RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476301.5

NECTIN3-AS1-204, NECTIN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene NECTIN3-AS1, Length 568 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.41■■■■■ 4.54
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NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.59■■■■□ 3.61
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 NACADO15069 1562 aa37.38■■■■□ 3.58
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NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.47■■■■□ 3.43
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.37■■■■□ 3.41
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.34■■■■□ 3.41
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.13■■■■□ 3.37
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NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SCRIBQ14160 1630 aa35.84■■■■□ 3.33
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NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ERCC6Q03468 1493 aa34.92■■■■□ 3.18
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NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 NESP48681 1621 aa34.44■■■■□ 3.1
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 TRIM41Q8WV44 630 aa34.44■■■■□ 3.1
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.38■■■■□ 3.09
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 HMGXB3Q12766 1538 aa34.16■■■■□ 3.06
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SMARCA2P51531 1590 aa34.15■■■■□ 3.06
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SMARCA4P51532 1647 aa34.03■■■■□ 3.04
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NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.9■■■■□ 3.02
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.83■■■■□ 3.01
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.81■■■■□ 3
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.65■■■□□ 2.98
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.56■■■□□ 2.96
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.54■■■□□ 2.96
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.49■■■□□ 2.95
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 OSCARQ8IYS5 282 aa33.49■■■□□ 2.95
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 WDR62O43379 1518 aa33.48■■■□□ 2.95
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.24■■■□□ 2.91
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.15■■■□□ 2.9
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NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.04■■■□□ 2.88
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.04■■■□□ 2.88
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 WIZO95785 1651 aa33.01■■■□□ 2.87
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NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CFTRP13569 1480 aa32.92■■■□□ 2.86
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NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 IFT140Q96RY7 1462 aa32.61■■■□□ 2.81
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NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CHD1O14646 1710 aa32.31■■■□□ 2.76
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NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SYNJ1O43426 1573 aa31.82■■■□□ 2.68
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.75■■■□□ 2.67
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NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SYNJ2O15056 1496 aa31.67■■■□□ 2.66
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 GRIN2BQ13224 1484 aa31.67■■■□□ 2.66
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 WDR97A6NE52 1622 aa31.62■■■□□ 2.65
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NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.23■■■□□ 2.59
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.22■■■□□ 2.59
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.2■■■□□ 2.59
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 NUP160Q12769 1436 aa31.19■■■□□ 2.58
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.16■■■□□ 2.58
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.15■■■□□ 2.58
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SHROOM2Q13796 1616 aa31.09■■■□□ 2.57
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ADAMTS12P58397 1594 aa31.07■■■□□ 2.56
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.01■■■□□ 2.56
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31■■■□□ 2.55
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.98■■■□□ 2.55
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 JPH4Q96JJ6 628 aa30.98■■■□□ 2.55
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