RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483639.1

UBE2Q1-205, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 694 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-205ENST00000483639 MAGI2Q86UL8 1455 aa18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1-205ENST00000483639 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
UBE2Q1-205ENST00000483639 KIF14Q15058 1648 aa18.67■□□□□ 0.58
UBE2Q1-205ENST00000483639 MLECQ14165 292 aa18.66■□□□□ 0.58
UBE2Q1-205ENST00000483639 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.65■□□□□ 0.58
UBE2Q1-205ENST00000483639 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.65■□□□□ 0.58
UBE2Q1-205ENST00000483639 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa18.64■□□□□ 0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 CLIP1P30622 1438 aa18.64■□□□□ 0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.61■□□□□ 0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 ATP10AO60312 1499 aa18.61■□□□□ 0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.61■□□□□ 0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 AFAP1Q8N556 730 aa18.61■□□□□ 0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.59■□□□□ 0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 MYO5CQ9NQX4 1742 aa18.59■□□□□ 0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa18.58■□□□□ 0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 HSPA2P54652 639 aa18.58■□□□□ 0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.57■□□□□ 0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.55■□□□□ 0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa18.54■□□□□ 0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.54■□□□□ 0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 KDM5CP41229 1560 aa18.54■□□□□ 0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.52■□□□□ 0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
UBE2Q1-205ENST00000483639 FBXO41Q8TF61 875 aa18.51■□□□□ 0.55
UBE2Q1-205ENST00000483639 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.51■□□□□ 0.55
UBE2Q1-205ENST00000483639 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1-205ENST00000483639 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1-205ENST00000483639 ABCC1P33527 1531 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1-205ENST00000483639 PREX2Q70Z35 1606 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1-205ENST00000483639 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1-205ENST00000483639 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
UBE2Q1-205ENST00000483639 ABCA6Q8N139 1617 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2Q1-205ENST00000483639 REREQ9P2R6 1566 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1-205ENST00000483639 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1-205ENST00000483639 AGLP35573 1532 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-205ENST00000483639 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-205ENST00000483639 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-205ENST00000483639 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-205ENST00000483639 SYCP2Q9BX26 1530 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-205ENST00000483639 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-205ENST00000483639 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-205ENST00000483639 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
UBE2Q1-205ENST00000483639 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.36■□□□□ 0.53
UBE2Q1-205ENST00000483639 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.36■□□□□ 0.53
UBE2Q1-205ENST00000483639 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
UBE2Q1-205ENST00000483639 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa18.35■□□□□ 0.53
UBE2Q1-205ENST00000483639 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.35■□□□□ 0.53
UBE2Q1-205ENST00000483639 CERKQ8TCT0 537 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-205ENST00000483639 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-205ENST00000483639 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-205ENST00000483639 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-205ENST00000483639 CEP162Q5TB80 1403 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-205ENST00000483639 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-205ENST00000483639 ATP7AQ04656 1500 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2Q1-205ENST00000483639 C3P01024 1663 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2Q1-205ENST00000483639 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZMYM3Q14202 1370 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2Q1-205ENST00000483639 A2MP01023 1474 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2Q1-205ENST00000483639 TIAM1Q13009 1591 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2Q1-205ENST00000483639 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
UBE2Q1-205ENST00000483639 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2Q1-205ENST00000483639 MBD5Q9P267 1494 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2Q1-205ENST00000483639 PLXNC1O60486 1568 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1-205ENST00000483639 STRCQ7RTU9 1775 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2Q1-205ENST00000483639 GGT6Q6P531 493 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1-205ENST00000483639 NPATQ14207 1427 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2Q1-205ENST00000483639 PTPRTO14522 1441 aa18.22■□□□□ 0.51
UBE2Q1-205ENST00000483639 NCOA1Q15788 1441 aa18.21■□□□□ 0.51
UBE2Q1-205ENST00000483639 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-205ENST00000483639 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-205ENST00000483639 NCOA2Q15596 1464 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-205ENST00000483639 PTPRKQ15262 1439 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-205ENST00000483639 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2Q1-205ENST00000483639 MROH2AA6NES4 1674 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2Q1-205ENST00000483639 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2Q1-205ENST00000483639 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
UBE2Q1-205ENST00000483639 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2Q1-205ENST00000483639 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2Q1-205ENST00000483639 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2Q1-205ENST00000483639 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2Q1-205ENST00000483639 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
UBE2Q1-205ENST00000483639 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2Q1-205ENST00000483639 KIF3BO15066 747 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2Q1-205ENST00000483639 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2Q1-205ENST00000483639 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2Q1-205ENST00000483639 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2Q1-205ENST00000483639 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2Q1-205ENST00000483639 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.08■□□□□ 0.48
UBE2Q1-205ENST00000483639 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
UBE2Q1-205ENST00000483639 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2Q1-205ENST00000483639 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
UBE2Q1-205ENST00000483639 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
UBE2Q1-205ENST00000483639 PLA2R1Q13018 1463 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
UBE2Q1-205ENST00000483639 PKD2Q13563 968 aa18.06■□□□□ 0.48
UBE2Q1-205ENST00000483639 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms