RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 PTPRMP28827 1452 aa32.73■■■□□ 2.83
ACTB-212ENST00000484841 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.72■■■□□ 2.83
ACTB-212ENST00000484841 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.72■■■□□ 2.83
ACTB-212ENST00000484841 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.71■■■□□ 2.83
ACTB-212ENST00000484841 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.71■■■□□ 2.83
ACTB-212ENST00000484841 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.7■■■□□ 2.83
ACTB-212ENST00000484841 MADDQ8WXG6 1647 aa32.69■■■□□ 2.82
ACTB-212ENST00000484841 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.64■■■□□ 2.82
ACTB-212ENST00000484841 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
ACTB-212ENST00000484841 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.61■■■□□ 2.81
ACTB-212ENST00000484841 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.61■■■□□ 2.81
ACTB-212ENST00000484841 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.57■■■□□ 2.8
ACTB-212ENST00000484841 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.57■■■□□ 2.8
ACTB-212ENST00000484841 MLECQ14165 292 aa32.55■■■□□ 2.8
ACTB-212ENST00000484841 ATP10AO60312 1499 aa32.54■■■□□ 2.8
ACTB-212ENST00000484841 PREX2Q70Z35 1606 aa32.53■■■□□ 2.8
ACTB-212ENST00000484841 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.52■■■□□ 2.8
ACTB-212ENST00000484841 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.52■■■□□ 2.8
ACTB-212ENST00000484841 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.51■■■□□ 2.79
ACTB-212ENST00000484841 AFAP1Q8N556 730 aa32.49■■■□□ 2.79
ACTB-212ENST00000484841 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.48■■■□□ 2.79
ACTB-212ENST00000484841 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.46■■■□□ 2.79
ACTB-212ENST00000484841 KDM5CP41229 1560 aa32.45■■■□□ 2.79
ACTB-212ENST00000484841 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.41■■■□□ 2.78
ACTB-212ENST00000484841 ABCC1P33527 1531 aa32.41■■■□□ 2.78
ACTB-212ENST00000484841 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
ACTB-212ENST00000484841 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
ACTB-212ENST00000484841 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.35■■■□□ 2.77
ACTB-212ENST00000484841 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.35■■■□□ 2.77
ACTB-212ENST00000484841 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.35■■■□□ 2.77
ACTB-212ENST00000484841 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.34■■■□□ 2.77
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.34■■■□□ 2.77
ACTB-212ENST00000484841 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.34■■■□□ 2.77
ACTB-212ENST00000484841 ABCA6Q8N139 1617 aa32.31■■■□□ 2.76
ACTB-212ENST00000484841 REREQ9P2R6 1566 aa32.3■■■□□ 2.76
ACTB-212ENST00000484841 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.3■■■□□ 2.76
ACTB-212ENST00000484841 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
ACTB-212ENST00000484841 CEP162Q5TB80 1403 aa32.28■■■□□ 2.76
ACTB-212ENST00000484841 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
ACTB-212ENST00000484841 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
ACTB-212ENST00000484841 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.27■■■□□ 2.76
ACTB-212ENST00000484841 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.24■■■□□ 2.75
ACTB-212ENST00000484841 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.23■■■□□ 2.75
ACTB-212ENST00000484841 HSPA2P54652 639 aa32.23■■■□□ 2.75
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.23■■■□□ 2.75
ACTB-212ENST00000484841 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.2■■■□□ 2.753e-29■□□□□ 9.6
ACTB-212ENST00000484841 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.74
ACTB-212ENST00000484841 AGLP35573 1532 aa32.2■■■□□ 2.74
ACTB-212ENST00000484841 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.2■■■□□ 2.74
ACTB-212ENST00000484841 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
ACTB-212ENST00000484841 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.18■■■□□ 2.74
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.17■■■□□ 2.74
ACTB-212ENST00000484841 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
ACTB-212ENST00000484841 ATP7AQ04656 1500 aa32.1■■■□□ 2.73
ACTB-212ENST00000484841 TIAM1Q13009 1591 aa32.09■■■□□ 2.73
ACTB-212ENST00000484841 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
ACTB-212ENST00000484841 C3P01024 1663 aa32.08■■■□□ 2.73
ACTB-212ENST00000484841 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.07■■■□□ 2.72
ACTB-212ENST00000484841 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.06■■■□□ 2.72
ACTB-212ENST00000484841 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
ACTB-212ENST00000484841 FBXO41Q8TF61 875 aa32.04■■■□□ 2.72
ACTB-212ENST00000484841 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.02■■■□□ 2.72
ACTB-212ENST00000484841 A2MP01023 1474 aa32■■■□□ 2.71
ACTB-212ENST00000484841 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
ACTB-212ENST00000484841 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.98■■■□□ 2.71
ACTB-212ENST00000484841 NCOA2Q15596 1464 aa31.96■■■□□ 2.71
ACTB-212ENST00000484841 MROH2AA6NES4 1674 aa31.95■■■□□ 2.71
ACTB-212ENST00000484841 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.95■■■□□ 2.71
ACTB-212ENST00000484841 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.95■■■□□ 2.71
ACTB-212ENST00000484841 GGT6Q6P531 493 aa31.92■■■□□ 2.7
ACTB-212ENST00000484841 PLXNC1O60486 1568 aa31.92■■■□□ 2.7
ACTB-212ENST00000484841 MBD5Q9P267 1494 aa31.91■■■□□ 2.7
ACTB-212ENST00000484841 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
ACTB-212ENST00000484841 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.89■■■□□ 2.7
ACTB-212ENST00000484841 ZMYM3Q14202 1370 aa31.89■■■□□ 2.7
ACTB-212ENST00000484841 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.89■■■□□ 2.7
ACTB-212ENST00000484841 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.87■■■□□ 2.69
ACTB-212ENST00000484841 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.86■■■□□ 2.69
ACTB-212ENST00000484841 STRCQ7RTU9 1775 aa31.86■■■□□ 2.69
ACTB-212ENST00000484841 NPATQ14207 1427 aa31.84■■■□□ 2.69
ACTB-212ENST00000484841 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.84■■■□□ 2.69
ACTB-212ENST00000484841 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.84■■■□□ 2.69
ACTB-212ENST00000484841 CERKQ8TCT0 537 aa31.81■■■□□ 2.68
ACTB-212ENST00000484841 TSPY4P0CV99 314 aa31.8■■■□□ 2.68
ACTB-212ENST00000484841 TSPY10P0CW01 314 aa31.8■■■□□ 2.68
ACTB-212ENST00000484841 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K1Q13233 1512 aa31.77■■■□□ 2.68
ACTB-212ENST00000484841 APLP2Q06481 763 aa31.76■■■□□ 2.67
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.75■■■□□ 2.67
ACTB-212ENST00000484841 KIF3BO15066 747 aa31.74■■■□□ 2.67
ACTB-212ENST00000484841 PTPRTO14522 1441 aa31.71■■■□□ 2.67
ACTB-212ENST00000484841 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
ACTB-212ENST00000484841 PTPRKQ15262 1439 aa31.69■■■□□ 2.66
ACTB-212ENST00000484841 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.69■■■□□ 2.66
ACTB-212ENST00000484841 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.69■■■□□ 2.66
ACTB-212ENST00000484841 NCOA1Q15788 1441 aa31.67■■■□□ 2.66
ACTB-212ENST00000484841 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
ACTB-212ENST00000484841 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.64■■■□□ 2.66
ACTB-212ENST00000484841 MIA2Q96PC5 1412 aa31.64■■■□□ 2.66
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