RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513661.5

GRPEL2-204, Transcript of GrpE like 2, mitochondrial, human

TSL 2 BASIC

Gene GRPEL2, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRPEL2-204	ENST00000513661	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.79	■■■■■ 4.28
GRPEL2-204	ENST00000513661	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.76	■■■■■ 4.28
GRPEL2-204	ENST00000513661	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.73	■■■■■ 4.27
GRPEL2-204	ENST00000513661	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.71	■■■■■ 4.27
GRPEL2-204	ENST00000513661	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		41.71	■■■■■ 4.27
GRPEL2-204	ENST00000513661	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		41.69	■■■■■ 4.26
GRPEL2-204	ENST00000513661	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		41.69	■■■■■ 4.26
GRPEL2-204	ENST00000513661	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	41.68	■■■■■ 4.26
GRPEL2-204	ENST00000513661	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		41.64	■■■■■ 4.26
GRPEL2-204	ENST00000513661	PREX2	Q70Z35	1606 aa		41.62	■■■■■ 4.25
GRPEL2-204	ENST00000513661	CLIP1	P30622	1438 aa		41.61	■■■■■ 4.25
GRPEL2-204	ENST00000513661	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		41.6	■■■■■ 4.25
GRPEL2-204	ENST00000513661	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.6	■■■■■ 4.25
GRPEL2-204	ENST00000513661	KDM5C	P41229	1560 aa		41.59	■■■■■ 4.25
GRPEL2-204	ENST00000513661	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41.59	■■■■■ 4.25
GRPEL2-204	ENST00000513661	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		41.58	■■■■■ 4.25
GRPEL2-204	ENST00000513661	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		41.53	■■■■■ 4.24
GRPEL2-204	ENST00000513661	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		41.53	■■■■■ 4.24
GRPEL2-204	ENST00000513661	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		41.53	■■■■■ 4.24
GRPEL2-204	ENST00000513661	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		41.51	■■■■■ 4.24
GRPEL2-204	ENST00000513661	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		41.51	■■■■■ 4.24
GRPEL2-204	ENST00000513661	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		41.5	■■■■■ 4.23
GRPEL2-204	ENST00000513661	ATP10A	O60312	1499 aa		41.48	■■■■■ 4.23
GRPEL2-204	ENST00000513661	ABCC1	P33527	1531 aa		41.48	■■■■■ 4.23
GRPEL2-204	ENST00000513661	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		41.47	■■■■■ 4.23
GRPEL2-204	ENST00000513661	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		41.47	■■■■■ 4.23
GRPEL2-204	ENST00000513661	ABCA6	Q8N139	1617 aa		41.46	■■■■■ 4.23
GRPEL2-204	ENST00000513661	MLEC	Q14165	292 aa		41.4	■■■■■ 4.22
GRPEL2-204	ENST00000513661	RERE	Q9P2R6	1566 aa		41.35	■■■■■ 4.21
GRPEL2-204	ENST00000513661	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		41.35	■■■■■ 4.21
GRPEL2-204	ENST00000513661	AFAP1	Q8N556	730 aa		41.32	■■■■■ 4.21
GRPEL2-204	ENST00000513661	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		41.3	■■■■■ 4.2
GRPEL2-204	ENST00000513661	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		41.3	■■■■■ 4.2
GRPEL2-204	ENST00000513661	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		41.29	■■■■■ 4.2
GRPEL2-204	ENST00000513661	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		41.28	■■■■■ 4.2
GRPEL2-204	ENST00000513661	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		41.28	■■■■■ 4.2
GRPEL2-204	ENST00000513661	HSPA2	P54652	639 aa		41.21	■■■■■ 4.19
GRPEL2-204	ENST00000513661	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		41.19	■■■■■ 4.18
GRPEL2-204	ENST00000513661	C3	P01024	1663 aa		41.17	■■■■■ 4.18
GRPEL2-204	ENST00000513661	AGL	P35573	1532 aa		41.14	■■■■■ 4.18
GRPEL2-204	ENST00000513661	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	41.14	■■■■■ 4.18
GRPEL2-204	ENST00000513661	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		41.13	■■■■■ 4.17
GRPEL2-204	ENST00000513661	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	41.06	■■■■■ 4.16
GRPEL2-204	ENST00000513661	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	41.05	■■■■■ 4.16
GRPEL2-204	ENST00000513661	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	41.03	■■■■■ 4.16
GRPEL2-204	ENST00000513661	TIAM1	Q13009	1591 aa		41.03	■■■■■ 4.16
GRPEL2-204	ENST00000513661	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	41.01	■■■■■ 4.16
GRPEL2-204	ENST00000513661	FBXO41	Q8TF61	875 aa		41.01	■■■■■ 4.16
GRPEL2-204	ENST00000513661	STRC	Q7RTU9	1775 aa		41.01	■■■■■ 4.16
GRPEL2-204	ENST00000513661	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		41	■■■■■ 4.15
GRPEL2-204	ENST00000513661	ATP7A	Q04656	1500 aa		40.99	■■■■■ 4.15
GRPEL2-204	ENST00000513661	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	40.99	■■■■■ 4.15
GRPEL2-204	ENST00000513661	CEP162	Q5TB80	1403 aa		40.96	■■■■■ 4.15
GRPEL2-204	ENST00000513661	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		40.95	■■■■■ 4.15
GRPEL2-204	ENST00000513661	PLXNC1	O60486	1568 aa		40.95	■■■■■ 4.15
GRPEL2-204	ENST00000513661	MROH2A	A6NES4	1674 aa		40.94	■■■■■ 4.14
GRPEL2-204	ENST00000513661	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		40.93	■■■■■ 4.14
GRPEL2-204	ENST00000513661	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		40.92	■■■■■ 4.14
GRPEL2-204	ENST00000513661	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		40.92	■■■■■ 4.14
GRPEL2-204	ENST00000513661	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		40.9	■■■■■ 4.14
GRPEL2-204	ENST00000513661	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	40.87	■■■■■ 4.13
GRPEL2-204	ENST00000513661	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	40.85	■■■■■ 4.13
GRPEL2-204	ENST00000513661	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		40.85	■■■■■ 4.13
GRPEL2-204	ENST00000513661	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	40.84	■■■■■ 4.13
GRPEL2-204	ENST00000513661	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	40.84	■■■■■ 4.13
GRPEL2-204	ENST00000513661	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		40.82	■■■■■ 4.12
GRPEL2-204	ENST00000513661	A2M	P01023	1474 aa		40.77	■■■■■ 4.12
GRPEL2-204	ENST00000513661	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	40.74	■■■■■ 4.11
GRPEL2-204	ENST00000513661	MBD5	Q9P267	1494 aa		40.72	■■■■■ 4.11
GRPEL2-204	ENST00000513661	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	40.71	■■■■■ 4.11
GRPEL2-204	ENST00000513661	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		40.67	■■■■■ 4.1
GRPEL2-204	ENST00000513661	NCOA2	Q15596	1464 aa		40.67	■■■■■ 4.1
GRPEL2-204	ENST00000513661	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	40.66	■■■■■ 4.1
GRPEL2-204	ENST00000513661	NPAT	Q14207	1427 aa		40.64	■■■■■ 4.1
GRPEL2-204	ENST00000513661	CERK	Q8TCT0	537 aa		40.63	■■■■■ 4.09
GRPEL2-204	ENST00000513661	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		40.63	■■■■■ 4.09
GRPEL2-204	ENST00000513661	ZMYM3	Q14202	1370 aa		40.59	■■■■■ 4.09
GRPEL2-204	ENST00000513661	NCOA1	Q15788	1441 aa		40.59	■■■■■ 4.09
GRPEL2-204	ENST00000513661	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		40.57	■■■■■ 4.09
GRPEL2-204	ENST00000513661	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		40.57	■■■■■ 4.08
GRPEL2-204	ENST00000513661	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		40.54	■■■■■ 4.08
GRPEL2-204	ENST00000513661	PTPRT	O14522	1441 aa		40.54	■■■■■ 4.08
GRPEL2-204	ENST00000513661	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	40.52	■■■■■ 4.08
GRPEL2-204	ENST00000513661	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		40.51	■■■■■ 4.08
GRPEL2-204	ENST00000513661	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		40.5	■■■■■ 4.07
GRPEL2-204	ENST00000513661	PTPRK	Q15262	1439 aa		40.5	■■■■■ 4.07
GRPEL2-204	ENST00000513661	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		40.48	■■■■■ 4.07
GRPEL2-204	ENST00000513661	GGT6	Q6P531	493 aa		40.46	■■■■■ 4.07
GRPEL2-204	ENST00000513661	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		40.45	■■■■■ 4.07
GRPEL2-204	ENST00000513661	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.45	■■■■■ 4.07
GRPEL2-204	ENST00000513661	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	40.41	■■■■■ 4.06
GRPEL2-204	ENST00000513661	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		40.39	■■■■■ 4.06
GRPEL2-204	ENST00000513661	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		40.37	■■■■■ 4.05
GRPEL2-204	ENST00000513661	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		40.35	■■■■■ 4.05
GRPEL2-204	ENST00000513661	PLA2R1	Q13018	1463 aa		40.34	■■■■■ 4.05
GRPEL2-204	ENST00000513661	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		40.31	■■■■■ 4.04
GRPEL2-204	ENST00000513661	MAP3K1	Q13233	1512 aa		40.31	■■■■■ 4.04
GRPEL2-204	ENST00000513661	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	40.31	■■■■■ 4.04
GRPEL2-204	ENST00000513661	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	40.3	■■■■■ 4.04
GRPEL2-204	ENST00000513661	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		40.29	■■■■■ 4.04

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