RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487411.5

STX4-210, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene STX4, Length 1,290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-210ENST00000487411 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.1■■■■□ 3.37
STX4-210ENST00000487411 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.09■■■■□ 3.37
STX4-210ENST00000487411 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.08■■■■□ 3.37
STX4-210ENST00000487411 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.08■■■■□ 3.37
STX4-210ENST00000487411 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.08■■■■□ 3.37
STX4-210ENST00000487411 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.06■■■■□ 3.36
STX4-210ENST00000487411 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.05■■■■□ 3.36
STX4-210ENST00000487411 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.03■■■■□ 3.36
STX4-210ENST00000487411 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.02■■■■□ 3.36
STX4-210ENST00000487411 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.99■■■■□ 3.35
STX4-210ENST00000487411 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
STX4-210ENST00000487411 ABCC1P33527 1531 aa35.95■■■■□ 3.35
STX4-210ENST00000487411 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.95■■■■□ 3.35
STX4-210ENST00000487411 TIAM1Q13009 1591 aa35.94■■■■□ 3.34
STX4-210ENST00000487411 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.94■■■■□ 3.34
STX4-210ENST00000487411 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.91■■■■□ 3.34
STX4-210ENST00000487411 KDM5CP41229 1560 aa35.91■■■■□ 3.34
STX4-210ENST00000487411 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.89■■■■□ 3.34
STX4-210ENST00000487411 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.87■■■■□ 3.33
STX4-210ENST00000487411 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.86■■■■□ 3.33
STX4-210ENST00000487411 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.85■■■■□ 3.33
STX4-210ENST00000487411 AFAP1Q8N556 730 aa35.83■■■■□ 3.33
STX4-210ENST00000487411 MAP3K1Q13233 1512 aa35.83■■■■□ 3.33
STX4-210ENST00000487411 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.82■■■■□ 3.32
STX4-210ENST00000487411 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
STX4-210ENST00000487411 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.8■■■■□ 3.32
STX4-210ENST00000487411 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
STX4-210ENST00000487411 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.79■■■■□ 3.32
STX4-210ENST00000487411 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.79■■■■□ 3.32
STX4-210ENST00000487411 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
STX4-210ENST00000487411 NCOA2Q15596 1464 aa35.78■■■■□ 3.32
STX4-210ENST00000487411 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.78■■■■□ 3.32
STX4-210ENST00000487411 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
STX4-210ENST00000487411 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.77■■■■□ 3.32
STX4-210ENST00000487411 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.76■■■■□ 3.32
STX4-210ENST00000487411 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.76■■■■□ 3.32
STX4-210ENST00000487411 ATP10AO60312 1499 aa35.75■■■■□ 3.31
STX4-210ENST00000487411 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.74■■■■□ 3.31
STX4-210ENST00000487411 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.74■■■■□ 3.31
STX4-210ENST00000487411 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.74■■■■□ 3.31
STX4-210ENST00000487411 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.7■■■■□ 3.31
STX4-210ENST00000487411 ABCA6Q8N139 1617 aa35.67■■■■□ 3.3
STX4-210ENST00000487411 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.65■■■■□ 3.3
STX4-210ENST00000487411 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.65■■■■□ 3.3
STX4-210ENST00000487411 MADDQ8WXG6 1647 aa35.65■■■■□ 3.3
STX4-210ENST00000487411 REREQ9P2R6 1566 aa35.64■■■■□ 3.3
STX4-210ENST00000487411 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
STX4-210ENST00000487411 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.63■■■■□ 3.29
STX4-210ENST00000487411 PTPRMP28827 1452 aa35.6■■■■□ 3.29
STX4-210ENST00000487411 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
STX4-210ENST00000487411 MBD5Q9P267 1494 aa35.58■■■■□ 3.29
STX4-210ENST00000487411 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
STX4-210ENST00000487411 APLP2Q06481 763 aa35.56■■■■□ 3.28
STX4-210ENST00000487411 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
STX4-210ENST00000487411 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.54■■■■□ 3.28
STX4-210ENST00000487411 ATP7AQ04656 1500 aa35.54■■■■□ 3.28
STX4-210ENST00000487411 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
STX4-210ENST00000487411 AGLP35573 1532 aa35.52■■■■□ 3.28
STX4-210ENST00000487411 MLECQ14165 292 aa35.5■■■■□ 3.27
STX4-210ENST00000487411 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.47■■■■□ 3.27
STX4-210ENST00000487411 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.46■■■■□ 3.27
STX4-210ENST00000487411 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.46■■■■□ 3.27
STX4-210ENST00000487411 MIA2Q96PC5 1412 aa35.44■■■■□ 3.26
STX4-210ENST00000487411 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.42■■■■□ 3.26
STX4-210ENST00000487411 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.41■■■■□ 3.26
STX4-210ENST00000487411 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.4■■■■□ 3.26
STX4-210ENST00000487411 PLXNC1O60486 1568 aa35.38■■■■□ 3.25
STX4-210ENST00000487411 A2MP01023 1474 aa35.37■■■■□ 3.25
STX4-210ENST00000487411 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.33■■■■□ 3.25
STX4-210ENST00000487411 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.24■■■■□ 3.23
STX4-210ENST00000487411 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.24■■■■□ 3.23
STX4-210ENST00000487411 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.23■■■■□ 3.23
STX4-210ENST00000487411 TSPY4P0CV99 314 aa35.23■■■■□ 3.23
STX4-210ENST00000487411 TSPY10P0CW01 314 aa35.23■■■■□ 3.23
STX4-210ENST00000487411 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
STX4-210ENST00000487411 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.21■■■■□ 3.23
STX4-210ENST00000487411 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.21■■■■□ 3.23
STX4-210ENST00000487411 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
STX4-210ENST00000487411 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.18■■■■□ 3.22
STX4-210ENST00000487411 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
STX4-210ENST00000487411 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
STX4-210ENST00000487411 C3P01024 1663 aa35.13■■■■□ 3.21
STX4-210ENST00000487411 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.12■■■■□ 3.21
STX4-210ENST00000487411 MROH2AA6NES4 1674 aa35.11■■■■□ 3.21
STX4-210ENST00000487411 ABCC5O15440 1437 aa35.1■■■■□ 3.21
STX4-210ENST00000487411 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.1■■■■□ 3.21
STX4-210ENST00000487411 GGT6Q6P531 493 aa35.09■■■■□ 3.21
STX4-210ENST00000487411 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
STX4-210ENST00000487411 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.07■■■■□ 3.2
STX4-210ENST00000487411 DAPK1P53355 1430 aa35.06■■■■□ 3.2
STX4-210ENST00000487411 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.05■■■■□ 3.2
STX4-210ENST00000487411 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
STX4-210ENST00000487411 KIF3BO15066 747 aa35.03■■■■□ 3.2
STX4-210ENST00000487411 ZMYM3Q14202 1370 aa35.01■■■■□ 3.2
STX4-210ENST00000487411 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.01■■■■□ 3.19
STX4-210ENST00000487411 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
STX4-210ENST00000487411 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.97■■■■□ 3.19
STX4-210ENST00000487411 NPATQ14207 1427 aa34.97■■■■□ 3.19
STX4-210ENST00000487411 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.97■■■■□ 3.19
STX4-210ENST00000487411 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms