000526330	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
APLP2-208	ENST00000526330	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.7	■■■□□ 2.99
APLP2-208	ENST00000526330	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.66	■■■□□ 2.98
APLP2-208	ENST00000526330	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.66	■■■□□ 2.98
APLP2-208	ENST00000526330	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.65	■■■□□ 2.98
APLP2-208	ENST00000526330	A2M	P01023	1474 aa		33.64	■■■□□ 2.98
APLP2-208	ENST00000526330	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.63	■■■□□ 2.97
APLP2-208	ENST00000526330	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.62	■■■□□ 2.97
APLP2-208	ENST00000526330	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.62	■■■□□ 2.97
APLP2-208	ENST00000526330	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.62	■■■□□ 2.97
APLP2-208	ENST00000526330	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.61	■■■□□ 2.97
APLP2-208	ENST00000526330	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.6	■■■□□ 2.97
APLP2-208	ENST00000526330	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.55	■■■□□ 2.96
APLP2-208	ENST00000526330	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.54	■■■□□ 2.96
APLP2-208	ENST00000526330	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.53	■■■□□ 2.96
APLP2-208	ENST00000526330	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.52	■■■□□ 2.96
APLP2-208	ENST00000526330	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
APLP2-208	ENST00000526330	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.51	■■■□□ 2.96
APLP2-208	ENST00000526330	NPAT	Q14207	1427 aa		33.49	■■■□□ 2.95
APLP2-208	ENST00000526330	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
APLP2-208	ENST00000526330	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.49	■■■□□ 2.95
APLP2-208	ENST00000526330	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
APLP2-208	ENST00000526330	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.43	■■■□□ 2.94
APLP2-208	ENST00000526330	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
APLP2-208	ENST00000526330	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.43	■■■□□ 2.94
APLP2-208	ENST00000526330	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.42	■■■□□ 2.94
APLP2-208	ENST00000526330	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.4	■■■□□ 2.94
APLP2-208	ENST00000526330	GGT6	Q6P531	493 aa		33.4	■■■□□ 2.94
APLP2-208	ENST00000526330	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.39	■■■□□ 2.94
APLP2-208	ENST00000526330	PTPRT	O14522	1441 aa		33.36	■■■□□ 2.93
APLP2-208	ENST00000526330	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.35	■■■□□ 2.93
APLP2-208	ENST00000526330	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
APLP2-208	ENST00000526330	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.33	■■■□□ 2.93
APLP2-208	ENST00000526330	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.32	■■■□□ 2.92
APLP2-208	ENST00000526330	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.31	■■■□□ 2.92
APLP2-208	ENST00000526330	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.31	■■■□□ 2.92
APLP2-208	ENST00000526330	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.28	■■■□□ 2.92
APLP2-208	ENST00000526330	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
APLP2-208	ENST00000526330	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.27	■■■□□ 2.92
APLP2-208	ENST00000526330	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.25	■■■□□ 2.91
APLP2-208	ENST00000526330	KIF3B	O15066	747 aa		33.25	■■■□□ 2.91
APLP2-208	ENST00000526330	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.24	■■■□□ 2.91

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