RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480739.2

RPL13AP23-201, Transcript of ribosomal protein L13a pseudogene 23, humanhuman

BASIC

Gene RPL13AP23, Length 586 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP23-201ENST00000480739 CLIP1P30622 1438 aa28.09■■■□□ 2.09
RPL13AP23-201ENST00000480739 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.08■■■□□ 2.09
RPL13AP23-201ENST00000480739 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.08■■■□□ 2.09
RPL13AP23-201ENST00000480739 MADDQ8WXG6 1647 aa28.08■■■□□ 2.09
RPL13AP23-201ENST00000480739 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
RPL13AP23-201ENST00000480739 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.07■■■□□ 2.08
RPL13AP23-201ENST00000480739 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.05■■■□□ 2.08
RPL13AP23-201ENST00000480739 MLECQ14165 292 aa28.03■■■□□ 2.08
RPL13AP23-201ENST00000480739 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.02■■■□□ 2.08
RPL13AP23-201ENST00000480739 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.01■■■□□ 2.07
RPL13AP23-201ENST00000480739 AFAP1Q8N556 730 aa28.01■■■□□ 2.07
RPL13AP23-201ENST00000480739 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28■■■□□ 2.07
RPL13AP23-201ENST00000480739 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
RPL13AP23-201ENST00000480739 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
RPL13AP23-201ENST00000480739 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.99■■■□□ 2.07
RPL13AP23-201ENST00000480739 ATP10AO60312 1499 aa27.97■■■□□ 2.07
RPL13AP23-201ENST00000480739 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.96■■■□□ 2.07
RPL13AP23-201ENST00000480739 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.94■■■□□ 2.06
RPL13AP23-201ENST00000480739 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.94■■■□□ 2.06
RPL13AP23-201ENST00000480739 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.91■■■□□ 2.06
RPL13AP23-201ENST00000480739 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.9■■■□□ 2.06
RPL13AP23-201ENST00000480739 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.88■■■□□ 2.05
RPL13AP23-201ENST00000480739 KDM5CP41229 1560 aa27.86■■■□□ 2.05
RPL13AP23-201ENST00000480739 PREX2Q70Z35 1606 aa27.85■■■□□ 2.05
RPL13AP23-201ENST00000480739 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.84■■■□□ 2.05
RPL13AP23-201ENST00000480739 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.83■■■□□ 2.05
RPL13AP23-201ENST00000480739 HSPA2P54652 639 aa27.83■■■□□ 2.05
RPL13AP23-201ENST00000480739 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
RPL13AP23-201ENST00000480739 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.83■■■□□ 2.05
RPL13AP23-201ENST00000480739 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.81■■■□□ 2.04
RPL13AP23-201ENST00000480739 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.8■■■□□ 2.04
RPL13AP23-201ENST00000480739 ABCC1P33527 1531 aa27.79■■■□□ 2.04
RPL13AP23-201ENST00000480739 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
RPL13AP23-201ENST00000480739 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.77■■■□□ 2.04
RPL13AP23-201ENST00000480739 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
RPL13AP23-201ENST00000480739 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.75■■■□□ 2.03
RPL13AP23-201ENST00000480739 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.74■■■□□ 2.03
RPL13AP23-201ENST00000480739 ABCA6Q8N139 1617 aa27.72■■■□□ 2.03
RPL13AP23-201ENST00000480739 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
RPL13AP23-201ENST00000480739 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.71■■■□□ 2.03
RPL13AP23-201ENST00000480739 REREQ9P2R6 1566 aa27.69■■■□□ 2.02
RPL13AP23-201ENST00000480739 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.69■■■□□ 2.02
RPL13AP23-201ENST00000480739 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.68■■■□□ 2.02
RPL13AP23-201ENST00000480739 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.68■■■□□ 2.02
RPL13AP23-201ENST00000480739 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
RPL13AP23-201ENST00000480739 FBXO41Q8TF61 875 aa27.66■■■□□ 2.02
RPL13AP23-201ENST00000480739 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
RPL13AP23-201ENST00000480739 CEP162Q5TB80 1403 aa27.65■■■□□ 2.02
RPL13AP23-201ENST00000480739 AGLP35573 1532 aa27.64■■■□□ 2.02
RPL13AP23-201ENST00000480739 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.64■■■□□ 2.02
RPL13AP23-201ENST00000480739 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
RPL13AP23-201ENST00000480739 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.61■■■□□ 2.01
RPL13AP23-201ENST00000480739 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.59■■■□□ 2.01
RPL13AP23-201ENST00000480739 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.58■■■□□ 2.01
RPL13AP23-201ENST00000480739 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
RPL13AP23-201ENST00000480739 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.57■■■□□ 2
RPL13AP23-201ENST00000480739 C3P01024 1663 aa27.54■■■□□ 2
RPL13AP23-201ENST00000480739 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.53■■■□□ 2
RPL13AP23-201ENST00000480739 ATP7AQ04656 1500 aa27.51■■■□□ 2
RPL13AP23-201ENST00000480739 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.51■■■□□ 2
RPL13AP23-201ENST00000480739 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
RPL13AP23-201ENST00000480739 TIAM1Q13009 1591 aa27.51■■□□□ 1.99
RPL13AP23-201ENST00000480739 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.5■■□□□ 1.99
RPL13AP23-201ENST00000480739 A2MP01023 1474 aa27.47■■□□□ 1.99
RPL13AP23-201ENST00000480739 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.47■■□□□ 1.99
RPL13AP23-201ENST00000480739 GGT6Q6P531 493 aa27.46■■□□□ 1.99
RPL13AP23-201ENST00000480739 CERKQ8TCT0 537 aa27.46■■□□□ 1.99
RPL13AP23-201ENST00000480739 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
RPL13AP23-201ENST00000480739 ZMYM3Q14202 1370 aa27.46■■□□□ 1.99
RPL13AP23-201ENST00000480739 MBD5Q9P267 1494 aa27.44■■□□□ 1.98
RPL13AP23-201ENST00000480739 STRCQ7RTU9 1775 aa27.44■■□□□ 1.98
RPL13AP23-201ENST00000480739 NCOA2Q15596 1464 aa27.4■■□□□ 1.98
RPL13AP23-201ENST00000480739 PLXNC1O60486 1568 aa27.39■■□□□ 1.98
RPL13AP23-201ENST00000480739 MROH2AA6NES4 1674 aa27.37■■□□□ 1.97
RPL13AP23-201ENST00000480739 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.37■■□□□ 1.97
RPL13AP23-201ENST00000480739 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.36■■□□□ 1.97
RPL13AP23-201ENST00000480739 NPATQ14207 1427 aa27.36■■□□□ 1.97
RPL13AP23-201ENST00000480739 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.36■■□□□ 1.97
RPL13AP23-201ENST00000480739 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.36■■□□□ 1.97
RPL13AP23-201ENST00000480739 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.35■■□□□ 1.97
RPL13AP23-201ENST00000480739 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
RPL13AP23-201ENST00000480739 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
RPL13AP23-201ENST00000480739 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.32■■□□□ 1.96
RPL13AP23-201ENST00000480739 PTPRTO14522 1441 aa27.3■■□□□ 1.96
RPL13AP23-201ENST00000480739 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.3■■□□□ 1.96
RPL13AP23-201ENST00000480739 KIF3BO15066 747 aa27.29■■□□□ 1.96
RPL13AP23-201ENST00000480739 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
RPL13AP23-201ENST00000480739 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.29■■□□□ 1.96
RPL13AP23-201ENST00000480739 TSPY4P0CV99 314 aa27.28■■□□□ 1.96
RPL13AP23-201ENST00000480739 TSPY10P0CW01 314 aa27.28■■□□□ 1.96
RPL13AP23-201ENST00000480739 PTPRKQ15262 1439 aa27.27■■□□□ 1.96
RPL13AP23-201ENST00000480739 NCOA1Q15788 1441 aa27.26■■□□□ 1.95
RPL13AP23-201ENST00000480739 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.23■■□□□ 1.95
RPL13AP23-201ENST00000480739 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.23■■□□□ 1.95
RPL13AP23-201ENST00000480739 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.19■■□□□ 1.94
RPL13AP23-201ENST00000480739 MAP3K1Q13233 1512 aa27.19■■□□□ 1.94
RPL13AP23-201ENST00000480739 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.18■■□□□ 1.94
RPL13AP23-201ENST00000480739 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
RPL13AP23-201ENST00000480739 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.16■■□□□ 1.94
RPL13AP23-201ENST00000480739 PKD2Q13563 968 aa27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms