RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.19■■■□□ 2.42
CLK1-211ENST00000481641 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.18■■■□□ 2.42
CLK1-211ENST00000481641 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.16■■■□□ 2.42
CLK1-211ENST00000481641 PTPRMP28827 1452 aa30.16■■■□□ 2.42
CLK1-211ENST00000481641 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.16■■■□□ 2.42
CLK1-211ENST00000481641 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.13■■■□□ 2.41
CLK1-211ENST00000481641 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.13■■■□□ 2.41
CLK1-211ENST00000481641 MADDQ8WXG6 1647 aa30.13■■■□□ 2.41
CLK1-211ENST00000481641 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.12■■■□□ 2.41
CLK1-211ENST00000481641 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.1■■■□□ 2.41
CLK1-211ENST00000481641 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.09■■■□□ 2.41
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CLK1-211ENST00000481641 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.99■■■□□ 2.39
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CLK1-211ENST00000481641 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.96■■■□□ 2.39
CLK1-211ENST00000481641 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.96■■■□□ 2.39
CLK1-211ENST00000481641 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.96■■■□□ 2.39
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CLK1-211ENST00000481641 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.95■■■□□ 2.38
CLK1-211ENST00000481641 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.93■■■□□ 2.38
CLK1-211ENST00000481641 ABCC1P33527 1531 aa29.91■■■□□ 2.38
CLK1-211ENST00000481641 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
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CLK1-211ENST00000481641 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.87■■■□□ 2.37
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CLK1-211ENST00000481641 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.84■■■□□ 2.37
CLK1-211ENST00000481641 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.84■■■□□ 2.37
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CLK1-211ENST00000481641 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
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CLK1-211ENST00000481641 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.7■■■□□ 2.34
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CLK1-211ENST00000481641 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.67■■■□□ 2.34
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CLK1-211ENST00000481641 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.45■■■□□ 2.31
CLK1-211ENST00000481641 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
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CLK1-211ENST00000481641 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
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CLK1-211ENST00000481641 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
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CLK1-211ENST00000481641 MAP3K1Q13233 1512 aa29.33■■■□□ 2.29
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CLK1-211ENST00000481641 KIF3BO15066 747 aa29.29■■■□□ 2.28
CLK1-211ENST00000481641 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.29■■■□□ 2.28
CLK1-211ENST00000481641 TSPY4P0CV99 314 aa29.27■■■□□ 2.28
CLK1-211ENST00000481641 TSPY10P0CW01 314 aa29.27■■■□□ 2.28
CLK1-211ENST00000481641 CERKQ8TCT0 537 aa29.27■■■□□ 2.28
CLK1-211ENST00000481641 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.27■■■□□ 2.28
CLK1-211ENST00000481641 PTPRKQ15262 1439 aa29.27■■■□□ 2.28
CLK1-211ENST00000481641 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.26■■■□□ 2.27
CLK1-211ENST00000481641 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.23■■■□□ 2.27
CLK1-211ENST00000481641 NCOA1Q15788 1441 aa29.2■■■□□ 2.27
CLK1-211ENST00000481641 APLP2Q06481 763 aa29.2■■■□□ 2.26
CLK1-211ENST00000481641 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.2■■■□□ 2.26
CLK1-211ENST00000481641 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.19■■■□□ 2.26
CLK1-211ENST00000481641 MIA2Q96PC5 1412 aa29.19■■■□□ 2.26
CLK1-211ENST00000481641 PTPRTO14522 1441 aa29.18■■■□□ 2.26
CLK1-211ENST00000481641 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
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