RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515697.5

FAM200B-222, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 3

Gene FAM200B, Length 607 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-222	ENST00000515697	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.77	■■■□□ 2.84
FAM200B-222	ENST00000515697	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.76	■■■□□ 2.83
FAM200B-222	ENST00000515697	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.74	■■■□□ 2.83
FAM200B-222	ENST00000515697	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.74	■■■□□ 2.83
FAM200B-222	ENST00000515697	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.72	■■■□□ 2.83
FAM200B-222	ENST00000515697	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.72	■■■□□ 2.83
FAM200B-222	ENST00000515697	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.72	■■■□□ 2.83
FAM200B-222	ENST00000515697	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.71	■■■□□ 2.83
FAM200B-222	ENST00000515697	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.69	■■■□□ 2.82
FAM200B-222	ENST00000515697	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.69	■■■□□ 2.82
FAM200B-222	ENST00000515697	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.67	■■■□□ 2.82
FAM200B-222	ENST00000515697	KDM5C	P41229	1560 aa		32.64	■■■□□ 2.82
FAM200B-222	ENST00000515697	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.62	■■■□□ 2.81
FAM200B-222	ENST00000515697	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FAM200B-222	ENST00000515697	PTPRM	P28827	1452 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FAM200B-222	ENST00000515697	ABCC1	P33527	1531 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FAM200B-222	ENST00000515697	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.58	■■■□□ 2.81
FAM200B-222	ENST00000515697	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
FAM200B-222	ENST00000515697	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.57	■■■□□ 2.8
FAM200B-222	ENST00000515697	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.56	■■■□□ 2.8
FAM200B-222	ENST00000515697	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
FAM200B-222	ENST00000515697	ATP10A	O60312	1499 aa		32.54	■■■□□ 2.8
FAM200B-222	ENST00000515697	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FAM200B-222	ENST00000515697	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.51	■■■□□ 2.79
FAM200B-222	ENST00000515697	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FAM200B-222	ENST00000515697	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FAM200B-222	ENST00000515697	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
FAM200B-222	ENST00000515697	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FAM200B-222	ENST00000515697	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FAM200B-222	ENST00000515697	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.46	■■■□□ 2.79
FAM200B-222	ENST00000515697	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.45	■■■□□ 2.79
FAM200B-222	ENST00000515697	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.45	■■■□□ 2.78
FAM200B-222	ENST00000515697	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.44	■■■□□ 2.78
FAM200B-222	ENST00000515697	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.44	■■■□□ 2.78
FAM200B-222	ENST00000515697	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FAM200B-222	ENST00000515697	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FAM200B-222	ENST00000515697	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FAM200B-222	ENST00000515697	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM200B-222	ENST00000515697	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM200B-222	ENST00000515697	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FAM200B-222	ENST00000515697	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FAM200B-222	ENST00000515697	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
FAM200B-222	ENST00000515697	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
FAM200B-222	ENST00000515697	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FAM200B-222	ENST00000515697	MLEC	Q14165	292 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FAM200B-222	ENST00000515697	AGL	P35573	1532 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FAM200B-222	ENST00000515697	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.27	■■■□□ 2.76
FAM200B-222	ENST00000515697	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FAM200B-222	ENST00000515697	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.76
FAM200B-222	ENST00000515697	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FAM200B-222	ENST00000515697	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
FAM200B-222	ENST00000515697	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FAM200B-222	ENST00000515697	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.22	■■■□□ 2.75
FAM200B-222	ENST00000515697	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FAM200B-222	ENST00000515697	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
FAM200B-222	ENST00000515697	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.74
FAM200B-222	ENST00000515697	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FAM200B-222	ENST00000515697	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FAM200B-222	ENST00000515697	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.15	■■■□□ 2.74
FAM200B-222	ENST00000515697	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FAM200B-222	ENST00000515697	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.09	■■■□□ 2.73
FAM200B-222	ENST00000515697	C3	P01024	1663 aa		32.08	■■■□□ 2.73
FAM200B-222	ENST00000515697	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
FAM200B-222	ENST00000515697	A2M	P01023	1474 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FAM200B-222	ENST00000515697	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FAM200B-222	ENST00000515697	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
FAM200B-222	ENST00000515697	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FAM200B-222	ENST00000515697	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
FAM200B-222	ENST00000515697	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FAM200B-222	ENST00000515697	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FAM200B-222	ENST00000515697	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.01	■■■□□ 2.72
FAM200B-222	ENST00000515697	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.01	■■■□□ 2.71
FAM200B-222	ENST00000515697	HSPA2	P54652	639 aa		32	■■■□□ 2.71
FAM200B-222	ENST00000515697	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FAM200B-222	ENST00000515697	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.95	■■■□□ 2.71
FAM200B-222	ENST00000515697	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		31.92	■■■□□ 2.7
FAM200B-222	ENST00000515697	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
FAM200B-222	ENST00000515697	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
FAM200B-222	ENST00000515697	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.91	■■■□□ 2.7
FAM200B-222	ENST00000515697	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
FAM200B-222	ENST00000515697	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.89	■■■□□ 2.7
FAM200B-222	ENST00000515697	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.86	■■■□□ 2.69
FAM200B-222	ENST00000515697	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FAM200B-222	ENST00000515697	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
FAM200B-222	ENST00000515697	NPAT	Q14207	1427 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FAM200B-222	ENST00000515697	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FAM200B-222	ENST00000515697	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FAM200B-222	ENST00000515697	GGT6	Q6P531	493 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAM200B-222	ENST00000515697	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FAM200B-222	ENST00000515697	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FAM200B-222	ENST00000515697	APLP2	Q06481	763 aa		31.77	■■■□□ 2.68
FAM200B-222	ENST00000515697	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.76	■■■□□ 2.68
FAM200B-222	ENST00000515697	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FAM200B-222	ENST00000515697	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FAM200B-222	ENST00000515697	KIF3B	O15066	747 aa		31.72	■■■□□ 2.67
FAM200B-222	ENST00000515697	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		31.7	■■■□□ 2.67
FAM200B-222	ENST00000515697	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.69	■■■□□ 2.66
FAM200B-222	ENST00000515697	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
FAM200B-222	ENST00000515697	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
FAM200B-222	ENST00000515697	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66

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