RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523788.1

GGH-208, Transcript of gamma-glutamyl hydrolase, human

TSL 2

Gene GGH, Length 492 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGH-208	ENST00000523788	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.8	■■■■□ 3
GGH-208	ENST00000523788	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.77	■■■■□ 3
GGH-208	ENST00000523788	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.76	■■■■□ 3
GGH-208	ENST00000523788	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.76	■■■□□ 2.99
GGH-208	ENST00000523788	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.75	■■■□□ 2.99
GGH-208	ENST00000523788	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.75	■■■□□ 2.99
GGH-208	ENST00000523788	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.73	■■■□□ 2.99
GGH-208	ENST00000523788	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.73	■■■□□ 2.99
GGH-208	ENST00000523788	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
GGH-208	ENST00000523788	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GGH-208	ENST00000523788	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.66	■■■□□ 2.98
GGH-208	ENST00000523788	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.65	■■■□□ 2.98
GGH-208	ENST00000523788	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.64	■■■□□ 2.98
GGH-208	ENST00000523788	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.63	■■■□□ 2.97
GGH-208	ENST00000523788	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.63	■■■□□ 2.97
GGH-208	ENST00000523788	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.63	■■■□□ 2.97
GGH-208	ENST00000523788	ABCC1	P33527	1531 aa		33.6	■■■□□ 2.97
GGH-208	ENST00000523788	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.6	■■■□□ 2.97
GGH-208	ENST00000523788	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.6	■■■□□ 2.97
GGH-208	ENST00000523788	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
GGH-208	ENST00000523788	KDM5C	P41229	1560 aa		33.59	■■■□□ 2.97
GGH-208	ENST00000523788	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.97
GGH-208	ENST00000523788	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
GGH-208	ENST00000523788	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.55	■■■□□ 2.96
GGH-208	ENST00000523788	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.55	■■■□□ 2.96
GGH-208	ENST00000523788	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.54	■■■□□ 2.96
GGH-208	ENST00000523788	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.53	■■■□□ 2.96
GGH-208	ENST00000523788	ATP10A	O60312	1499 aa		33.53	■■■□□ 2.96
GGH-208	ENST00000523788	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.52	■■■□□ 2.96
GGH-208	ENST00000523788	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.51	■■■□□ 2.96
GGH-208	ENST00000523788	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.51	■■■□□ 2.96
GGH-208	ENST00000523788	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.51	■■■□□ 2.95
GGH-208	ENST00000523788	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.5	■■■□□ 2.95
GGH-208	ENST00000523788	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
GGH-208	ENST00000523788	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.49	■■■□□ 2.95
GGH-208	ENST00000523788	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.48	■■■□□ 2.95
GGH-208	ENST00000523788	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.47	■■■□□ 2.95
GGH-208	ENST00000523788	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.47	■■■□□ 2.95
GGH-208	ENST00000523788	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.46	■■■□□ 2.95
GGH-208	ENST00000523788	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.45	■■■□□ 2.95
GGH-208	ENST00000523788	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.45	■■■□□ 2.94
GGH-208	ENST00000523788	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.43	■■■□□ 2.94
GGH-208	ENST00000523788	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
GGH-208	ENST00000523788	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
GGH-208	ENST00000523788	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GGH-208	ENST00000523788	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GGH-208	ENST00000523788	PTPRM	P28827	1452 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GGH-208	ENST00000523788	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.36	■■■□□ 2.93
GGH-208	ENST00000523788	APLP2	Q06481	763 aa		33.36	■■■□□ 2.93
GGH-208	ENST00000523788	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GGH-208	ENST00000523788	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
GGH-208	ENST00000523788	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GGH-208	ENST00000523788	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GGH-208	ENST00000523788	MLEC	Q14165	292 aa		33.31	■■■□□ 2.92
GGH-208	ENST00000523788	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.28	■■■□□ 2.92
GGH-208	ENST00000523788	AGL	P35573	1532 aa		33.26	■■■□□ 2.91
GGH-208	ENST00000523788	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
GGH-208	ENST00000523788	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.25	■■■□□ 2.91
GGH-208	ENST00000523788	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.24	■■■□□ 2.91
GGH-208	ENST00000523788	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
GGH-208	ENST00000523788	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.2	■■■□□ 2.91
GGH-208	ENST00000523788	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GGH-208	ENST00000523788	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GGH-208	ENST00000523788	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GGH-208	ENST00000523788	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.17	■■■□□ 2.9
GGH-208	ENST00000523788	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.14	■■■□□ 2.9
GGH-208	ENST00000523788	A2M	P01023	1474 aa		33.12	■■■□□ 2.89
GGH-208	ENST00000523788	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.09	■■■□□ 2.89
GGH-208	ENST00000523788	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.09	■■■□□ 2.89
GGH-208	ENST00000523788	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.09	■■■□□ 2.89
GGH-208	ENST00000523788	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.08	■■■□□ 2.89
GGH-208	ENST00000523788	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
GGH-208	ENST00000523788	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.03	■■■□□ 2.88
GGH-208	ENST00000523788	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
GGH-208	ENST00000523788	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
GGH-208	ENST00000523788	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.99	■■■□□ 2.87
GGH-208	ENST00000523788	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GGH-208	ENST00000523788	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GGH-208	ENST00000523788	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GGH-208	ENST00000523788	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GGH-208	ENST00000523788	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.95	■■■□□ 2.87
GGH-208	ENST00000523788	GGT6	Q6P531	493 aa		32.94	■■■□□ 2.86
GGH-208	ENST00000523788	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
GGH-208	ENST00000523788	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
GGH-208	ENST00000523788	C3	P01024	1663 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GGH-208	ENST00000523788	ABCC5	O15440	1437 aa		32.88	■■■□□ 2.85
GGH-208	ENST00000523788	KIF3B	O15066	747 aa		32.88	■■■□□ 2.85
GGH-208	ENST00000523788	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.88	■■■□□ 2.85
GGH-208	ENST00000523788	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GGH-208	ENST00000523788	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.83	■■■□□ 2.85
GGH-208	ENST00000523788	DAPK1	P53355	1430 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GGH-208	ENST00000523788	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GGH-208	ENST00000523788	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
GGH-208	ENST00000523788	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
GGH-208	ENST00000523788	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GGH-208	ENST00000523788	HSPA2	P54652	639 aa		32.78	■■■□□ 2.84
GGH-208	ENST00000523788	NPAT	Q14207	1427 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GGH-208	ENST00000523788	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.75	■■■□□ 2.83
GGH-208	ENST00000523788	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.74	■■■□□ 2.83
GGH-208	ENST00000523788	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.74	■■■□□ 2.83

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