RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	10.87	□□□□□ -0.67	1e-7	■□□□□ 10.5
RABGGTB-212	ENST00000491266	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	IER5L	Q5T953	404 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMARCA2	P51531	1590 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	HMGXB3	Q12766	1538 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	MFSD10	Q14728	455 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	OCEL1	Q9H607	264 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	P3H3	Q8IVL6	736 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR70	Q9NW82	654 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	POTEI	P0CG38	1075 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDE4A	P27815	886 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	MICALL2	Q8IY33	904 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	NBR1	Q14596	966 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	POTEF	A5A3E0	1075 aa		10.72	□□□□□ -0.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC39A7	Q92504	469 aa		10.72	□□□□□ -0.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLCG2	P16885	1265 aa		10.71	□□□□□ -0.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	E2F4	Q16254	413 aa		10.7	□□□□□ -0.7
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
RABGGTB-212	ENST00000491266	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		10.7	□□□□□ -0.7
RABGGTB-212	ENST00000491266	C7	P10643	843 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAMK2B	Q13554	666 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
RABGGTB-212	ENST00000491266	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF3C	O14782	793 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RABGGTB-212	ENST00000491266	LHX8	Q68G74	356 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RABGGTB-212	ENST00000491266	METRN	Q9UJH8	293 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEC24B	O95487	1268 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOXK1	P85037	733 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	NES	P48681	1621 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	DSG2	Q14126	1118 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	CFTR	P13569	1480 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RABGGTB-212	ENST00000491266		G3V3G9	751 aa		10.59	□□□□□ -0.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		10.59	□□□□□ -0.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2orf72	A6NCS6	295 aa		10.58	□□□□□ -0.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMC2	Q8TDI7	906 aa		10.58	□□□□□ -0.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	10.55	□□□□□ -0.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		10.54	□□□□□ -0.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		10.54	□□□□□ -0.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLPP6	Q8IY26	295 aa		10.53	□□□□□ -0.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEMA3E	O15041	775 aa		10.5	□□□□□ -0.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	10.49	□□□□□ -0.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABCC8	Q09428	1581 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDIA6	Q15084	440 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPYSL4	O14531	572 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	POTEJ	P0CG39	1038 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	OXER1	Q8TDS5	423 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	POTEB2	H3BUK9	544 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	CUX1	P39880	1505 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYNJ1	O43426	1573 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC34A2	O95436	690 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP3K9	P80192	1104 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	10.35	□□□□□ -0.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOPBP1	Q92547	1522 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRDM2	Q13029	1718 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTGER2	P43116	358 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOP2B	Q02880	1626 aa		10.32	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERCC6	Q03468	1493 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBC1D12	O60347	775 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOGA1	O94964	1423 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76

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