RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
HMBOX1-211ENST00000524238 ARHGEF11O15085 1522 aa10.1□□□□□ -0.79
HMBOX1-211ENST00000524238 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.1□□□□□ -0.79
HMBOX1-211ENST00000524238 CADPSQ9ULU8 1353 aa10.1□□□□□ -0.79
HMBOX1-211ENST00000524238 MS4A1P11836 297 aa10.09□□□□□ -0.79
HMBOX1-211ENST00000524238 GRIN2BQ13224 1484 aa10.08□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 DDRGK1Q96HY6 314 aa10.08□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC184Q52MB2 194 aa10.07□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 P3H3Q8IVL6 736 aa10.07□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa10.07□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.07□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa10.06□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 FOXD1Q16676 465 aa10.05□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 L3MBTL2Q969R5 705 aa10.05□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.05□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 MPHOSPH9Q99550 1183 aa10.05□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 KIF7Q2M1P5 1343 aa10.05□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 ROCK1Q13464 1354 aa10.04□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 TEX14Q8IWB6 1497 aa10.04□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 NEFMP07197 916 aa10.03□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa10.03□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 PDE3BQ13370 1112 aa10.02□□□□□ -0.8
HMBOX1-211ENST00000524238 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 PDE4AP27815 886 aa10□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 BACH2Q9BYV9 841 aa10□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 KIF14Q15058 1648 aa10□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 RRP1P56182 461 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 TMC1Q8TDI8 760 aa9.99□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 KIF15Q9NS87 1388 aa9.99□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.99□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 INSRP06213 1382 aa9.98□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 RALBP1Q15311 655 aa9.98□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 IL27Q8NEV9 243 aa9.98□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.98□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa9.97□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 GSE1Q14687 1217 aa9.97□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 KDM6BO15054 1643 aa9.97□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 TOPBP1Q92547 1522 aa9.97□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.96□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 MBD5Q9P267 1494 aa9.96□□□□□ -0.81
HMBOX1-211ENST00000524238 NESP48681 1621 aa9.96□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 KDM5CP41229 1560 aa9.96□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 USP47Q96K76 1375 aa9.95□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.95□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 DAPK1P53355 1430 aa9.95□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa9.94□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.94□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.94□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.94□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.93□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa9.93□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.93□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.92□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa9.92□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 ADGBQ8N7X0 1667 aa9.91□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.91□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 E9PCH4 1651 aa9.91□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.91□□□□□ -0.82
HMBOX1-211ENST00000524238 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.89□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 NFKBIBQ15653 356 aa9.89□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 NLRP13Q86W25 1043 aa9.89□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.89□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 WDR62O43379 1518 aa9.88□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 ABCC5O15440 1437 aa9.88□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.88□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 ITSN2Q9NZM3 1697 aa9.87□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 PZPP20742 1482 aa9.87□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 IQGAP2Q13576 1575 aa9.87□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 ADGRL2O95490 1459 aa9.86□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 POLR3GLQ9BT43 218 aa9.85□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.85□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM161AQ3B820 660 aa9.85□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa9.85□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.84□□□□□ -0.83
HMBOX1-211ENST00000524238 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HMBOX1-211ENST00000524238 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HMBOX1-211ENST00000524238 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HMBOX1-211ENST00000524238 CROCC2H7BZ55 1655 aa9.83□□□□□ -0.84
HMBOX1-211ENST00000524238 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms