RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478582.5

CCM2-211, Transcript of CCM2 scaffold protein, humanhuman

TSL 3

Gene CCM2, Length 937 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2-211ENST00000478582 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.45■■■■■ 7.91
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CCM2-211ENST00000478582 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.92■■■■■ 5.26
CCM2-211ENST00000478582 WDR62O43379 1518 aa47.8■■■■■ 5.24
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CCM2-211ENST00000478582 TOPBP1Q92547 1522 aa47.14■■■■■ 5.14
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CCM2-211ENST00000478582 GRIN2BQ13224 1484 aa46.03■■■■■ 4.96
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CCM2-211ENST00000478582 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.27■■■■■ 4.84
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CCM2-211ENST00000478582 CEP170Q5SW79 1584 aa45.2■■■■■ 4.83
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CCM2-211ENST00000478582 SHROOM2Q13796 1616 aa44.94■■■■■ 4.79
CCM2-211ENST00000478582 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.89■■■■■ 4.78
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