RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487163.5

USP21-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP21, Length 2,514 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-208ENST00000487163 FOXD1Q16676 465 aa23.87■■□□□ 1.41
USP21-208ENST00000487163 JPH4Q96JJ6 628 aa23.87■■□□□ 1.41
USP21-208ENST00000487163 ABCC5O15440 1437 aa23.86■■□□□ 1.41
USP21-208ENST00000487163 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
USP21-208ENST00000487163 NUP160Q12769 1436 aa23.83■■□□□ 1.4
USP21-208ENST00000487163 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
USP21-208ENST00000487163 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.81■■□□□ 1.4
USP21-208ENST00000487163 ROCK1Q13464 1354 aa23.8■■□□□ 1.4
USP21-208ENST00000487163 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
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USP21-208ENST00000487163 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
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USP21-208ENST00000487163 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.74■■□□□ 1.39
USP21-208ENST00000487163 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.72■■□□□ 1.39
USP21-208ENST00000487163 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
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USP21-208ENST00000487163 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.69■■□□□ 1.38
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USP21-208ENST00000487163 NCOA1Q15788 1441 aa23.66■■□□□ 1.38
USP21-208ENST00000487163 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.66■■□□□ 1.38
USP21-208ENST00000487163 ABCA8O94911 1581 aa23.66■■□□□ 1.38
USP21-208ENST00000487163 CCER2I3L3R5 266 aa23.65■■□□□ 1.38
USP21-208ENST00000487163 ATP10BO94823 1461 aa23.64■■□□□ 1.38
USP21-208ENST00000487163 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
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USP21-208ENST00000487163 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
USP21-208ENST00000487163 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.62■■□□□ 1.37
USP21-208ENST00000487163 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.61■■□□□ 1.37
USP21-208ENST00000487163 PZPP20742 1482 aa23.61■■□□□ 1.37
USP21-208ENST00000487163 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.6■■□□□ 1.37
USP21-208ENST00000487163 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.6■■□□□ 1.37
USP21-208ENST00000487163 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.59■■□□□ 1.37
USP21-208ENST00000487163 ADGRL2O95490 1459 aa23.57■■□□□ 1.36
USP21-208ENST00000487163 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.57■■□□□ 1.36
USP21-208ENST00000487163 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.55■■□□□ 1.36
USP21-208ENST00000487163 PTPRGP23470 1445 aa23.54■■□□□ 1.36
USP21-208ENST00000487163 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
USP21-208ENST00000487163 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.52■■□□□ 1.36
USP21-208ENST00000487163 PKD2Q13563 968 aa23.5■■□□□ 1.35
USP21-208ENST00000487163 CHD1O14646 1710 aa23.5■■□□□ 1.35
USP21-208ENST00000487163 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
USP21-208ENST00000487163 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.48■■□□□ 1.35
USP21-208ENST00000487163 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.48■■□□□ 1.35
USP21-208ENST00000487163 TSPY4P0CV99 314 aa23.45■■□□□ 1.34
USP21-208ENST00000487163 TSPY10P0CW01 314 aa23.45■■□□□ 1.34
USP21-208ENST00000487163 CCDC7Q96M83 1385 aa23.44■■□□□ 1.34
USP21-208ENST00000487163 NUP155O75694 1391 aa23.43■■□□□ 1.34
USP21-208ENST00000487163 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.43■■□□□ 1.34
USP21-208ENST00000487163 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.43■■□□□ 1.34
USP21-208ENST00000487163 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
USP21-208ENST00000487163 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.41■■□□□ 1.34
USP21-208ENST00000487163 MYT1Q01538 1121 aa23.4■■□□□ 1.34
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USP21-208ENST00000487163 BCANQ96GW7 911 aa23.4■■□□□ 1.34
USP21-208ENST00000487163 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.39■■□□□ 1.33
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USP21-208ENST00000487163 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.37■■□□□ 1.33
USP21-208ENST00000487163 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.37■■□□□ 1.33
USP21-208ENST00000487163 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.37■■□□□ 1.33
USP21-208ENST00000487163 CCDC184Q52MB2 194 aa23.36■■□□□ 1.33
USP21-208ENST00000487163 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
USP21-208ENST00000487163 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.34■■□□□ 1.33
USP21-208ENST00000487163 PREX2Q70Z35 1606 aa23.34■■□□□ 1.33
USP21-208ENST00000487163 SHROOM2Q13796 1616 aa23.33■■□□□ 1.32
USP21-208ENST00000487163 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
USP21-208ENST00000487163 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.31■■□□□ 1.32
USP21-208ENST00000487163 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.3■■□□□ 1.32
USP21-208ENST00000487163 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
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USP21-208ENST00000487163 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.28■■□□□ 1.32
USP21-208ENST00000487163 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.27■■□□□ 1.32
USP21-208ENST00000487163 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.27■■□□□ 1.32
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USP21-208ENST00000487163 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.26■■□□□ 1.31
USP21-208ENST00000487163 NEFLP07196 543 aa23.26■■□□□ 1.31
USP21-208ENST00000487163 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.25■■□□□ 1.31
USP21-208ENST00000487163 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.25■■□□□ 1.31
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USP21-208ENST00000487163 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.22■■□□□ 1.31
USP21-208ENST00000487163 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.22■■□□□ 1.31
USP21-208ENST00000487163 MRS2Q9HD23 443 aa23.22■■□□□ 1.31
USP21-208ENST00000487163 KDM5CP41229 1560 aa23.21■■□□□ 1.31
USP21-208ENST00000487163 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.21■■□□□ 1.31
USP21-208ENST00000487163 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.2■■□□□ 1.3
USP21-208ENST00000487163 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.2■■□□□ 1.3
USP21-208ENST00000487163 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.32e-6■■■□□ 15
USP21-208ENST00000487163 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.18■■□□□ 1.3
USP21-208ENST00000487163 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.18■■□□□ 1.3
USP21-208ENST00000487163 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.17■■□□□ 1.3
USP21-208ENST00000487163 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.16■■□□□ 1.3
USP21-208ENST00000487163 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.16■■□□□ 1.3
USP21-208ENST00000487163 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
USP21-208ENST00000487163 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.12■■□□□ 1.29
USP21-208ENST00000487163 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
USP21-208ENST00000487163 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.11■■□□□ 1.29
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