RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476842.1

SMIM4-202, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SMIM4, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-202ENST00000476842 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.9■■■□□ 2.06
SMIM4-202ENST00000476842 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.9■■■□□ 2.06
SMIM4-202ENST00000476842 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.89■■■□□ 2.06
SMIM4-202ENST00000476842 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SMIM4-202ENST00000476842 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SMIM4-202ENST00000476842 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.86■■■□□ 2.05
SMIM4-202ENST00000476842 ADGRL1O94910 1474 aa27.85■■■□□ 2.05
SMIM4-202ENST00000476842 NCOA2Q15596 1464 aa27.85■■■□□ 2.05
SMIM4-202ENST00000476842 PREX2Q70Z35 1606 aa27.83■■■□□ 2.05
SMIM4-202ENST00000476842 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.82■■■□□ 2.04
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
SMIM4-202ENST00000476842 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
SMIM4-202ENST00000476842 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.79■■■□□ 2.04
SMIM4-202ENST00000476842 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.75■■■□□ 2.03
SMIM4-202ENST00000476842 AFAP1Q8N556 730 aa27.74■■■□□ 2.03
SMIM4-202ENST00000476842 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.73■■■□□ 2.03
SMIM4-202ENST00000476842 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.72■■■□□ 2.03
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
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SMIM4-202ENST00000476842 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.7■■■□□ 2.02
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SMIM4-202ENST00000476842 ABCC1P33527 1531 aa27.69■■■□□ 2.02
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SMIM4-202ENST00000476842 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.68■■■□□ 2.02
SMIM4-202ENST00000476842 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.68■■■□□ 2.02
SMIM4-202ENST00000476842 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.67■■■□□ 2.02
SMIM4-202ENST00000476842 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.67■■■□□ 2.02
SMIM4-202ENST00000476842 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.66■■■□□ 2.02
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SMIM4-202ENST00000476842 MIA2Q96PC5 1412 aa27.63■■■□□ 2.01
SMIM4-202ENST00000476842 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.61■■■□□ 2.01
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SMIM4-202ENST00000476842 KDM5CP41229 1560 aa27.6■■■□□ 2.01
SMIM4-202ENST00000476842 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.59■■■□□ 2.01
SMIM4-202ENST00000476842 MBD5Q9P267 1494 aa27.59■■■□□ 2.01
SMIM4-202ENST00000476842 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.59■■■□□ 2.01
SMIM4-202ENST00000476842 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.58■■■□□ 2.01
SMIM4-202ENST00000476842 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.57■■■□□ 2
SMIM4-202ENST00000476842 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.57■■■□□ 2
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SMIM4-202ENST00000476842 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
SMIM4-202ENST00000476842 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.53■■■□□ 2
SMIM4-202ENST00000476842 ATP10AO60312 1499 aa27.52■■■□□ 2
SMIM4-202ENST00000476842 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.51■■□□□ 1.99
SMIM4-202ENST00000476842 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.5■■□□□ 1.99
SMIM4-202ENST00000476842 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.49■■□□□ 1.99
SMIM4-202ENST00000476842 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
SMIM4-202ENST00000476842 TSPY4P0CV99 314 aa27.47■■□□□ 1.99
SMIM4-202ENST00000476842 TSPY10P0CW01 314 aa27.47■■□□□ 1.99
SMIM4-202ENST00000476842 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.46■■□□□ 1.99
SMIM4-202ENST00000476842 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.45■■□□□ 1.98
SMIM4-202ENST00000476842 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.45■■□□□ 1.98
SMIM4-202ENST00000476842 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.44■■□□□ 1.98
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SMIM4-202ENST00000476842 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.41■■□□□ 1.98
SMIM4-202ENST00000476842 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.41■■□□□ 1.98
SMIM4-202ENST00000476842 ATP7AQ04656 1500 aa27.4■■□□□ 1.98
SMIM4-202ENST00000476842 ABCA6Q8N139 1617 aa27.38■■□□□ 1.97
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SMIM4-202ENST00000476842 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
SMIM4-202ENST00000476842 REREQ9P2R6 1566 aa27.35■■□□□ 1.97
SMIM4-202ENST00000476842 ABCC5O15440 1437 aa27.34■■□□□ 1.97
SMIM4-202ENST00000476842 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
SMIM4-202ENST00000476842 MLECQ14165 292 aa27.32■■□□□ 1.96
SMIM4-202ENST00000476842 A2MP01023 1474 aa27.31■■□□□ 1.96
SMIM4-202ENST00000476842 AGLP35573 1532 aa27.31■■□□□ 1.96
SMIM4-202ENST00000476842 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SMIM4-202ENST00000476842 DAPK1P53355 1430 aa27.3■■□□□ 1.96
SMIM4-202ENST00000476842 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.3■■□□□ 1.96
SMIM4-202ENST00000476842 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.28■■□□□ 1.96
SMIM4-202ENST00000476842 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
SMIM4-202ENST00000476842 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.27■■□□□ 1.96
SMIM4-202ENST00000476842 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.25■■□□□ 1.95
SMIM4-202ENST00000476842 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.24■■□□□ 1.95
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SMIM4-202ENST00000476842 GGT6Q6P531 493 aa27.16■■□□□ 1.94
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SMIM4-202ENST00000476842 KIF15Q9NS87 1388 aa27.15■■□□□ 1.94
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SMIM4-202ENST00000476842 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.14■■□□□ 1.94
SMIM4-202ENST00000476842 PTPRMP28827 1452 aa27.14■■□□□ 1.94
SMIM4-202ENST00000476842 MADDQ8WXG6 1647 aa27.14■■□□□ 1.94
SMIM4-202ENST00000476842 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SMIM4-202ENST00000476842 ITGAEP38570 1179 aa27.12■■□□□ 1.93
SMIM4-202ENST00000476842 ADGRL2O95490 1459 aa27.12■■□□□ 1.93
SMIM4-202ENST00000476842 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.11■■□□□ 1.93
SMIM4-202ENST00000476842 ROCK1Q13464 1354 aa27.07■■□□□ 1.92
SMIM4-202ENST00000476842 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.07■■□□□ 1.92
SMIM4-202ENST00000476842 ERBINQ96RT1 1412 aa27.05■■□□□ 1.92
SMIM4-202ENST00000476842 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
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