RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491937.5

RPS7-209, Transcript of ribosomal protein S7, human

TSL 2

Gene RPS7, Length 987 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS7-209	ENST00000491937	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		43.28	■■■■■ 4.52
RPS7-209	ENST00000491937	KIF14	Q15058	1648 aa		43.26	■■■■■ 4.52
RPS7-209	ENST00000491937	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	43.24	■■■■■ 4.51
RPS7-209	ENST00000491937	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.24	■■■■■ 4.51
RPS7-209	ENST00000491937	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	43.24	■■■■■ 4.51
RPS7-209	ENST00000491937	CLIP1	P30622	1438 aa		43.21	■■■■■ 4.51
RPS7-209	ENST00000491937	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		43.17	■■■■■ 4.5
RPS7-209	ENST00000491937	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		43.16	■■■■■ 4.5
RPS7-209	ENST00000491937	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	43.16	■■■■■ 4.5
RPS7-209	ENST00000491937	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.12	■■■■■ 4.49
RPS7-209	ENST00000491937	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		43.1	■■■■■ 4.49
RPS7-209	ENST00000491937	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		43.08	■■■■■ 4.49
RPS7-209	ENST00000491937	ATP10A	O60312	1499 aa		43.07	■■■■■ 4.49
RPS7-209	ENST00000491937	MLEC	Q14165	292 aa		43.06	■■■■■ 4.48
RPS7-209	ENST00000491937	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		43.06	■■■■■ 4.48
RPS7-209	ENST00000491937	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.06	■■■■■ 4.48
RPS7-209	ENST00000491937	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.05	■■■■■ 4.48
RPS7-209	ENST00000491937	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		43.01	■■■■■ 4.48
RPS7-209	ENST00000491937	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.99	■■■■■ 4.47
RPS7-209	ENST00000491937	KDM5C	P41229	1560 aa		42.98	■■■■■ 4.47
RPS7-209	ENST00000491937	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.95	■■■■■ 4.47
RPS7-209	ENST00000491937	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		42.94	■■■■■ 4.47
RPS7-209	ENST00000491937	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.93	■■■■■ 4.46
RPS7-209	ENST00000491937	PREX2	Q70Z35	1606 aa		42.92	■■■■■ 4.46
RPS7-209	ENST00000491937	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		42.91	■■■■■ 4.46
RPS7-209	ENST00000491937	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.88	■■■■■ 4.45
RPS7-209	ENST00000491937	HSPA2	P54652	639 aa		42.86	■■■■■ 4.45
RPS7-209	ENST00000491937	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.83	■■■■■ 4.45
RPS7-209	ENST00000491937	ABCC1	P33527	1531 aa		42.83	■■■■■ 4.45
RPS7-209	ENST00000491937	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.81	■■■■■ 4.44
RPS7-209	ENST00000491937	FBXO41	Q8TF61	875 aa		42.8	■■■■■ 4.44
RPS7-209	ENST00000491937	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.78	■■■■■ 4.44
RPS7-209	ENST00000491937	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.78	■■■■■ 4.44
RPS7-209	ENST00000491937	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.76	■■■■■ 4.44
RPS7-209	ENST00000491937	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.76	■■■■■ 4.44
RPS7-209	ENST00000491937	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.75	■■■■■ 4.43
RPS7-209	ENST00000491937	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.68	■■■■■ 4.42
RPS7-209	ENST00000491937	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		42.66	■■■■■ 4.42
RPS7-209	ENST00000491937	AGL	P35573	1532 aa		42.64	■■■■■ 4.42
RPS7-209	ENST00000491937	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.62	■■■■■ 4.41
RPS7-209	ENST00000491937	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.61	■■■■■ 4.41
RPS7-209	ENST00000491937	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.61	■■■■■ 4.41
RPS7-209	ENST00000491937	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.6	■■■■■ 4.41
RPS7-209	ENST00000491937	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.56	■■■■■ 4.4
RPS7-209	ENST00000491937	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.53	■■■■■ 4.4
RPS7-209	ENST00000491937	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.52	■■■■■ 4.4
RPS7-209	ENST00000491937	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.51	■■■■■ 4.4
RPS7-209	ENST00000491937	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.5	■■■■■ 4.39
RPS7-209	ENST00000491937	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.48	■■■■■ 4.39
RPS7-209	ENST00000491937	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.48	■■■■■ 4.39
RPS7-209	ENST00000491937	C3	P01024	1663 aa		42.47	■■■■■ 4.39
RPS7-209	ENST00000491937	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.47	■■■■■ 4.39
RPS7-209	ENST00000491937	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.47	■■■■■ 4.39
RPS7-209	ENST00000491937	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.46	■■■■■ 4.39	4e-7	■■■■□ 26.1
RPS7-209	ENST00000491937	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.46	■■■■■ 4.39
RPS7-209	ENST00000491937	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.42	■■■■■ 4.38
RPS7-209	ENST00000491937	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.39	■■■■■ 4.38
RPS7-209	ENST00000491937	CERK	Q8TCT0	537 aa		42.36	■■■■■ 4.37
RPS7-209	ENST00000491937	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.35	■■■■■ 4.37
RPS7-209	ENST00000491937	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.35	■■■■■ 4.37
RPS7-209	ENST00000491937	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		42.34	■■■■■ 4.37
RPS7-209	ENST00000491937	CEP162	Q5TB80	1403 aa		42.34	■■■■■ 4.37
RPS7-209	ENST00000491937	STRC	Q7RTU9	1775 aa		42.33	■■■■■ 4.37
RPS7-209	ENST00000491937	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.31	■■■■■ 4.36
RPS7-209	ENST00000491937	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.3	■■■■■ 4.36
RPS7-209	ENST00000491937	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.27	■■■■■ 4.36
RPS7-209	ENST00000491937	A2M	P01023	1474 aa		42.27	■■■■■ 4.36
RPS7-209	ENST00000491937	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.26	■■■■■ 4.36
RPS7-209	ENST00000491937	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.22	■■■■■ 4.35
RPS7-209	ENST00000491937	NPAT	Q14207	1427 aa		42.2	■■■■■ 4.35
RPS7-209	ENST00000491937	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.2	■■■■■ 4.35
RPS7-209	ENST00000491937	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.17	■■■■■ 4.34
RPS7-209	ENST00000491937	PTPRT	O14522	1441 aa		42.15	■■■■■ 4.34
RPS7-209	ENST00000491937	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.15	■■■■■ 4.34
RPS7-209	ENST00000491937	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.34
RPS7-209	ENST00000491937	GGT6	Q6P531	493 aa		42.11	■■■■■ 4.33
RPS7-209	ENST00000491937	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.1	■■■■■ 4.33
RPS7-209	ENST00000491937	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.08	■■■■■ 4.33
RPS7-209	ENST00000491937	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.07	■■■■■ 4.33
RPS7-209	ENST00000491937	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.03	■■■■■ 4.32
RPS7-209	ENST00000491937	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.01	■■■■■ 4.32
RPS7-209	ENST00000491937	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42	■■■■■ 4.31
RPS7-209	ENST00000491937	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42	■■■■■ 4.31
RPS7-209	ENST00000491937	PTPRK	Q15262	1439 aa		42	■■■■■ 4.31
RPS7-209	ENST00000491937	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	41.98	■■■■■ 4.31
RPS7-209	ENST00000491937	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		41.97	■■■■■ 4.31
RPS7-209	ENST00000491937	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	41.93	■■■■■ 4.3
RPS7-209	ENST00000491937	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		41.93	■■■■■ 4.3
RPS7-209	ENST00000491937	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		41.92	■■■■■ 4.3
RPS7-209	ENST00000491937	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	41.9	■■■■■ 4.3
RPS7-209	ENST00000491937	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		41.88	■■■■■ 4.3
RPS7-209	ENST00000491937	PLA2R1	Q13018	1463 aa		41.85	■■■■■ 4.29
RPS7-209	ENST00000491937	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.85	■■■■■ 4.29
RPS7-209	ENST00000491937	KIF3B	O15066	747 aa		41.85	■■■■■ 4.29
RPS7-209	ENST00000491937	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		41.85	■■■■■ 4.29
RPS7-209	ENST00000491937	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		41.84	■■■■■ 4.29
RPS7-209	ENST00000491937	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		41.84	■■■■■ 4.29
RPS7-209	ENST00000491937	PKD2	Q13563	968 aa		41.79	■■■■■ 4.28
RPS7-209	ENST00000491937	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		41.79	■■■■■ 4.28
RPS7-209	ENST00000491937	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		41.78	■■■■■ 4.28

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