RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490751.1

LDB1-204, Transcript of LIM domain binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene LDB1, Length 762 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1-204ENST00000490751 ARHGAP5Q13017 1502 aa50.57■■■■■ 5.69
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LDB1-204ENST00000490751 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa50.5■■■■■ 5.68
LDB1-204ENST00000490751 PREX2Q70Z35 1606 aa50.47■■■■■ 5.67
LDB1-204ENST00000490751 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa50.46■■■■■ 5.67
LDB1-204ENST00000490751 MAGI2Q86UL8 1455 aa50.44■■■■■ 5.66
LDB1-204ENST00000490751 ADAMTSL3P82987 1691 aa50.41■■■■■ 5.66
LDB1-204ENST00000490751 YEATS2Q9ULM3 1422 aa50.41■■■■■ 5.66
LDB1-204ENST00000490751 BCORL1Q5H9F3 1711 aa50.39■■■■■ 5.66
LDB1-204ENST00000490751 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP50.39■■■■■ 5.66
LDB1-204ENST00000490751 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa50.38■■■■■ 5.66
LDB1-204ENST00000490751 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa50.34■■■■■ 5.65
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LDB1-204ENST00000490751 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa50.27■■■■■ 5.64
LDB1-204ENST00000490751 ABCC1P33527 1531 aa50.26■■■■■ 5.64
LDB1-204ENST00000490751 KDM5CP41229 1560 aa50.26■■■■■ 5.64
LDB1-204ENST00000490751 MTUS2Q5JR59 1369 aa50.24■■■■■ 5.63
LDB1-204ENST00000490751 MADDQ8WXG6 1647 aa50.24■■■■■ 5.63
LDB1-204ENST00000490751 AFAP1Q8N556 730 aa50.21■■■■■ 5.63
LDB1-204ENST00000490751 ITSN2Q9NZM3 1697 aa50.2■■■■■ 5.63
LDB1-204ENST00000490751 PTPRMP28827 1452 aa50.19■■■■■ 5.62
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LDB1-204ENST00000490751 ATP10AO60312 1499 aa50.16■■■■■ 5.62
LDB1-204ENST00000490751 HECW2Q9P2P5 1572 aa50.16■■■■■ 5.62
LDB1-204ENST00000490751 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa50.14■■■■■ 5.62
LDB1-204ENST00000490751 C9orf84Q5VXU9 1444 aa50.11■■■■■ 5.61
LDB1-204ENST00000490751 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa50.11■■■■■ 5.61
LDB1-204ENST00000490751 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa50.1■■■■■ 5.61
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LDB1-204ENST00000490751 MLH3Q9UHC1 1453 aa50.04■■■■■ 5.6
LDB1-204ENST00000490751 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa50.04■■■■■ 5.6
LDB1-204ENST00000490751 VPS8Q8N3P4 1428 aa50.02■■■■■ 5.6
LDB1-204ENST00000490751 SYCP2Q9BX26 1530 aa50■■■■■ 5.59
LDB1-204ENST00000490751 ABCA6Q8N139 1617 aa50■■■■■ 5.59
LDB1-204ENST00000490751 TIAM1Q13009 1591 aa49.99■■■■■ 5.59
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LDB1-204ENST00000490751 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP49.98■■■■■ 5.59
LDB1-204ENST00000490751 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa49.94■■■■■ 5.59
LDB1-204ENST00000490751 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa49.92■■■■■ 5.58
LDB1-204ENST00000490751 REREQ9P2R6 1566 aa49.92■■■■■ 5.58
LDB1-204ENST00000490751 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa49.9■■■■■ 5.58
LDB1-204ENST00000490751 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa49.87■■■■■ 5.57
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LDB1-204ENST00000490751 AGLP35573 1532 aa49.74■■■■■ 5.55
LDB1-204ENST00000490751 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP49.73■■■■■ 5.55
LDB1-204ENST00000490751 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa49.72■■■■■ 5.55
LDB1-204ENST00000490751 ATP7AQ04656 1500 aa49.71■■■■■ 5.55
LDB1-204ENST00000490751 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP49.7■■■■■ 5.55
LDB1-204ENST00000490751 MAP3K1Q13233 1512 aa49.67■■■■■ 5.54
LDB1-204ENST00000490751 LMTK3Q96Q04 1460 aa49.63■■■■■ 5.54
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LDB1-204ENST00000490751 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa49.43■■■■■ 5.5
LDB1-204ENST00000490751 C3P01024 1663 aa49.42■■■■■ 5.5
LDB1-204ENST00000490751 PREX1Q8TCU6 1659 aa49.39■■■■■ 5.5
LDB1-204ENST00000490751 APLP2Q06481 763 aa49.37■■■■■ 5.49
LDB1-204ENST00000490751 ARHGEF5Q12774 1597 aa49.36■■■■■ 5.49
LDB1-204ENST00000490751 CNTLNQ9NXG0 1405 aa49.35■■■■■ 5.49
LDB1-204ENST00000490751 HSPA2P54652 639 aa49.35■■■■■ 5.49
LDB1-204ENST00000490751 RSPH4AQ5TD94 716 aa49.35■■■■■ 5.49
LDB1-204ENST00000490751 MYOM3Q5VTT5 1437 aa49.32■■■■■ 5.49
LDB1-204ENST00000490751 MROH2AA6NES4 1674 aa49.28■■■■■ 5.48
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LDB1-204ENST00000490751 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa49.19■■■■■ 5.47
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LDB1-204ENST00000490751 TSPY10P0CW01 314 aa49.18■■■■■ 5.46
LDB1-204ENST00000490751 ZMYM3Q14202 1370 aa49.13■■■■■ 5.45
LDB1-204ENST00000490751 MAST1Q9Y2H9 1570 aa49.12■■■■■ 5.45
LDB1-204ENST00000490751 PPP6R1Q9UPN7 881 aa49.06■■■■■ 5.44
LDB1-204ENST00000490751 NPATQ14207 1427 aa49.05■■■■■ 5.44
LDB1-204ENST00000490751 PTPN23Q9H3S7 1636 aa49.05■■■■■ 5.44
LDB1-204ENST00000490751 KIF3BO15066 747 aa49.04■■■■■ 5.44
LDB1-204ENST00000490751 FGD6Q6ZV73 1430 aa48.95■■■■■ 5.43
LDB1-204ENST00000490751 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP48.94■■■■■ 5.43
LDB1-204ENST00000490751 CROCC2H7BZ55 1655 aa48.93■■■■■ 5.42
LDB1-204ENST00000490751 PTPRKQ15262 1439 aa48.92■■■■■ 5.42
LDB1-204ENST00000490751 STRCQ7RTU9 1775 aa48.92■■■■■ 5.42
LDB1-204ENST00000490751 FAM135AQ9P2D6 1515 aa48.9■■■■■ 5.42
LDB1-204ENST00000490751 KDM5DQ9BY66 1539 aa48.89■■■■■ 5.42
LDB1-204ENST00000490751 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP48.89■■■■■ 5.42
LDB1-204ENST00000490751 ABCC5O15440 1437 aa48.86■■■■■ 5.41
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