RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475527.1

PTPRG-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRG, Length 2,694 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-205ENST00000475527 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.34■■□□□ 1.97
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PTPRG-205ENST00000475527 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PTPRG-205ENST00000475527 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PTPRG-205ENST00000475527 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PTPRG-205ENST00000475527 ARHGEF11O15085 1522 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRG-205ENST00000475527 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRG-205ENST00000475527 NUDCQ9Y266 331 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRG-205ENST00000475527 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
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PTPRG-205ENST00000475527 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.23■■□□□ 1.95
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PTPRG-205ENST00000475527 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.19■■□□□ 1.94
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PTPRG-205ENST00000475527 NESP48681 1621 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRG-205ENST00000475527 MIA2Q96PC5 1412 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRG-205ENST00000475527 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.1■■□□□ 1.93
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PTPRG-205ENST00000475527 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.06■■□□□ 1.92
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PTPRG-205ENST00000475527 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PTPRG-205ENST00000475527 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27■■□□□ 1.91
PTPRG-205ENST00000475527 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27■■□□□ 1.91
PTPRG-205ENST00000475527 ABCC5O15440 1437 aa26.99■■□□□ 1.91
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PTPRG-205ENST00000475527 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
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PTPRG-205ENST00000475527 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PTPRG-205ENST00000475527 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRG-205ENST00000475527 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.82■■□□□ 1.88
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PTPRG-205ENST00000475527 USP35Q9P2H5 1018 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRG-205ENST00000475527 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.76■■□□□ 1.87
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PTPRG-205ENST00000475527 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.75■■□□□ 1.87
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PTPRG-205ENST00000475527 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.7■■□□□ 1.86
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PTPRG-205ENST00000475527 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRG-205ENST00000475527 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRG-205ENST00000475527 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRG-205ENST00000475527 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRG-205ENST00000475527 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PTPRG-205ENST00000475527 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRG-205ENST00000475527 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRG-205ENST00000475527 CRBNQ96SW2 442 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRG-205ENST00000475527 NUP155O75694 1391 aa26.6■■□□□ 1.85
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