RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521995.1

ITGB2-218, Transcript of integrin subunit beta 2, humanhuman

TSL 4

Gene ITGB2, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2-218ENST00000521995 ADGRL1O94910 1474 aa25.21■■□□□ 1.63
ITGB2-218ENST00000521995 PREX2Q70Z35 1606 aa25.21■■□□□ 1.63
ITGB2-218ENST00000521995 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.2■■□□□ 1.62
ITGB2-218ENST00000521995 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.19■■□□□ 1.62
ITGB2-218ENST00000521995 RICTORQ6R327 1708 aa25.17■■□□□ 1.62
ITGB2-218ENST00000521995 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ITGB2-218ENST00000521995 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
ITGB2-218ENST00000521995 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.14■■□□□ 1.61
ITGB2-218ENST00000521995 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ITGB2-218ENST00000521995 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.12■■□□□ 1.61
ITGB2-218ENST00000521995 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.11■■□□□ 1.61
ITGB2-218ENST00000521995 NCOA2Q15596 1464 aa25.09■■□□□ 1.61
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ITGB2-218ENST00000521995 MAP3K1Q13233 1512 aa25.08■■□□□ 1.61
ITGB2-218ENST00000521995 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
ITGB2-218ENST00000521995 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.07■■□□□ 1.6
ITGB2-218ENST00000521995 APLP2Q06481 763 aa25.07■■□□□ 1.6
ITGB2-218ENST00000521995 ABCC1P33527 1531 aa25.07■■□□□ 1.6
ITGB2-218ENST00000521995 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.06■■□□□ 1.6
ITGB2-218ENST00000521995 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.06■■□□□ 1.6
ITGB2-218ENST00000521995 AFAP1Q8N556 730 aa25.06■■□□□ 1.6
ITGB2-218ENST00000521995 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.05■■□□□ 1.6
ITGB2-218ENST00000521995 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.04■■□□□ 1.6
ITGB2-218ENST00000521995 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.03■■□□□ 1.6
ITGB2-218ENST00000521995 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.03■■□□□ 1.6
ITGB2-218ENST00000521995 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.02■■□□□ 1.6
ITGB2-218ENST00000521995 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.02■■□□□ 1.6
ITGB2-218ENST00000521995 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
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ITGB2-218ENST00000521995 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
ITGB2-218ENST00000521995 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.01■■□□□ 1.59
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ITGB2-218ENST00000521995 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.99■■□□□ 1.59
ITGB2-218ENST00000521995 KDM5CP41229 1560 aa24.97■■□□□ 1.59
ITGB2-218ENST00000521995 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.96■■□□□ 1.59
ITGB2-218ENST00000521995 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ITGB2-218ENST00000521995 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.93■■□□□ 1.58
ITGB2-218ENST00000521995 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.92■■□□□ 1.58
ITGB2-218ENST00000521995 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.91■■□□□ 1.58
ITGB2-218ENST00000521995 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.91■■□□□ 1.58
ITGB2-218ENST00000521995 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.89■■□□□ 1.58
ITGB2-218ENST00000521995 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.89■■□□□ 1.57
ITGB2-218ENST00000521995 ATP10AO60312 1499 aa24.88■■□□□ 1.57
ITGB2-218ENST00000521995 ABCA6Q8N139 1617 aa24.87■■□□□ 1.57
ITGB2-218ENST00000521995 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.87■■□□□ 1.57
ITGB2-218ENST00000521995 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
ITGB2-218ENST00000521995 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.86■■□□□ 1.57
ITGB2-218ENST00000521995 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.86■■□□□ 1.57
ITGB2-218ENST00000521995 MBD5Q9P267 1494 aa24.86■■□□□ 1.57
ITGB2-218ENST00000521995 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.85■■□□□ 1.57
ITGB2-218ENST00000521995 MLECQ14165 292 aa24.83■■□□□ 1.57
ITGB2-218ENST00000521995 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.83■■□□□ 1.57
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ITGB2-218ENST00000521995 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.77■■□□□ 1.56
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ITGB2-218ENST00000521995 REREQ9P2R6 1566 aa24.73■■□□□ 1.55
ITGB2-218ENST00000521995 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.73■■□□□ 1.55
ITGB2-218ENST00000521995 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.71■■□□□ 1.55
ITGB2-218ENST00000521995 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
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ITGB2-218ENST00000521995 TSPY10P0CW01 314 aa24.68■■□□□ 1.54
ITGB2-218ENST00000521995 A2MP01023 1474 aa24.68■■□□□ 1.54
ITGB2-218ENST00000521995 PTPRMP28827 1452 aa24.68■■□□□ 1.54
ITGB2-218ENST00000521995 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.68■■□□□ 1.54
ITGB2-218ENST00000521995 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.67■■□□□ 1.54
ITGB2-218ENST00000521995 AGLP35573 1532 aa24.66■■□□□ 1.54
ITGB2-218ENST00000521995 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.66■■□□□ 1.54
ITGB2-218ENST00000521995 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
ITGB2-218ENST00000521995 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.65■■□□□ 1.54
ITGB2-218ENST00000521995 PLXNC1O60486 1568 aa24.63■■□□□ 1.53
ITGB2-218ENST00000521995 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
ITGB2-218ENST00000521995 ABCC5O15440 1437 aa24.61■■□□□ 1.53
ITGB2-218ENST00000521995 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.6■■□□□ 1.53
ITGB2-218ENST00000521995 DAPK1P53355 1430 aa24.59■■□□□ 1.53
ITGB2-218ENST00000521995 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
ITGB2-218ENST00000521995 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
ITGB2-218ENST00000521995 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.58■■□□□ 1.53
ITGB2-218ENST00000521995 GGT6Q6P531 493 aa24.56■■□□□ 1.52
ITGB2-218ENST00000521995 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.55■■□□□ 1.52
ITGB2-218ENST00000521995 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ITGB2-218ENST00000521995 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ITGB2-218ENST00000521995 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.52■■□□□ 1.52
ITGB2-218ENST00000521995 KIF3BO15066 747 aa24.52■■□□□ 1.52
ITGB2-218ENST00000521995 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.5■■□□□ 1.51
ITGB2-218ENST00000521995 KIF15Q9NS87 1388 aa24.47■■□□□ 1.51
ITGB2-218ENST00000521995 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
ITGB2-218ENST00000521995 C3P01024 1663 aa24.45■■□□□ 1.5
ITGB2-218ENST00000521995 ITGAEP38570 1179 aa24.44■■□□□ 1.5
ITGB2-218ENST00000521995 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.44■■□□□ 1.5
ITGB2-218ENST00000521995 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.44■■□□□ 1.5
ITGB2-218ENST00000521995 PTPRKQ15262 1439 aa24.43■■□□□ 1.5
ITGB2-218ENST00000521995 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.42■■□□□ 1.5
ITGB2-218ENST00000521995 NCOA1Q15788 1441 aa24.4■■□□□ 1.5
ITGB2-218ENST00000521995 ZMYM3Q14202 1370 aa24.4■■□□□ 1.5
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