RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523985.5

CCNC-217, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCNC, Length 958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-217ENST00000523985 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNC-217ENST00000523985 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNC-217ENST00000523985 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNC-217ENST00000523985 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CCNC-217ENST00000523985 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CCNC-217ENST00000523985 TIAM1Q13009 1591 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNC-217ENST00000523985 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNC-217ENST00000523985 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNC-217ENST00000523985 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNC-217ENST00000523985 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.64■■□□□ 1.21
CCNC-217ENST00000523985 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.64■■□□□ 1.21
CCNC-217ENST00000523985 PREX2Q70Z35 1606 aa22.64■■□□□ 1.21
CCNC-217ENST00000523985 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNC-217ENST00000523985 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CCNC-217ENST00000523985 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CCNC-217ENST00000523985 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.61■■□□□ 1.21
CCNC-217ENST00000523985 NCOA2Q15596 1464 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNC-217ENST00000523985 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNC-217ENST00000523985 AFAP1Q8N556 730 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNC-217ENST00000523985 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNC-217ENST00000523985 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNC-217ENST00000523985 RICTORQ6R327 1708 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNC-217ENST00000523985 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCNC-217ENST00000523985 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNC-217ENST00000523985 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNC-217ENST00000523985 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNC-217ENST00000523985 ABCC1P33527 1531 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNC-217ENST00000523985 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.28e-10■■■■□ 20.8
CCNC-217ENST00000523985 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNC-217ENST00000523985 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNC-217ENST00000523985 ATP10AO60312 1499 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNC-217ENST00000523985 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.52■■□□□ 1.19
CCNC-217ENST00000523985 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.52■■□□□ 1.19
CCNC-217ENST00000523985 KDM5CP41229 1560 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNC-217ENST00000523985 MIA2Q96PC5 1412 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNC-217ENST00000523985 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNC-217ENST00000523985 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CCNC-217ENST00000523985 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CCNC-217ENST00000523985 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNC-217ENST00000523985 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNC-217ENST00000523985 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNC-217ENST00000523985 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CCNC-217ENST00000523985 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNC-217ENST00000523985 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNC-217ENST00000523985 MBD5Q9P267 1494 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNC-217ENST00000523985 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNC-217ENST00000523985 TSPY4P0CV99 314 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNC-217ENST00000523985 TSPY10P0CW01 314 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNC-217ENST00000523985 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNC-217ENST00000523985 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNC-217ENST00000523985 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNC-217ENST00000523985 REREQ9P2R6 1566 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNC-217ENST00000523985 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNC-217ENST00000523985 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNC-217ENST00000523985 AGLP35573 1532 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNC-217ENST00000523985 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.33■■□□□ 1.16
CCNC-217ENST00000523985 ATP7AQ04656 1500 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNC-217ENST00000523985 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNC-217ENST00000523985 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNC-217ENST00000523985 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNC-217ENST00000523985 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.3■■□□□ 1.16
CCNC-217ENST00000523985 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.3■■□□□ 1.16
CCNC-217ENST00000523985 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCNC-217ENST00000523985 MLECQ14165 292 aa22.28■■□□□ 1.16
CCNC-217ENST00000523985 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CCNC-217ENST00000523985 A2MP01023 1474 aa22.28■■□□□ 1.16
CCNC-217ENST00000523985 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCNC-217ENST00000523985 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CCNC-217ENST00000523985 ABCA6Q8N139 1617 aa22.27■■□□□ 1.16
CCNC-217ENST00000523985 PTPRMP28827 1452 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNC-217ENST00000523985 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNC-217ENST00000523985 ABCC5O15440 1437 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNC-217ENST00000523985 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNC-217ENST00000523985 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNC-217ENST00000523985 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CCNC-217ENST00000523985 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNC-217ENST00000523985 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
CCNC-217ENST00000523985 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNC-217ENST00000523985 MADDQ8WXG6 1647 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNC-217ENST00000523985 PLXNC1O60486 1568 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNC-217ENST00000523985 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNC-217ENST00000523985 DAPK1P53355 1430 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNC-217ENST00000523985 GGT6Q6P531 493 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNC-217ENST00000523985 KIF3BO15066 747 aa22.14■■□□□ 1.13
CCNC-217ENST00000523985 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.13■■□□□ 1.13
CCNC-217ENST00000523985 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCNC-217ENST00000523985 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCNC-217ENST00000523985 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNC-217ENST00000523985 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNC-217ENST00000523985 KIF15Q9NS87 1388 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNC-217ENST00000523985 NCOA1Q15788 1441 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNC-217ENST00000523985 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CCNC-217ENST00000523985 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNC-217ENST00000523985 ZMYM3Q14202 1370 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNC-217ENST00000523985 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNC-217ENST00000523985 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNC-217ENST00000523985 ERBINQ96RT1 1412 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNC-217ENST00000523985 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNC-217ENST00000523985 ADGRL2O95490 1459 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNC-217ENST00000523985 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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