RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476301.5

NECTIN3-AS1-204, NECTIN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene NECTIN3-AS1, Length 568 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.88■■■□□ 2.21
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 HECW1Q76N89 1606 aa28.87■■■□□ 2.21
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.85■■■□□ 2.21
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.85■■■□□ 2.21
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 STRCQ7RTU9 1775 aa28.85■■■□□ 2.21
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.84■■■□□ 2.21
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.82■■■□□ 2.2
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ATP10AO60312 1499 aa28.79■■■□□ 2.2
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.77■■■□□ 2.2
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.75■■■□□ 2.19
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PTPRTO14522 1441 aa28.72■■■□□ 2.19
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PLCH2O75038 1416 aa28.69■■■□□ 2.18
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.68■■■□□ 2.18
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.67■■■□□ 2.18
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.63■■■□□ 2.17
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 AFAP1Q8N556 730 aa28.62■■■□□ 2.17
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.61■■■□□ 2.17
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.57■■■□□ 2.16
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.54■■■□□ 2.16
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 NCOA1Q15788 1441 aa28.52■■■□□ 2.16
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.52■■■□□ 2.16
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.51■■■□□ 2.15
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 C3P01024 1663 aa28.51■■■□□ 2.15
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.45■■■□□ 2.15
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.45■■■□□ 2.15
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 KDM5CP41229 1560 aa28.44■■■□□ 2.14
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.42■■■□□ 2.14
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.4■■■□□ 2.14
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.4■■■□□ 2.14
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 REREQ9P2R6 1566 aa28.38■■■□□ 2.13
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 KIF14Q15058 1648 aa28.37■■■□□ 2.13
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ABCA6Q8N139 1617 aa28.37■■■□□ 2.13
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.35■■■□□ 2.13
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 AGLP35573 1532 aa28.33■■■□□ 2.13
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 HSPA1LP34931 641 aa28.32■■■□□ 2.12
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.31■■■□□ 2.12
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 NPATQ14207 1427 aa28.27■■■□□ 2.12
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ZMYM3Q14202 1370 aa28.27■■■□□ 2.12
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PIP4K2BP78356 416 aa28.27■■■□□ 2.12
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PKD2Q13563 968 aa28.25■■■□□ 2.11
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.22■■■□□ 2.11
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CLIP1P30622 1438 aa28.21■■■□□ 2.11
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 FMN1Q68DA7 1419 aa28.21■■■□□ 2.11
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 EEA1Q15075 1411 aa28.2■■■□□ 2.11
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.19■■■□□ 2.1
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.18■■■□□ 2.1
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ABCC1P33527 1531 aa28.17■■■□□ 2.1
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PLA2R1Q13018 1463 aa28.16■■■□□ 2.1
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.16■■■□□ 2.1
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 TOM1O60784 492 aa28.13■■■□□ 2.09
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 MROH2AA6NES4 1674 aa28.12■■■□□ 2.09
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.1■■■□□ 2.09
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.1■■■□□ 2.09
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.09■■■□□ 2.09
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PTPRKQ15262 1439 aa28.09■■■□□ 2.09
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PREX2Q70Z35 1606 aa28.07■■■□□ 2.08
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 GGT6Q6P531 493 aa28.05■■■□□ 2.08
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.03■■■□□ 2.08
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.03■■■□□ 2.08
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.01■■■□□ 2.07
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.97■■■□□ 2.07
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CPS1P31327 1500 aa27.97■■■□□ 2.07
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.95■■■□□ 2.06
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 A2MP01023 1474 aa27.94■■■□□ 2.06
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.93■■■□□ 2.06
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.91■■■□□ 2.06
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ATP7AQ04656 1500 aa27.9■■■□□ 2.06
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PLXNC1O60486 1568 aa27.89■■■□□ 2.05
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.87■■■□□ 2.05
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ALKQ9UM73 1620 aa27.87■■■□□ 2.05
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.84■■■□□ 2.05
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.83■■■□□ 2.05
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.82■■■□□ 2.04
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.82■■■□□ 2.04
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 TNRQ92752 1358 aa27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.8 ms