RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521452.1

TMEM200B-202, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-202ENST00000521452 NCOA1Q15788 1441 aa29.72■■■□□ 2.35
TMEM200B-202ENST00000521452 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.71■■■□□ 2.35
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
TMEM200B-202ENST00000521452 WDR62O43379 1518 aa29.7■■■□□ 2.35
TMEM200B-202ENST00000521452 MRS2Q9HD23 443 aa29.68■■■□□ 2.34
TMEM200B-202ENST00000521452 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
TMEM200B-202ENST00000521452 DAPK1P53355 1430 aa29.67■■■□□ 2.34
TMEM200B-202ENST00000521452 PBRM1Q86U86 1689 aa29.67■■■□□ 2.34
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
TMEM200B-202ENST00000521452 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
TMEM200B-202ENST00000521452 MSH5O43196 834 aa29.65■■■□□ 2.34
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCC5O15440 1437 aa29.63■■■□□ 2.33
TMEM200B-202ENST00000521452 ADAMTS12P58397 1594 aa29.63■■■□□ 2.33
TMEM200B-202ENST00000521452 ROCK1Q13464 1354 aa29.63■■■□□ 2.33
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.62■■■□□ 2.33
TMEM200B-202ENST00000521452 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.61■■■□□ 2.33
TMEM200B-202ENST00000521452 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.57■■■□□ 2.32
TMEM200B-202ENST00000521452 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.57■■■□□ 2.32
TMEM200B-202ENST00000521452 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.55■■■□□ 2.32
TMEM200B-202ENST00000521452 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.55■■■□□ 2.32
TMEM200B-202ENST00000521452 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
TMEM200B-202ENST00000521452 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
TMEM200B-202ENST00000521452 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
TMEM200B-202ENST00000521452 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.5■■■□□ 2.31
TMEM200B-202ENST00000521452 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.49■■■□□ 2.31
TMEM200B-202ENST00000521452 DISP1Q96F81 1524 aa29.48■■■□□ 2.31
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 KIAA0556O60303 1618 aa29.44■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.43■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.43■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 PZPP20742 1482 aa29.43■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.42■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
TMEM200B-202ENST00000521452 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.37■■■□□ 2.29
TMEM200B-202ENST00000521452 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.36■■■□□ 2.29
TMEM200B-202ENST00000521452 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
TMEM200B-202ENST00000521452 USP47Q96K76 1375 aa29.35■■■□□ 2.29
TMEM200B-202ENST00000521452 PKD2Q13563 968 aa29.35■■■□□ 2.29
TMEM200B-202ENST00000521452 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
TMEM200B-202ENST00000521452 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
TMEM200B-202ENST00000521452 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 IFT140Q96RY7 1462 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 MBD5Q9P267 1494 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 BCL11AQ9H165 835 aa29.29■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 GRIN2AQ12879 1464 aa29.27■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.27■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.27■■■□□ 2.28
TMEM200B-202ENST00000521452 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
TMEM200B-202ENST00000521452 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.22■■■□□ 2.27
TMEM200B-202ENST00000521452 NUDCQ9Y266 331 aa29.21■■■□□ 2.27
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF14Q15058 1648 aa29.21■■■□□ 2.27
TMEM200B-202ENST00000521452 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.2■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 ADGRL2O95490 1459 aa29.2■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.17■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.16■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 KDM5CP41229 1560 aa29.16■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.16■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 NUP155O75694 1391 aa29.16■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 FBLN2P98095 1184 aa29.15■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 TMC1Q8TDI8 760 aa29.15■■■□□ 2.26
TMEM200B-202ENST00000521452 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.14■■■□□ 2.25
TMEM200B-202ENST00000521452 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
TMEM200B-202ENST00000521452 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.11■■■□□ 2.25
TMEM200B-202ENST00000521452 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.1■■■□□ 2.25
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.1■■■□□ 2.25
TMEM200B-202ENST00000521452 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.09■■■□□ 2.25
TMEM200B-202ENST00000521452 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.09■■■□□ 2.25
TMEM200B-202ENST00000521452 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.07■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.07■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 JPH4Q96JJ6 628 aa29.07■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 CEP170Q5SW79 1584 aa29.06■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.06■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.05■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.05■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF15Q9NS87 1388 aa29.03■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 TSPY4P0CV99 314 aa29.01■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 TSPY10P0CW01 314 aa29.01■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.01■■■□□ 2.24
TMEM200B-202ENST00000521452 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
TMEM200B-202ENST00000521452 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
TMEM200B-202ENST00000521452 SYNJ2O15056 1496 aa28.98■■■□□ 2.23
TMEM200B-202ENST00000521452 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.96■■■□□ 2.23
TMEM200B-202ENST00000521452 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
TMEM200B-202ENST00000521452 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
TMEM200B-202ENST00000521452 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.95■■■□□ 2.22
TMEM200B-202ENST00000521452 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.94■■■□□ 2.22
TMEM200B-202ENST00000521452 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.94■■■□□ 2.22
TMEM200B-202ENST00000521452 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
TMEM200B-202ENST00000521452 ATP10BO94823 1461 aa28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms