RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476803.1

FAAP20-212, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-212ENST00000476803 RICTORQ6R327 1708 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-212ENST00000476803 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-212ENST00000476803 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-212ENST00000476803 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.06■■■□□ 2.24
FAAP20-212ENST00000476803 PREX2Q70Z35 1606 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-212ENST00000476803 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-212ENST00000476803 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-212ENST00000476803 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-212ENST00000476803 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-212ENST00000476803 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-212ENST00000476803 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-212ENST00000476803 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-212ENST00000476803 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-212ENST00000476803 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-212ENST00000476803 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-212ENST00000476803 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-212ENST00000476803 ABCC1P33527 1531 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-212ENST00000476803 AFAP1Q8N556 730 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-212ENST00000476803 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-212ENST00000476803 TIAM1Q13009 1591 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-212ENST00000476803 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-212ENST00000476803 KDM5CP41229 1560 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-212ENST00000476803 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-212ENST00000476803 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-212ENST00000476803 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-212ENST00000476803 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-212ENST00000476803 ATP10AO60312 1499 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-212ENST00000476803 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-212ENST00000476803 MAP3K1Q13233 1512 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-212ENST00000476803 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-212ENST00000476803 NCOA2Q15596 1464 aa28.84■■■□□ 2.21
FAAP20-212ENST00000476803 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.84■■■□□ 2.21
FAAP20-212ENST00000476803 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.84■■■□□ 2.21
FAAP20-212ENST00000476803 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.84■■■□□ 2.21
FAAP20-212ENST00000476803 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-212ENST00000476803 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-212ENST00000476803 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-212ENST00000476803 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-212ENST00000476803 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-212ENST00000476803 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.8■■■□□ 2.2
FAAP20-212ENST00000476803 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.8■■■□□ 2.2
FAAP20-212ENST00000476803 APLP2Q06481 763 aa28.77■■■□□ 2.2
FAAP20-212ENST00000476803 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
FAAP20-212ENST00000476803 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.75■■■□□ 2.19
FAAP20-212ENST00000476803 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
FAAP20-212ENST00000476803 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
FAAP20-212ENST00000476803 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.73■■■□□ 2.19
FAAP20-212ENST00000476803 PTPRMP28827 1452 aa28.72■■■□□ 2.19
FAAP20-212ENST00000476803 MADDQ8WXG6 1647 aa28.72■■■□□ 2.19
FAAP20-212ENST00000476803 MLECQ14165 292 aa28.71■■■□□ 2.19
FAAP20-212ENST00000476803 ABCA6Q8N139 1617 aa28.71■■■□□ 2.19
FAAP20-212ENST00000476803 REREQ9P2R6 1566 aa28.7■■■□□ 2.18
FAAP20-212ENST00000476803 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.67■■■□□ 2.18
FAAP20-212ENST00000476803 MBD5Q9P267 1494 aa28.67■■■□□ 2.18
FAAP20-212ENST00000476803 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.66■■■□□ 2.18
FAAP20-212ENST00000476803 ATP7AQ04656 1500 aa28.64■■■□□ 2.18
FAAP20-212ENST00000476803 AGLP35573 1532 aa28.62■■■□□ 2.17
FAAP20-212ENST00000476803 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
FAAP20-212ENST00000476803 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.61■■■□□ 2.17
FAAP20-212ENST00000476803 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
FAAP20-212ENST00000476803 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.6■■■□□ 2.17
FAAP20-212ENST00000476803 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.58■■■□□ 2.17
FAAP20-212ENST00000476803 MIA2Q96PC5 1412 aa28.57■■■□□ 2.16
FAAP20-212ENST00000476803 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.56■■■□□ 2.16
FAAP20-212ENST00000476803 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.54■■■□□ 2.16
FAAP20-212ENST00000476803 A2MP01023 1474 aa28.53■■■□□ 2.16
FAAP20-212ENST00000476803 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.51■■■□□ 2.15
FAAP20-212ENST00000476803 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.51■■■□□ 2.15
FAAP20-212ENST00000476803 TSPY4P0CV99 314 aa28.49■■■□□ 2.15
FAAP20-212ENST00000476803 TSPY10P0CW01 314 aa28.49■■■□□ 2.15
FAAP20-212ENST00000476803 PLXNC1O60486 1568 aa28.49■■■□□ 2.15
FAAP20-212ENST00000476803 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
FAAP20-212ENST00000476803 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.44■■■□□ 2.14
FAAP20-212ENST00000476803 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
FAAP20-212ENST00000476803 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.42■■■□□ 2.14
FAAP20-212ENST00000476803 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
FAAP20-212ENST00000476803 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.4■■■□□ 2.14
FAAP20-212ENST00000476803 GGT6Q6P531 493 aa28.37■■■□□ 2.13
FAAP20-212ENST00000476803 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.37■■■□□ 2.13
FAAP20-212ENST00000476803 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.36■■■□□ 2.13
FAAP20-212ENST00000476803 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.36■■■□□ 2.13
FAAP20-212ENST00000476803 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-212ENST00000476803 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-212ENST00000476803 KIF3BO15066 747 aa28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-212ENST00000476803 ABCC5O15440 1437 aa28.3■■■□□ 2.12
FAAP20-212ENST00000476803 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-212ENST00000476803 ZMYM3Q14202 1370 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-212ENST00000476803 C3P01024 1663 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-212ENST00000476803 DAPK1P53355 1430 aa28.26■■■□□ 2.12
FAAP20-212ENST00000476803 MROH2AA6NES4 1674 aa28.26■■■□□ 2.12
FAAP20-212ENST00000476803 HSPA2P54652 639 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-212ENST00000476803 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-212ENST00000476803 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-212ENST00000476803 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-212ENST00000476803 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-212ENST00000476803 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-212ENST00000476803 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.2■■■□□ 2.11
FAAP20-212ENST00000476803 NPATQ14207 1427 aa28.2■■■□□ 2.11
FAAP20-212ENST00000476803 KIF15Q9NS87 1388 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-212ENST00000476803 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms