RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478582.5

CCM2-211, Transcript of CCM2 scaffold protein, humanhuman

TSL 3

Gene CCM2, Length 937 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2-211ENST00000478582 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.15■■■■■ 4.34
CCM2-211ENST00000478582 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.14■■■■■ 4.34
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CCM2-211ENST00000478582 APLP2Q06481 763 aa42.08■■■■■ 4.33
CCM2-211ENST00000478582 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.06■■■■■ 4.32
CCM2-211ENST00000478582 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.05■■■■■ 4.32
CCM2-211ENST00000478582 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.01■■■■■ 4.32
CCM2-211ENST00000478582 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
CCM2-211ENST00000478582 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.97■■■■■ 4.31
CCM2-211ENST00000478582 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.96■■■■■ 4.31
CCM2-211ENST00000478582 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.95■■■■■ 4.31
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CCM2-211ENST00000478582 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.91■■■■■ 4.3
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CCM2-211ENST00000478582 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.9■■■■■ 4.3
CCM2-211ENST00000478582 NCOA2Q15596 1464 aa41.89■■■■■ 4.3
CCM2-211ENST00000478582 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.89■■■■■ 4.3
CCM2-211ENST00000478582 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.85■■■■■ 4.29
CCM2-211ENST00000478582 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
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CCM2-211ENST00000478582 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.81■■■■■ 4.28
CCM2-211ENST00000478582 AFAP1Q8N556 730 aa41.78■■■■■ 4.28
CCM2-211ENST00000478582 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
CCM2-211ENST00000478582 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.74■■■■■ 4.27
CCM2-211ENST00000478582 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.74■■■■■ 4.27
CCM2-211ENST00000478582 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.73■■■■■ 4.27
CCM2-211ENST00000478582 ABCC1P33527 1531 aa41.73■■■■■ 4.27
CCM2-211ENST00000478582 KDM5CP41229 1560 aa41.72■■■■■ 4.27
CCM2-211ENST00000478582 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.71■■■■■ 4.27
CCM2-211ENST00000478582 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
CCM2-211ENST00000478582 ATP10AO60312 1499 aa41.68■■■■■ 4.26
CCM2-211ENST00000478582 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.67■■■■■ 4.26
CCM2-211ENST00000478582 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.63■■■■■ 4.26
CCM2-211ENST00000478582 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.63■■■■■ 4.25
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CCM2-211ENST00000478582 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.61■■■■■ 4.25
CCM2-211ENST00000478582 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.61■■■■■ 4.25
CCM2-211ENST00000478582 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.6■■■■■ 4.25
CCM2-211ENST00000478582 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.6■■■■■ 4.25
CCM2-211ENST00000478582 PTPRMP28827 1452 aa41.58■■■■■ 4.25
CCM2-211ENST00000478582 MADDQ8WXG6 1647 aa41.57■■■■■ 4.25
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CCM2-211ENST00000478582 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.53■■■■■ 4.24
CCM2-211ENST00000478582 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.5■■■■■ 4.23
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CCM2-211ENST00000478582 ABCA6Q8N139 1617 aa41.46■■■■■ 4.23
CCM2-211ENST00000478582 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.45■■■■■ 4.23
CCM2-211ENST00000478582 MBD5Q9P267 1494 aa41.44■■■■■ 4.22
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CCM2-211ENST00000478582 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.31■■■■■ 4.2
CCM2-211ENST00000478582 ATP7AQ04656 1500 aa41.29■■■■■ 4.2
CCM2-211ENST00000478582 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.28■■■■■ 4.2
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CCM2-211ENST00000478582 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.08■■■■■ 4.17
CCM2-211ENST00000478582 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
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CCM2-211ENST00000478582 HSPA2P54652 639 aa40.89■■■■■ 4.14
CCM2-211ENST00000478582 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.88■■■■■ 4.13
CCM2-211ENST00000478582 MROH2AA6NES4 1674 aa40.87■■■■■ 4.13
CCM2-211ENST00000478582 ZMYM3Q14202 1370 aa40.86■■■■■ 4.13
CCM2-211ENST00000478582 KIF3BO15066 747 aa40.83■■■■■ 4.13
CCM2-211ENST00000478582 PTPRKQ15262 1439 aa40.83■■■■■ 4.13
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