RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491236.1

RBM3-210, Transcript of RNA binding motif protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene RBM3, Length 729 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3-210ENST00000491236 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.99■■■□□ 2.39
RBM3-210ENST00000491236 PTPRMP28827 1452 aa29.99■■■□□ 2.39
RBM3-210ENST00000491236 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
RBM3-210ENST00000491236 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.98■■■□□ 2.39
RBM3-210ENST00000491236 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.98■■■□□ 2.39
RBM3-210ENST00000491236 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.96■■■□□ 2.39
RBM3-210ENST00000491236 RICTORQ6R327 1708 aa29.96■■■□□ 2.39
RBM3-210ENST00000491236 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.95■■■□□ 2.39
RBM3-210ENST00000491236 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.94■■■□□ 2.38
RBM3-210ENST00000491236 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
RBM3-210ENST00000491236 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.91■■■□□ 2.38
RBM3-210ENST00000491236 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.91■■■□□ 2.38
RBM3-210ENST00000491236 ATP10AO60312 1499 aa29.9■■■□□ 2.38
RBM3-210ENST00000491236 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.9■■■□□ 2.38
RBM3-210ENST00000491236 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.86■■■□□ 2.37
RBM3-210ENST00000491236 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.85■■■□□ 2.37
RBM3-210ENST00000491236 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.85■■■□□ 2.37
RBM3-210ENST00000491236 CEP162Q5TB80 1403 aa29.83■■■□□ 2.37
RBM3-210ENST00000491236 MADDQ8WXG6 1647 aa29.82■■■□□ 2.36
RBM3-210ENST00000491236 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
RBM3-210ENST00000491236 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.82■■■□□ 2.36
RBM3-210ENST00000491236 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.79■■■□□ 2.36
RBM3-210ENST00000491236 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.79■■■□□ 2.36
RBM3-210ENST00000491236 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.78■■■□□ 2.36
RBM3-210ENST00000491236 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.75■■■□□ 2.35
RBM3-210ENST00000491236 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
RBM3-210ENST00000491236 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.74■■■□□ 2.35
RBM3-210ENST00000491236 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.73■■■□□ 2.35
RBM3-210ENST00000491236 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
RBM3-210ENST00000491236 KDM5CP41229 1560 aa29.72■■■□□ 2.35
RBM3-210ENST00000491236 PREX2Q70Z35 1606 aa29.71■■■□□ 2.35
RBM3-210ENST00000491236 ABCC1P33527 1531 aa29.71■■■□□ 2.35
RBM3-210ENST00000491236 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
RBM3-210ENST00000491236 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
RBM3-210ENST00000491236 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.68■■■□□ 2.34
RBM3-210ENST00000491236 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
RBM3-210ENST00000491236 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
RBM3-210ENST00000491236 HSPA2P54652 639 aa29.66■■■□□ 2.34
RBM3-210ENST00000491236 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.62■■■□□ 2.33
RBM3-210ENST00000491236 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.62■■■□□ 2.33
RBM3-210ENST00000491236 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.62■■■□□ 2.33
RBM3-210ENST00000491236 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.61■■■□□ 2.33
RBM3-210ENST00000491236 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.6■■■□□ 2.33
RBM3-210ENST00000491236 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.58■■■□□ 2.33
RBM3-210ENST00000491236 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
RBM3-210ENST00000491236 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.57■■■□□ 2.32
RBM3-210ENST00000491236 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.56■■■□□ 2.32
RBM3-210ENST00000491236 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.56■■■□□ 2.32
RBM3-210ENST00000491236 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.54■■■□□ 2.32
RBM3-210ENST00000491236 REREQ9P2R6 1566 aa29.53■■■□□ 2.32
RBM3-210ENST00000491236 AGLP35573 1532 aa29.53■■■□□ 2.32
RBM3-210ENST00000491236 ABCA6Q8N139 1617 aa29.53■■■□□ 2.32
RBM3-210ENST00000491236 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.5■■■□□ 2.31
RBM3-210ENST00000491236 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.5■■■□□ 2.31
RBM3-210ENST00000491236 NCOA2Q15596 1464 aa29.45■■■□□ 2.31
RBM3-210ENST00000491236 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.45■■■□□ 2.31
RBM3-210ENST00000491236 GGT6Q6P531 493 aa29.45■■■□□ 2.31
RBM3-210ENST00000491236 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.45■■■□□ 2.3
RBM3-210ENST00000491236 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.44■■■□□ 2.3
RBM3-210ENST00000491236 TIAM1Q13009 1591 aa29.43■■■□□ 2.3
RBM3-210ENST00000491236 ATP7AQ04656 1500 aa29.42■■■□□ 2.3
RBM3-210ENST00000491236 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.42■■■□□ 2.3
RBM3-210ENST00000491236 A2MP01023 1474 aa29.42■■■□□ 2.3
RBM3-210ENST00000491236 APLP2Q06481 763 aa29.41■■■□□ 2.3
RBM3-210ENST00000491236 MBD5Q9P267 1494 aa29.4■■■□□ 2.3
RBM3-210ENST00000491236 TSPY4P0CV99 314 aa29.38■■■□□ 2.29
RBM3-210ENST00000491236 TSPY10P0CW01 314 aa29.38■■■□□ 2.29
RBM3-210ENST00000491236 FBXO41Q8TF61 875 aa29.37■■■□□ 2.29
RBM3-210ENST00000491236 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.37■■■□□ 2.29
RBM3-210ENST00000491236 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
RBM3-210ENST00000491236 ZMYM3Q14202 1370 aa29.36■■■□□ 2.29
RBM3-210ENST00000491236 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.36■■■□□ 2.29
RBM3-210ENST00000491236 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.36■■■□□ 2.29
RBM3-210ENST00000491236 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.35■■■□□ 2.29
RBM3-210ENST00000491236 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
RBM3-210ENST00000491236 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
RBM3-210ENST00000491236 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.3■■■□□ 2.28
RBM3-210ENST00000491236 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.3■■■□□ 2.28
RBM3-210ENST00000491236 KIF3BO15066 747 aa29.3■■■□□ 2.28
RBM3-210ENST00000491236 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
RBM3-210ENST00000491236 MAP3K1Q13233 1512 aa29.25■■■□□ 2.27
RBM3-210ENST00000491236 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.25■■■□□ 2.27
RBM3-210ENST00000491236 PLXNC1O60486 1568 aa29.23■■■□□ 2.27
RBM3-210ENST00000491236 NPATQ14207 1427 aa29.23■■■□□ 2.27
RBM3-210ENST00000491236 CERKQ8TCT0 537 aa29.22■■■□□ 2.27
RBM3-210ENST00000491236 C3P01024 1663 aa29.2■■■□□ 2.26
RBM3-210ENST00000491236 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
RBM3-210ENST00000491236 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.18■■■□□ 2.26
RBM3-210ENST00000491236 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.17■■■□□ 2.26
RBM3-210ENST00000491236 MIA2Q96PC5 1412 aa29.16■■■□□ 2.26
RBM3-210ENST00000491236 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.14■■■□□ 2.26
RBM3-210ENST00000491236 PTPRKQ15262 1439 aa29.13■■■□□ 2.25
RBM3-210ENST00000491236 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.11■■■□□ 2.25
RBM3-210ENST00000491236 PTPRTO14522 1441 aa29.09■■■□□ 2.25
RBM3-210ENST00000491236 MROH2AA6NES4 1674 aa29.09■■■□□ 2.25
RBM3-210ENST00000491236 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
RBM3-210ENST00000491236 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
RBM3-210ENST00000491236 NCOA1Q15788 1441 aa29.06■■■□□ 2.24
RBM3-210ENST00000491236 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.06■■■□□ 2.24
RBM3-210ENST00000491236 PKD2Q13563 968 aa29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms