RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491036.2

LAMA5-210, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 728 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-210ENST00000491036 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
LAMA5-210ENST00000491036 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.25■■□□□ 1.79
LAMA5-210ENST00000491036 MADDQ8WXG6 1647 aa26.25■■□□□ 1.79
LAMA5-210ENST00000491036 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.23■■□□□ 1.79
LAMA5-210ENST00000491036 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.22■■□□□ 1.79
LAMA5-210ENST00000491036 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.22■■□□□ 1.79
LAMA5-210ENST00000491036 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.21■■□□□ 1.79
LAMA5-210ENST00000491036 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.21■■□□□ 1.79
LAMA5-210ENST00000491036 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.21■■□□□ 1.79
LAMA5-210ENST00000491036 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
LAMA5-210ENST00000491036 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.17■■□□□ 1.78
LAMA5-210ENST00000491036 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.16■■□□□ 1.78
LAMA5-210ENST00000491036 MLECQ14165 292 aa26.14■■□□□ 1.78
LAMA5-210ENST00000491036 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.13■■□□□ 1.77
LAMA5-210ENST00000491036 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.12■■□□□ 1.77
LAMA5-210ENST00000491036 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.11■■□□□ 1.77
LAMA5-210ENST00000491036 AFAP1Q8N556 730 aa26.1■■□□□ 1.77
LAMA5-210ENST00000491036 ATP10AO60312 1499 aa26.1■■□□□ 1.77
LAMA5-210ENST00000491036 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.1■■□□□ 1.77
LAMA5-210ENST00000491036 PREX2Q70Z35 1606 aa26.1■■□□□ 1.77
LAMA5-210ENST00000491036 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.06■■□□□ 1.76
LAMA5-210ENST00000491036 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.06■■□□□ 1.76
LAMA5-210ENST00000491036 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.06■■□□□ 1.76
LAMA5-210ENST00000491036 KDM5CP41229 1560 aa26.04■■□□□ 1.76
LAMA5-210ENST00000491036 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
LAMA5-210ENST00000491036 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.01■■□□□ 1.75
LAMA5-210ENST00000491036 ABCC1P33527 1531 aa26■■□□□ 1.75
LAMA5-210ENST00000491036 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
LAMA5-210ENST00000491036 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.98■■□□□ 1.75
LAMA5-210ENST00000491036 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.98■■□□□ 1.75
LAMA5-210ENST00000491036 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.98■■□□□ 1.75
LAMA5-210ENST00000491036 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.96■■□□□ 1.75
LAMA5-210ENST00000491036 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.95■■□□□ 1.74
LAMA5-210ENST00000491036 ABCA6Q8N139 1617 aa25.94■■□□□ 1.74
LAMA5-210ENST00000491036 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
LAMA5-210ENST00000491036 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.92■■□□□ 1.74
LAMA5-210ENST00000491036 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.9■■□□□ 1.74
LAMA5-210ENST00000491036 CEP162Q5TB80 1403 aa25.9■■□□□ 1.74
LAMA5-210ENST00000491036 HSPA2P54652 639 aa25.9■■□□□ 1.74
LAMA5-210ENST00000491036 REREQ9P2R6 1566 aa25.89■■□□□ 1.73
LAMA5-210ENST00000491036 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.89■■□□□ 1.73
LAMA5-210ENST00000491036 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.88■■□□□ 1.73
LAMA5-210ENST00000491036 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
LAMA5-210ENST00000491036 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
LAMA5-210ENST00000491036 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
LAMA5-210ENST00000491036 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.87■■□□□ 1.73
LAMA5-210ENST00000491036 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
LAMA5-210ENST00000491036 AGLP35573 1532 aa25.82■■□□□ 1.72
LAMA5-210ENST00000491036 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
LAMA5-210ENST00000491036 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.8■■□□□ 1.72
LAMA5-210ENST00000491036 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.8■■□□□ 1.72
LAMA5-210ENST00000491036 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.8■■□□□ 1.72
LAMA5-210ENST00000491036 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.78■■□□□ 1.72
LAMA5-210ENST00000491036 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.77■■□□□ 1.72
LAMA5-210ENST00000491036 TIAM1Q13009 1591 aa25.77■■□□□ 1.72
LAMA5-210ENST00000491036 C3P01024 1663 aa25.76■■□□□ 1.71
LAMA5-210ENST00000491036 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
LAMA5-210ENST00000491036 ATP7AQ04656 1500 aa25.74■■□□□ 1.71
LAMA5-210ENST00000491036 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
LAMA5-210ENST00000491036 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
LAMA5-210ENST00000491036 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
LAMA5-210ENST00000491036 FBXO41Q8TF61 875 aa25.7■■□□□ 1.7
LAMA5-210ENST00000491036 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.7■■□□□ 1.7
LAMA5-210ENST00000491036 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.67■■□□□ 1.7
LAMA5-210ENST00000491036 A2MP01023 1474 aa25.66■■□□□ 1.7
LAMA5-210ENST00000491036 NCOA2Q15596 1464 aa25.65■■□□□ 1.7
LAMA5-210ENST00000491036 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.64■■□□□ 1.69
LAMA5-210ENST00000491036 MBD5Q9P267 1494 aa25.63■■□□□ 1.69
LAMA5-210ENST00000491036 MROH2AA6NES4 1674 aa25.62■■□□□ 1.69
LAMA5-210ENST00000491036 PLXNC1O60486 1568 aa25.62■■□□□ 1.69
LAMA5-210ENST00000491036 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.62■■□□□ 1.69
LAMA5-210ENST00000491036 STRCQ7RTU9 1775 aa25.6■■□□□ 1.69
LAMA5-210ENST00000491036 GGT6Q6P531 493 aa25.6■■□□□ 1.69
LAMA5-210ENST00000491036 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
LAMA5-210ENST00000491036 ZMYM3Q14202 1370 aa25.58■■□□□ 1.69
LAMA5-210ENST00000491036 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.57■■□□□ 1.68
LAMA5-210ENST00000491036 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.56■■□□□ 1.68
LAMA5-210ENST00000491036 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.56■■□□□ 1.68
LAMA5-210ENST00000491036 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.54■■□□□ 1.68
LAMA5-210ENST00000491036 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.53■■□□□ 1.68
LAMA5-210ENST00000491036 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.52■■□□□ 1.68
LAMA5-210ENST00000491036 CERKQ8TCT0 537 aa25.52■■□□□ 1.68
LAMA5-210ENST00000491036 NPATQ14207 1427 aa25.52■■□□□ 1.68
LAMA5-210ENST00000491036 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
LAMA5-210ENST00000491036 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.49■■□□□ 1.67
LAMA5-210ENST00000491036 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
LAMA5-210ENST00000491036 KIF3BO15066 747 aa25.46■■□□□ 1.67
LAMA5-210ENST00000491036 TSPY4P0CV99 314 aa25.46■■□□□ 1.67
LAMA5-210ENST00000491036 TSPY10P0CW01 314 aa25.46■■□□□ 1.67
LAMA5-210ENST00000491036 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.46■■□□□ 1.67
LAMA5-210ENST00000491036 MAP3K1Q13233 1512 aa25.46■■□□□ 1.67
LAMA5-210ENST00000491036 PTPRKQ15262 1439 aa25.44■■□□□ 1.66
LAMA5-210ENST00000491036 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.43■■□□□ 1.66
LAMA5-210ENST00000491036 PTPRTO14522 1441 aa25.43■■□□□ 1.66
LAMA5-210ENST00000491036 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.42■■□□□ 1.66
LAMA5-210ENST00000491036 NCOA1Q15788 1441 aa25.41■■□□□ 1.66
LAMA5-210ENST00000491036 APLP2Q06481 763 aa25.4■■□□□ 1.66
LAMA5-210ENST00000491036 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
LAMA5-210ENST00000491036 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.37■■□□□ 1.65
LAMA5-210ENST00000491036 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
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