RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.18■■■□□ 2.9
ACTB-211ENST00000480301 PREX2Q70Z35 1606 aa33.17■■■□□ 2.9
ACTB-211ENST00000480301 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
ACTB-211ENST00000480301 TIAM1Q13009 1591 aa33.17■■■□□ 2.9
ACTB-211ENST00000480301 RICTORQ6R327 1708 aa33.16■■■□□ 2.9
ACTB-211ENST00000480301 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.15■■■□□ 2.9
ACTB-211ENST00000480301 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.14■■■□□ 2.89
ACTB-211ENST00000480301 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.13■■■□□ 2.89
ACTB-211ENST00000480301 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.12■■■□□ 2.89
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K1Q13233 1512 aa33.09■■■□□ 2.89
ACTB-211ENST00000480301 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
ACTB-211ENST00000480301 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.07■■■□□ 2.89
ACTB-211ENST00000480301 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.06■■■□□ 2.88
ACTB-211ENST00000480301 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.06■■■□□ 2.88
ACTB-211ENST00000480301 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
ACTB-211ENST00000480301 AFAP1Q8N556 730 aa33.05■■■□□ 2.88
ACTB-211ENST00000480301 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.04■■■□□ 2.88
ACTB-211ENST00000480301 NCOA2Q15596 1464 aa33.03■■■□□ 2.88
ACTB-211ENST00000480301 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.03■■■□□ 2.88
ACTB-211ENST00000480301 ABCC1P33527 1531 aa33.02■■■□□ 2.88
ACTB-211ENST00000480301 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa33.01■■■□□ 2.88
ACTB-211ENST00000480301 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.01■■■□□ 2.87
ACTB-211ENST00000480301 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33■■■□□ 2.87
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.99■■■□□ 2.87
ACTB-211ENST00000480301 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.99■■■□□ 2.87
ACTB-211ENST00000480301 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
ACTB-211ENST00000480301 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.97■■■□□ 2.87
ACTB-211ENST00000480301 APLP2Q06481 763 aa32.96■■■□□ 2.87
ACTB-211ENST00000480301 KDM5CP41229 1560 aa32.96■■■□□ 2.87
ACTB-211ENST00000480301 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.94■■■□□ 2.86
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.93■■■□□ 2.86
ACTB-211ENST00000480301 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.92■■■□□ 2.86
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.9■■■□□ 2.86
ACTB-211ENST00000480301 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.9■■■□□ 2.86
ACTB-211ENST00000480301 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.88■■■□□ 2.85
ACTB-211ENST00000480301 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
ACTB-211ENST00000480301 ATP10AO60312 1499 aa32.86■■■□□ 2.85
ACTB-211ENST00000480301 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.85■■■□□ 2.85
ACTB-211ENST00000480301 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.83■■■□□ 2.85
ACTB-211ENST00000480301 MBD5Q9P267 1494 aa32.8■■■□□ 2.84
ACTB-211ENST00000480301 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.8■■■□□ 2.84
ACTB-211ENST00000480301 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.79■■■□□ 2.84
ACTB-211ENST00000480301 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
ACTB-211ENST00000480301 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.77■■■□□ 2.84
ACTB-211ENST00000480301 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.75■■■□□ 2.83
ACTB-211ENST00000480301 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.75■■■□□ 2.83
ACTB-211ENST00000480301 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.75■■■□□ 2.83
ACTB-211ENST00000480301 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.75■■■□□ 2.83
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.75■■■□□ 2.83
ACTB-211ENST00000480301 ABCA6Q8N139 1617 aa32.73■■■□□ 2.83
ACTB-211ENST00000480301 MIA2Q96PC5 1412 aa32.7■■■□□ 2.83
ACTB-211ENST00000480301 REREQ9P2R6 1566 aa32.68■■■□□ 2.82
ACTB-211ENST00000480301 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.68■■■□□ 2.82
ACTB-211ENST00000480301 MLECQ14165 292 aa32.67■■■□□ 2.82
ACTB-211ENST00000480301 ATP7AQ04656 1500 aa32.67■■■□□ 2.82
ACTB-211ENST00000480301 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
ACTB-211ENST00000480301 CCDC141Q6ZP82 1450 aa32.64■■■□□ 2.82
ACTB-211ENST00000480301 MADDQ8WXG6 1647 aa32.62■■■□□ 2.81
ACTB-211ENST00000480301 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.62■■■□□ 2.81
ACTB-211ENST00000480301 PTPRMP28827 1452 aa32.61■■■□□ 2.81
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.6■■■□□ 2.81
ACTB-211ENST00000480301 AGLP35573 1532 aa32.6■■■□□ 2.81
ACTB-211ENST00000480301 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.55■■■□□ 2.8
ACTB-211ENST00000480301 TSPY4P0CV99 314 aa32.54■■■□□ 2.8
ACTB-211ENST00000480301 TSPY10P0CW01 314 aa32.54■■■□□ 2.8
ACTB-211ENST00000480301 A2MP01023 1474 aa32.54■■■□□ 2.8
ACTB-211ENST00000480301 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
ACTB-211ENST00000480301 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.51■■■□□ 2.79
ACTB-211ENST00000480301 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
ACTB-211ENST00000480301 PLXNC1O60486 1568 aa32.49■■■□□ 2.79
ACTB-211ENST00000480301 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
ACTB-211ENST00000480301 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.46■■■□□ 2.79
ACTB-211ENST00000480301 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.45■■■□□ 2.79
ACTB-211ENST00000480301 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
ACTB-211ENST00000480301 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.43■■■□□ 2.78
ACTB-211ENST00000480301 ABCC5O15440 1437 aa32.43■■■□□ 2.78
ACTB-211ENST00000480301 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.39■■■□□ 2.78
ACTB-211ENST00000480301 DAPK1P53355 1430 aa32.37■■■□□ 2.77
ACTB-211ENST00000480301 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
ACTB-211ENST00000480301 GGT6Q6P531 493 aa32.35■■■□□ 2.77
ACTB-211ENST00000480301 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
ACTB-211ENST00000480301 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
ACTB-211ENST00000480301 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.34■■■□□ 2.77
ACTB-211ENST00000480301 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
ACTB-211ENST00000480301 KIF3BO15066 747 aa32.31■■■□□ 2.76
ACTB-211ENST00000480301 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.3■■■□□ 2.76
ACTB-211ENST00000480301 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.29■■■□□ 2.76
ACTB-211ENST00000480301 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.28■■■□□ 2.76
ACTB-211ENST00000480301 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.25■■■□□ 2.75
ACTB-211ENST00000480301 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.23■■■□□ 2.75
ACTB-211ENST00000480301 ZMYM3Q14202 1370 aa32.22■■■□□ 2.75
ACTB-211ENST00000480301 KIF15Q9NS87 1388 aa32.22■■■□□ 2.75
ACTB-211ENST00000480301 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.21■■■□□ 2.75
ACTB-211ENST00000480301 C3P01024 1663 aa32.19■■■□□ 2.74
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.19■■■□□ 2.74
ACTB-211ENST00000480301 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.18■■■□□ 2.74
ACTB-211ENST00000480301 NCOA1Q15788 1441 aa32.17■■■□□ 2.74
ACTB-211ENST00000480301 MROH2AA6NES4 1674 aa32.17■■■□□ 2.74
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