RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522399.1

TTC13-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

TSL 4

Gene TTC13, Length 529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-208ENST00000522399 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
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TTC13-208ENST00000522399 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.26■■■■■ 4.03
TTC13-208ENST00000522399 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.25■■■■■ 4.03
TTC13-208ENST00000522399 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.24■■■■■ 4.03
TTC13-208ENST00000522399 MADDQ8WXG6 1647 aa40.2■■■■■ 4.03
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TTC13-208ENST00000522399 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.92■■■■□ 3.98
TTC13-208ENST00000522399 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.91■■■■□ 3.98
TTC13-208ENST00000522399 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.91■■■■□ 3.98
TTC13-208ENST00000522399 ABCC1P33527 1531 aa39.9■■■■□ 3.98
TTC13-208ENST00000522399 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.85■■■■□ 3.97
TTC13-208ENST00000522399 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.84■■■■□ 3.97
TTC13-208ENST00000522399 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.83■■■■□ 3.97
TTC13-208ENST00000522399 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.83■■■■□ 3.97
TTC13-208ENST00000522399 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.83■■■■□ 3.97
TTC13-208ENST00000522399 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.81■■■■□ 3.96
TTC13-208ENST00000522399 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.81■■■■□ 3.96
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TTC13-208ENST00000522399 REREQ9P2R6 1566 aa39.77■■■■□ 3.96
TTC13-208ENST00000522399 ABCA6Q8N139 1617 aa39.76■■■■□ 3.96
TTC13-208ENST00000522399 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
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TTC13-208ENST00000522399 CEP162Q5TB80 1403 aa39.74■■■■□ 3.95
TTC13-208ENST00000522399 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.73■■■■□ 3.95
TTC13-208ENST00000522399 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.71■■■■□ 3.95
TTC13-208ENST00000522399 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.68■■■■□ 3.94
TTC13-208ENST00000522399 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.67■■■■□ 3.94
TTC13-208ENST00000522399 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.65■■■■□ 3.94
TTC13-208ENST00000522399 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
TTC13-208ENST00000522399 AGLP35573 1532 aa39.64■■■■□ 3.94
TTC13-208ENST00000522399 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.62■■■■□ 3.93
TTC13-208ENST00000522399 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.6■■■■□ 3.93
TTC13-208ENST00000522399 HSPA2P54652 639 aa39.6■■■■□ 3.93
TTC13-208ENST00000522399 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.59■■■■□ 3.93
TTC13-208ENST00000522399 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.58■■■■□ 3.93
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TTC13-208ENST00000522399 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
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TTC13-208ENST00000522399 TIAM1Q13009 1591 aa39.52■■■■□ 3.92
TTC13-208ENST00000522399 ATP7AQ04656 1500 aa39.49■■■■□ 3.91
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TTC13-208ENST00000522399 C3P01024 1663 aa39.45■■■■□ 3.91
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TTC13-208ENST00000522399 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
TTC13-208ENST00000522399 A2MP01023 1474 aa39.36■■■■□ 3.89
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TTC13-208ENST00000522399 NCOA2Q15596 1464 aa39.34■■■■□ 3.89
TTC13-208ENST00000522399 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.32■■■■□ 3.89
TTC13-208ENST00000522399 MBD5Q9P267 1494 aa39.32■■■■□ 3.89
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TTC13-208ENST00000522399 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.24■■■■□ 3.87
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TTC13-208ENST00000522399 ZMYM3Q14202 1370 aa39.21■■■■□ 3.87
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TTC13-208ENST00000522399 STRCQ7RTU9 1775 aa39.2■■■■□ 3.87
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TTC13-208ENST00000522399 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.18■■■■□ 3.86
TTC13-208ENST00000522399 GGT6Q6P531 493 aa39.18■■■■□ 3.86
TTC13-208ENST00000522399 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.17■■■■□ 3.86
TTC13-208ENST00000522399 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.13■■■■□ 3.85
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TTC13-208ENST00000522399 TSPY10P0CW01 314 aa39.02■■■■□ 3.84
TTC13-208ENST00000522399 PTPRTO14522 1441 aa39.01■■■■□ 3.84
TTC13-208ENST00000522399 PTPRKQ15262 1439 aa39■■■■□ 3.83
TTC13-208ENST00000522399 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39■■■■□ 3.83
TTC13-208ENST00000522399 NCOA1Q15788 1441 aa38.99■■■■□ 3.83
TTC13-208ENST00000522399 KIF3BO15066 747 aa38.98■■■■□ 3.83
TTC13-208ENST00000522399 MYO3AQ8NEV4 1616 aa38.98■■■■□ 3.83
TTC13-208ENST00000522399 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.96■■■■□ 3.83
TTC13-208ENST00000522399 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
TTC13-208ENST00000522399 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.93■■■■□ 3.82
TTC13-208ENST00000522399 MIA2Q96PC5 1412 aa38.93■■■■□ 3.82
TTC13-208ENST00000522399 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.93■■■■□ 3.82
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